217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0052 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 589 aa  1112    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  29.57 
 
 		 651 aa  153  8.999999999999999e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 		 701 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  28.98 
 
 		 607 aa  107  9e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  27.86 
 
 		 344 aa  99.8  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.82 
 
 		 517 aa  99.8  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  22.44 
 
 		 595 aa  95.1  3e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  25.88 
 
 		 345 aa  92.8  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  29.81 
 
 		 679 aa  91.7  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 693 aa  91.7  4e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 		 522 aa  91.3  5e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  30.93 
 
 		 647 aa  90.9  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 612 aa  90.9  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  28.85 
 
 		 339 aa  90.1  1e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  23.75 
 
 		 619 aa  89.7  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0188  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.98 
 
 		 652 aa  89.4  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.489621  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  30.69 
 
 		 611 aa  88.6  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  26.95 
 
 		 347 aa  88.2  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 663 aa  87.8  5e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  21.63 
 
 		 346 aa  87.8  5e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  29.58 
 
 		 690 aa  87  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.77 
 
 		 692 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  24.82 
 
 		 658 aa  86.7  0.000000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  28.7 
 
 		 701 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 653 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  33.83 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  38.6 
 
 		 315 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  22.37 
 
 		 471 aa  84.7  0.000000000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 690 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  30.18 
 
 		 667 aa  84  0.000000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  30.52 
 
 		 692 aa  84  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 681 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  28.21 
 
 		 687 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  29.05 
 
 		 339 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  23.69 
 
 		 664 aa  81.6  0.00000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 650 aa  80.9  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  31.9 
 
 		 344 aa  80.1  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  30.69 
 
 		 334 aa  80.1  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 644 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  24.54 
 
 		 576 aa  80.1  0.0000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  27.18 
 
 		 320 aa  78.6  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  31.9 
 
 		 344 aa  78.6  0.0000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  32.94 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  33.86 
 
 		 577 aa  77  0.0000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  33.93 
 
 		 693 aa  77  0.000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  23.83 
 
 		 344 aa  76.6  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  24.94 
 
 		 646 aa  76.6  0.000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  29.09 
 
 		 530 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 691 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  26.3 
 
 		 335 aa  76.3  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  22.66 
 
 		 657 aa  76.3  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  31.54 
 
 		 343 aa  75.5  0.000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  32.83 
 
 		 336 aa  75.1  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  28.47 
 
 		 337 aa  74.7  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  37.19 
 
 		 318 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  29.04 
 
 		 579 aa  73.9  0.000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  31.08 
 
 		 329 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  28.73 
 
 		 318 aa  72.8  0.00000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  23.66 
 
 		 587 aa  72.4  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  28.77 
 
 		 321 aa  71.6  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  27.54 
 
 		 533 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  31.22 
 
 		 572 aa  71.2  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  22.72 
 
 		 601 aa  70.9  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  21.28 
 
 		 338 aa  70.9  0.00000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  25.16 
 
 		 332 aa  70.5  0.00000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  32.72 
 
 		 339 aa  70.5  0.00000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  32.8 
 
 		 588 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  26.9 
 
 		 544 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  21.11 
 
 		 319 aa  68.6  0.0000000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  28.72 
 
 		 338 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  22.89 
 
 		 320 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  32.2 
 
 		 612 aa  68.2  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  27.82 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  29.32 
 
 		 339 aa  67.8  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  29.18 
 
 		 349 aa  67.8  0.0000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  28.01 
 
 		 338 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  30.16 
 
 		 572 aa  67.8  0.0000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  27.08 
 
 		 339 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  25.54 
 
 		 320 aa  67.4  0.0000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.3 
 
 		 338 aa  67  0.0000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 		 339 aa  67  0.0000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  29.72 
 
 		 690 aa  66.2  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  29.1 
 
 		 572 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 		 340 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  27.8 
 
 		 340 aa  66.6  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.74 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.75 
 
 		 359 aa  66.2  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05144  hypothetical protein  27.56 
 
 		 334 aa  66.2  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  26.6 
 
 		 337 aa  65.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  30.74 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  24.22 
 
 		 599 aa  65.9  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  28.63 
 
 		 339 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3659  hypothetical protein  26.47 
 
 		 335 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.542398  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3085  batB protein, putative  28.04 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  27.02 
 
 		 334 aa  65.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25.8 
 
 		 328 aa  65.5  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  30.54 
 
 		 586 aa  65.1  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  30.3 
 
 		 358 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  26.24 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>