221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2667 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  100 
 
 
320 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  43.44 
 
 
320 aa  253  3e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  29.1 
 
 
319 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  27.61 
 
 
347 aa  113  4.0000000000000004e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  25.96 
 
 
346 aa  111  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  31.75 
 
 
344 aa  109  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  33.18 
 
 
611 aa  106  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  34.13 
 
 
754 aa  104  2e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  27.74 
 
 
335 aa  102  7e-21  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  29.13 
 
 
344 aa  99.8  5e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  28.99 
 
 
345 aa  99.4  8e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  26.12 
 
 
343 aa  89.4  7e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  33.16 
 
 
339 aa  89  1e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  28.9 
 
 
339 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  31.61 
 
 
334 aa  87.8  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  28.44 
 
 
344 aa  86.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  27.7 
 
 
337 aa  85.9  8e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  30.74 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  29.73 
 
 
327 aa  82  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  23.97 
 
 
339 aa  82.4  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  26.42 
 
 
334 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
340 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  27.55 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  27.13 
 
 
336 aa  79.7  0.00000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  31.42 
 
 
619 aa  79.3  0.00000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  27.4 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  27.05 
 
 
344 aa  77  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 
319 aa  77.4  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  28.32 
 
 
595 aa  76.6  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 
318 aa  75.5  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  22.84 
 
 
334 aa  75.5  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  27.98 
 
 
337 aa  75.5  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  26.83 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  26.98 
 
 
544 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  25.58 
 
 
332 aa  73.2  0.000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 
701 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.27 
 
 
517 aa  72.8  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  25.64 
 
 
336 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 
647 aa  71.6  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  25.88 
 
 
601 aa  72  0.00000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  27.16 
 
 
337 aa  72  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  30.24 
 
 
646 aa  71.6  0.00000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 
333 aa  71.6  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  29.22 
 
 
653 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  28.06 
 
 
329 aa  70.5  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  30 
 
 
319 aa  70.9  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  28.17 
 
 
607 aa  70.1  0.00000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  27.87 
 
 
667 aa  70.1  0.00000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1778  von Willebrand factor type A  28.26 
 
 
328 aa  69.7  0.00000000007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.357635  normal  0.258709 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  29.33 
 
 
321 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  25.98 
 
 
530 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.33 
 
 
599 aa  67.8  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.25 
 
 
359 aa  68.2  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  26.89 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
471 aa  66.2  0.0000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  27.11 
 
 
341 aa  66.2  0.0000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  26.72 
 
 
691 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  27.27 
 
 
318 aa  66.2  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  30.14 
 
 
319 aa  65.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  25.83 
 
 
377 aa  65.5  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  26.86 
 
 
328 aa  65.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  29.44 
 
 
319 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1948  von Willebrand factor, type A  28.5 
 
 
339 aa  64.7  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  26.32 
 
 
564 aa  64.3  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  28.64 
 
 
331 aa  63.9  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  28.08 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.83 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2127  von Willebrand factor type A  26.79 
 
 
317 aa  63.5  0.000000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000421408 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  25.39 
 
 
338 aa  63.2  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1952  von Willebrand factor type A  30.69 
 
 
315 aa  62.8  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.159987  hitchhiker  0.00398429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5503  von Willebrand factor, type A  27.66 
 
 
315 aa  62.4  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0866133  normal  0.0446961 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  25.91 
 
 
589 aa  62.4  0.000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  31.97 
 
 
344 aa  62.4  0.000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  30.08 
 
 
328 aa  62.4  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1678  von Willebrand factor, type A  31.61 
 
 
315 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.773902  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  25.82 
 
 
327 aa  61.6  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  26.25 
 
 
373 aa  61.6  0.00000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 
533 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  27.33 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  27.33 
 
 
338 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  29.48 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  24.61 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2430  von Willebrand factor, type A  27.39 
 
 
339 aa  61.6  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0141267 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  29.38 
 
 
330 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  28.16 
 
 
339 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  25 
 
 
651 aa  60.8  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0187  von Willebrand factor type A  29 
 
 
339 aa  60.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  24.61 
 
 
340 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  24 
 
 
349 aa  60.5  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  24.22 
 
 
339 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  24.22 
 
 
340 aa  60.1  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  27.83 
 
 
334 aa  60.1  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  24.32 
 
 
338 aa  60.1  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
693 aa  60.1  0.00000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  27.19 
 
 
644 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
315 aa  60.1  0.00000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  24.39 
 
 
612 aa  59.7  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  26.92 
 
 
330 aa  59.7  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  27.71 
 
 
352 aa  59.3  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>