228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_2395 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 611 aa  1206    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  33.91 
 
 		 345 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  32.08 
 
 		 346 aa  150  8e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  30.89 
 
 		 344 aa  136  9.999999999999999e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  39.21 
 
 		 339 aa  133  9e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  29.97 
 
 		 344 aa  133  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1777  von Willebrand factor type A  35.02 
 
 		 754 aa  131  3e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.264323 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  30.25 
 
 		 347 aa  130  9.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  30.46 
 
 		 595 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  34.94 
 
 		 335 aa  129  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  35.75 
 
 		 339 aa  127  8.000000000000001e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  30.51 
 
 		 601 aa  127  8.000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  34.51 
 
 		 337 aa  120  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  28.83 
 
 		 657 aa  120  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  33.56 
 
 		 344 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  29.82 
 
 		 599 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  30.77 
 
 		 647 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  35.07 
 
 		 315 aa  115  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  32.16 
 
 		 571 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  31.8 
 
 		 572 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  33.48 
 
 		 690 aa  114  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  31.8 
 
 		 572 aa  114  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 		 320 aa  113  8.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  31.4 
 
 		 646 aa  113  9e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  31.15 
 
 		 667 aa  113  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  31.06 
 
 		 679 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 		 338 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  35.19 
 
 		 318 aa  109  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  30.1 
 
 		 343 aa  108  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  28.14 
 
 		 587 aa  107  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.6 
 
 		 517 aa  107  6e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  33.8 
 
 		 572 aa  107  6e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  30.27 
 
 		 337 aa  107  6e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 701 aa  107  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  31.16 
 
 		 578 aa  105  2e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2667  von Willebrand factor type A  33.18 
 
 		 320 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0137073  normal  0.240647 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  31.48 
 
 		 607 aa  105  3e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  31.16 
 
 		 585 aa  105  4e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 693 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 692 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 644 aa  104  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 690 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.47 
 
 		 692 aa  103  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  30.05 
 
 		 586 aa  103  7e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  29.96 
 
 		 619 aa  103  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  32.84 
 
 		 658 aa  101  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  34.18 
 
 		 588 aa  100  7e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  33.45 
 
 		 579 aa  99.8  1e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  30.92 
 
 		 544 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  32.83 
 
 		 577 aa  99.4  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 681 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 687 aa  98.2  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  27.78 
 
 		 351 aa  97.4  6e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 650 aa  97.1  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  30.87 
 
 		 690 aa  97.1  8e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  31.17 
 
 		 663 aa  97.1  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  31.16 
 
 		 572 aa  97.1  9e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  31.84 
 
 		 522 aa  95.5  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  29.44 
 
 		 572 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  29.17 
 
 		 340 aa  95.1  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  27.88 
 
 		 334 aa  95.1  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  31.33 
 
 		 612 aa  95.5  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  33.22 
 
 		 329 aa  94.7  4e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  30.29 
 
 		 651 aa  94.4  6e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 664 aa  94  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 653 aa  94  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  26.69 
 
 		 471 aa  94  7e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 693 aa  94  8e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  29.31 
 
 		 612 aa  93.2  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  31.68 
 
 		 530 aa  92.4  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  32.17 
 
 		 691 aa  91.3  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  29.77 
 
 		 533 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  31.38 
 
 		 327 aa  88.6  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  30.69 
 
 		 589 aa  89  3e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  29.61 
 
 		 319 aa  89  3e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 		 339 aa  87.4  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  28.35 
 
 		 330 aa  87  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  29.23 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2765  von Willebrand factor type A  30.9 
 
 		 339 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.644793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  25.93 
 
 		 334 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  31.67 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2785  von Willebrand factor type A  30.9 
 
 		 340 aa  84.7  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  28.32 
 
 		 332 aa  84.7  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2860  von Willebrand factor type A  30.56 
 
 		 339 aa  84  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.140424  normal  0.0110983 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1593  von Willebrand factor type A  30.9 
 
 		 340 aa  84  0.000000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000650656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  30.64 
 
 		 358 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  28.93 
 
 		 701 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2464  von Willebrand factor, type A  30.96 
 
 		 339 aa  83.6  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  30.64 
 
 		 358 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1811  von Willebrand factor type A  30.13 
 
 		 331 aa  82.8  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1403  von Willebrand factor, type A  30.6 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.520734  hitchhiker  0.0000232326 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1468  von Willebrand factor, type A  30.45 
 
 		 338 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00210714 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1456  von Willebrand factor, type A  30.77 
 
 		 338 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000144994 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3093  von Willebrand factor type A domain-containing protein  29.25 
 
 		 338 aa  82  0.00000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  25.48 
 
 		 336 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1220  von Willebrand factor, type A  28.3 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.356622  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  33.74 
 
 		 327 aa  81.3  0.00000000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0852  von Willebrand factor type A  30.99 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.591496  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2439  von Willebrand factor type A  30.54 
 
 		 331 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1659  von Willebrand factor, type A  31.21 
 
 		 343 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>