195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1743 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  100 
 
 		 658 aa  1340    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  36.01 
 
 		 644 aa  350  5e-95  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  36.64 
 
 		 647 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  37.25 
 
 		 657 aa  340  4e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  35.59 
 
 		 650 aa  324  4e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  33.43 
 
 		 701 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  36.12 
 
 		 679 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  36.23 
 
 		 691 aa  302  1e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  35.14 
 
 		 663 aa  295  1e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  33.29 
 
 		 667 aa  291  2e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  35.23 
 
 		 690 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  32.91 
 
 		 701 aa  283  6.000000000000001e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  30.23 
 
 		 664 aa  280  8e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  34.61 
 
 		 579 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  40.62 
 
 		 690 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 692 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 653 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.97 
 
 		 692 aa  273  8.000000000000001e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 		 612 aa  273  8.000000000000001e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  33.58 
 
 		 690 aa  271  4e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  40.09 
 
 		 681 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  40.09 
 
 		 687 aa  267  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  33.58 
 
 		 693 aa  263  6.999999999999999e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 522 aa  258  3e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  32.27 
 
 		 693 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  31.18 
 
 		 607 aa  251  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  31.8 
 
 		 646 aa  249  9e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 		 586 aa  242  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  31.43 
 
 		 572 aa  240  5e-62  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  34.66 
 
 		 599 aa  233  7.000000000000001e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  35.58 
 
 		 530 aa  230  5e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 588 aa  230  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  34.73 
 
 		 601 aa  230  5e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  30.39 
 
 		 572 aa  228  2e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  32.96 
 
 		 619 aa  222  1.9999999999999999e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  28.42 
 
 		 544 aa  221  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  29.47 
 
 		 585 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  31.44 
 
 		 572 aa  221  5e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  31.83 
 
 		 533 aa  220  6e-56  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  31.39 
 
 		 572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 571 aa  217  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  34.53 
 
 		 577 aa  209  1e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  31.01 
 
 		 531 aa  209  2e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.93 
 
 		 517 aa  206  9e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  33.04 
 
 		 680 aa  205  2e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  28.41 
 
 		 572 aa  202  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  29.2 
 
 		 612 aa  201  1.9999999999999998e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  28.68 
 
 		 578 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  28.91 
 
 		 503 aa  196  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 587 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.65 
 
 		 576 aa  192  2e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  28.86 
 
 		 573 aa  150  5e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  39.49 
 
 		 310 aa  147  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  28.7 
 
 		 573 aa  147  7.0000000000000006e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  28.86 
 
 		 573 aa  146  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  38.46 
 
 		 310 aa  144  6e-33  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  25.6 
 
 		 564 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  26.38 
 
 		 595 aa  133  1.0000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  30.3 
 
 		 304 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  23.77 
 
 		 471 aa  109  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  32.84 
 
 		 611 aa  100  6e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  27.63 
 
 		 335 aa  99.8  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  27.95 
 
 		 344 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  26.35 
 
 		 651 aa  99  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  30.4 
 
 		 347 aa  97.1  1e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  43.1 
 
 		 293 aa  96.3  2e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  43.1 
 
 		 278 aa  93.2  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  29.01 
 
 		 339 aa  92.4  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  30.27 
 
 		 339 aa  90.9  6e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  32.5 
 
 		 338 aa  90.9  7e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  27.47 
 
 		 344 aa  90.1  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  33.89 
 
 		 345 aa  88.2  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  26.83 
 
 		 344 aa  86.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  28 
 
 		 340 aa  78.2  0.0000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  24.65 
 
 		 346 aa  77  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  29.63 
 
 		 220 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  25.31 
 
 		 320 aa  73.6  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  26.91 
 
 		 337 aa  73.6  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 		 343 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  29.97 
 
 		 334 aa  72.8  0.00000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 		 337 aa  72  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  30.96 
 
 		 299 aa  71.6  0.00000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  28.7 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  34.03 
 
 		 332 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  30.28 
 
 		 339 aa  69.7  0.0000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  28.44 
 
 		 315 aa  69.7  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  27.27 
 
 		 334 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  26.69 
 
 		 336 aa  69.7  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.19 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  23.79 
 
 		 306 aa  67  0.0000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  26.18 
 
 		 589 aa  65.5  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.44 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  24.44 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  28.44 
 
 		 349 aa  63.9  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  34.88 
 
 		 333 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  25.47 
 
 		 319 aa  62.8  0.00000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  24.68 
 
 		 754 aa  62.4  0.00000003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  28.1 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  35.2 
 
 		 351 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  32.41 
 
 		 339 aa  59.7  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>