227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2291 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  100 
 
 
340 aa  669    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  51.9 
 
 
343 aa  320  3e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  52.05 
 
 
337 aa  295  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  42.73 
 
 
339 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  39.39 
 
 
334 aa  197  3e-49  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  39.18 
 
 
336 aa  150  3e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  27.3 
 
 
335 aa  138  2e-31  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  31.23 
 
 
345 aa  131  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  29.56 
 
 
346 aa  129  7.000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  31.74 
 
 
347 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  31.61 
 
 
339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  28.95 
 
 
344 aa  124  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  37.5 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  27.86 
 
 
595 aa  110  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  28.16 
 
 
320 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  27.95 
 
 
344 aa  109  7.000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  39.22 
 
 
315 aa  102  8e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  37.93 
 
 
318 aa  98.2  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.96 
 
 
611 aa  96.7  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  28.46 
 
 
336 aa  95.9  9e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  28.34 
 
 
332 aa  95.5  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  30.08 
 
 
337 aa  91.3  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  29.57 
 
 
319 aa  90.1  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  33.48 
 
 
344 aa  89.7  7e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  27.65 
 
 
334 aa  89.7  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2319  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 
331 aa  88.6  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  28.53 
 
 
327 aa  87.4  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.62 
 
 
599 aa  87.4  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  27.57 
 
 
333 aa  87  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  24.47 
 
 
338 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  25.25 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  26.54 
 
 
339 aa  84  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  34.1 
 
 
359 aa  82.4  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
320 aa  81.6  0.00000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  28.2 
 
 
337 aa  81.6  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  30.52 
 
 
601 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  26.97 
 
 
329 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  32.97 
 
 
327 aa  79.7  0.00000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  28.4 
 
 
658 aa  79.7  0.00000000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  26 
 
 
336 aa  75.5  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1624  von Willebrand factor, type A  29.56 
 
 
330 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000050495 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3116  von Willebrand factor type A domain protein  30.19 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0524018  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  26.34 
 
 
754 aa  75.5  0.000000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  26.18 
 
 
344 aa  73.9  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  25.18 
 
 
373 aa  73.9  0.000000000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  24.9 
 
 
651 aa  73.6  0.000000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  31.16 
 
 
571 aa  72.8  0.000000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 
572 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4532  hypothetical protein  27.22 
 
 
334 aa  72  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.143586 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
572 aa  72.4  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  26.88 
 
 
344 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  27.36 
 
 
330 aa  72  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  25.3 
 
 
328 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  22.22 
 
 
351 aa  71.6  0.00000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 
701 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3801  von Willebrand factor type A  26.67 
 
 
334 aa  70.5  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.142641  normal  0.822741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  27.18 
 
 
647 aa  70.5  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  30.24 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  30.67 
 
 
319 aa  70.1  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  27.78 
 
 
338 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2206  BatA  23.81 
 
 
317 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0553658  normal  0.0945164 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  32.48 
 
 
319 aa  69.3  0.00000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  24.91 
 
 
322 aa  68.9  0.0000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3031  von Willebrand factor type A  28.15 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239159  normal  0.0768499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  31.76 
 
 
319 aa  68.9  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  27.24 
 
 
339 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2469  von Willebrand factor type A  33.17 
 
 
325 aa  68.2  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.597694 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0457  hypothetical protein  25.97 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.367166  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1525  von Willebrand factor, type A  29.21 
 
 
330 aa  68.6  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  26.28 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 
612 aa  68.2  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2603  von Willebrand factor type A  27.72 
 
 
336 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  29.71 
 
 
349 aa  67.4  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 
340 aa  67  0.0000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2634  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 
313 aa  67.4  0.0000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  31.05 
 
 
533 aa  66.6  0.0000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  29.79 
 
 
321 aa  66.6  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  26.87 
 
 
343 aa  66.6  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2681  von Willebrand factor, type A  29.55 
 
 
334 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 
339 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 
339 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  29.84 
 
 
331 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  26.67 
 
 
338 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  25.21 
 
 
344 aa  66.2  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  26.91 
 
 
340 aa  65.9  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  31.28 
 
 
319 aa  65.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1744  BatB protein, putative  28.8 
 
 
341 aa  65.5  0.000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 
657 aa  65.9  0.000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  24.31 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  26.84 
 
 
338 aa  65.1  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  30.09 
 
 
607 aa  64.7  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  25.83 
 
 
318 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  28.43 
 
 
646 aa  64.7  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2300  hypothetical protein  26.04 
 
 
320 aa  64.3  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00522588  hitchhiker  0.00113064 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  28.51 
 
 
356 aa  63.9  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2172  von Willebrand factor type A domain-containing protein  26.37 
 
 
327 aa  63.5  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0626942 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2888  von Willebrand factor, type A  23.91 
 
 
340 aa  63.5  0.000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2396  von Willebrand factor type A  27.82 
 
 
377 aa  63.5  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.939741  normal  0.854107 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.14 
 
 
576 aa  63.5  0.000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  24.73 
 
 
619 aa  63.2  0.000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>