202 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_05143 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  77.2 
 
 		 599 aa  770    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  100 
 
 		 601 aa  1209    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  44.17 
 
 		 646 aa  386  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  45.21 
 
 		 619 aa  365  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  33.03 
 
 		 644 aa  318  1e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  33.23 
 
 		 650 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  39.29 
 
 		 679 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  33.44 
 
 		 647 aa  306  6e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  33.49 
 
 		 657 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 701 aa  299  1e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  32.93 
 
 		 690 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.43 
 
 		 692 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 		 692 aa  283  8.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  33.39 
 
 		 663 aa  282  2e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  39.91 
 
 		 690 aa  279  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 693 aa  276  9e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  39.86 
 
 		 681 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  39.86 
 
 		 687 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 693 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  34.72 
 
 		 701 aa  261  2e-68  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  33.82 
 
 		 658 aa  260  5.0000000000000005e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 653 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  36.92 
 
 		 691 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  31.66 
 
 		 664 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  31.61 
 
 		 690 aa  243  9e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  33.13 
 
 		 667 aa  237  4e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  31.35 
 
 		 587 aa  227  5.0000000000000005e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  31.35 
 
 		 579 aa  219  1e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  30.9 
 
 		 612 aa  201  3.9999999999999996e-50  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  33.08 
 
 		 588 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  33.84 
 
 		 577 aa  194  5e-48  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  31.9 
 
 		 572 aa  193  6e-48  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  33.33 
 
 		 572 aa  193  8e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  31.67 
 
 		 572 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 		 571 aa  190  8e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 522 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  32.75 
 
 		 572 aa  187  6e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  29.48 
 
 		 607 aa  187  7e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  31.79 
 
 		 578 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  32.94 
 
 		 586 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  26.88 
 
 		 544 aa  179  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  31.54 
 
 		 572 aa  173  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.1 
 
 		 517 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  31.65 
 
 		 585 aa  170  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  28.95 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  29.76 
 
 		 530 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  28.46 
 
 		 531 aa  161  4e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  30.6 
 
 		 612 aa  161  4e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 		 680 aa  147  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  25.94 
 
 		 595 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  27.68 
 
 		 576 aa  140  4.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  26.85 
 
 		 503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.44 
 
 		 611 aa  125  2e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  36.5 
 
 		 310 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  36.5 
 
 		 310 aa  125  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  26.56 
 
 		 573 aa  117  6e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  26.56 
 
 		 573 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  24.58 
 
 		 564 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  31.42 
 
 		 345 aa  110  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  26.01 
 
 		 573 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  20.58 
 
 		 471 aa  96.7  1e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  30.38 
 
 		 334 aa  95.5  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  33.02 
 
 		 339 aa  95.1  3e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  24.81 
 
 		 344 aa  93.6  1e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  26.13 
 
 		 346 aa  92  3e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  29.35 
 
 		 754 aa  91.7  4e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  29.41 
 
 		 347 aa  91.7  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  28.78 
 
 		 344 aa  90.5  7e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  26.35 
 
 		 335 aa  90.9  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  29.22 
 
 		 339 aa  87  9e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  25.31 
 
 		 320 aa  85.5  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.79 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  27.76 
 
 		 338 aa  81.3  0.00000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  31.29 
 
 		 304 aa  81.3  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  25.12 
 
 		 651 aa  80.1  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  27.18 
 
 		 332 aa  79.3  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  27.04 
 
 		 343 aa  79  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  30.91 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  27.78 
 
 		 315 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  30.95 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  25.63 
 
 		 334 aa  71.6  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  27.1 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  27.92 
 
 		 339 aa  69.3  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  24.58 
 
 		 336 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  26.42 
 
 		 327 aa  68.2  0.0000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  30.56 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  27.36 
 
 		 339 aa  67  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  25.88 
 
 		 320 aa  67  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  24.53 
 
 		 337 aa  66.2  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  25.79 
 
 		 337 aa  65.1  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  29.26 
 
 		 319 aa  63.5  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  31.21 
 
 		 322 aa  63.2  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  25.73 
 
 		 334 aa  63.5  0.00000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 328 aa  62.8  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  31.19 
 
 		 319 aa  62.4  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  28.22 
 
 		 318 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  32.79 
 
 		 293 aa  62  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  26.23 
 
 		 589 aa  61.6  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  30.71 
 
 		 278 aa  61.2  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  28.35 
 
 		 351 aa  60.8  0.00000007  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>