68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0827 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 312 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  98.4 
 
 		 312 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  90.06 
 
 		 312 aa  532  1e-150  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  78.26 
 
 		 306 aa  384  1e-105  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  57.25 
 
 		 298 aa  263  3e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  56.49 
 
 		 301 aa  240  2e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.77 
 
 		 273 aa  142  7e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  32.24 
 
 		 572 aa  85.9  7e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 612 aa  81.6  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  30.8 
 
 		 588 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  31.3 
 
 		 572 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 664 aa  75.9  0.0000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  30.33 
 
 		 577 aa  74.7  0.000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  31.43 
 
 		 572 aa  73.9  0.000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 572 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 		 572 aa  72.8  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0461  hypothetical protein  29.41 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 571 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  42.22 
 
 		 278 aa  67.8  0.0000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  27.82 
 
 		 607 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  28.57 
 
 		 579 aa  67.4  0.0000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  43.68 
 
 		 293 aa  67  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  41.24 
 
 		 578 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  43.69 
 
 		 220 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 644 aa  65.1  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  40.24 
 
 		 667 aa  62.4  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  26 
 
 		 587 aa  61.2  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  40.7 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  39.76 
 
 		 693 aa  59.3  0.00000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  25.29 
 
 		 647 aa  58.9  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  42.31 
 
 		 619 aa  58.5  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  38.24 
 
 		 530 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  40.96 
 
 		 663 aa  58.2  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  27.55 
 
 		 585 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  39.57 
 
 		 680 aa  56.2  0.0000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  34.52 
 
 		 701 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  36.46 
 
 		 531 aa  55.1  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  39.29 
 
 		 679 aa  53.5  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 687 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 681 aa  52.8  0.000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  35.37 
 
 		 599 aa  52  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  17.33 
 
 		 657 aa  52  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  40.74 
 
 		 690 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4013  hypothetical protein  35.85 
 
 		 198 aa  50.4  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 		 653 aa  50.1  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1130  hypothetical protein  36.84 
 
 		 203 aa  49.7  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489621  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  34.04 
 
 		 601 aa  48.9  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.04 
 
 		 517 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  35.62 
 
 		 690 aa  48.5  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  34.95 
 
 		 544 aa  47.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3281  hypothetical protein  48.78 
 
 		 198 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.116552  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 522 aa  47.8  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  35.37 
 
 		 646 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  36.08 
 
 		 691 aa  47  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  50 
 
 		 586 aa  46.6  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  47.27 
 
 		 612 aa  45.8  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1146  hypothetical protein  40.7 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  40.48 
 
 		 701 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  36.84 
 
 		 595 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 693 aa  43.5  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.84 
 
 		 692 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  30.61 
 
 		 543 aa  43.9  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  36.84 
 
 		 692 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  39.34 
 
 		 690 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2383  TPR repeat-containing protein  33.75 
 
 		 1421 aa  43.1  0.006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.823331 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 4079 aa  43.1  0.006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  32.05 
 
 		 4489 aa  42.7  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  28.97 
 
 		 471 aa  42.7  0.008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>