135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1732 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 587 aa  1191    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  28.55 
 
 		 644 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 664 aa  233  1e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  35.9 
 
 		 599 aa  220  7e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  28.68 
 
 		 647 aa  219  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 650 aa  218  2e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  32.96 
 
 		 601 aa  213  7e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  28.29 
 
 		 657 aa  213  1e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 701 aa  210  5e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  32.6 
 
 		 701 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  28.81 
 
 		 658 aa  197  4.0000000000000005e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 612 aa  197  4.0000000000000005e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  27.47 
 
 		 572 aa  197  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 572 aa  196  9e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  29.51 
 
 		 572 aa  193  6e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 579 aa  193  8e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  30.53 
 
 		 679 aa  193  8e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  28.61 
 
 		 663 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  27 
 
 		 571 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  32.45 
 
 		 619 aa  191  2.9999999999999997e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  32.58 
 
 		 693 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 653 aa  189  2e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  29.61 
 
 		 572 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 690 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  27.93 
 
 		 690 aa  183  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  31.79 
 
 		 646 aa  181  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  26.7 
 
 		 522 aa  180  4.999999999999999e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 572 aa  180  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  25.47 
 
 		 607 aa  179  1e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  29.79 
 
 		 693 aa  179  2e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.81 
 
 		 692 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 692 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  29.74 
 
 		 690 aa  174  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  28.24 
 
 		 586 aa  172  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 681 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  30.4 
 
 		 687 aa  171  4e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  27.45 
 
 		 588 aa  171  4e-41  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  31.08 
 
 		 691 aa  169  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  27.9 
 
 		 578 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  27.61 
 
 		 585 aa  162  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  26.17 
 
 		 577 aa  160  6e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  25.71 
 
 		 667 aa  157  5.0000000000000005e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 533 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  26.46 
 
 		 530 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  23.97 
 
 		 544 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  22.6 
 
 		 612 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.65 
 
 		 517 aa  136  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  24.21 
 
 		 531 aa  131  4.0000000000000003e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  24.65 
 
 		 680 aa  122  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  24.14 
 
 		 503 aa  113  8.000000000000001e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  25.12 
 
 		 595 aa  110  5e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  24.68 
 
 		 576 aa  110  6e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  28.14 
 
 		 611 aa  107  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  24.24 
 
 		 651 aa  99.8  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  22.42 
 
 		 471 aa  99.4  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  31.15 
 
 		 310 aa  92.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  22.34 
 
 		 564 aa  92.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  31.15 
 
 		 310 aa  92  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  25.3 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 298 aa  73.2  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  23.96 
 
 		 339 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  27.43 
 
 		 333 aa  70.5  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  24.86 
 
 		 573 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  22.87 
 
 		 573 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  23.15 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26 
 
 		 312 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  25.6 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 312 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  25 
 
 		 339 aa  65.5  0.000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  23.91 
 
 		 589 aa  64.7  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  25.35 
 
 		 573 aa  63.9  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  24.32 
 
 		 344 aa  63.9  0.000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  23.43 
 
 		 301 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0243  von Willebrand factor type A  24.47 
 
 		 343 aa  62.8  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0131225  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  29.05 
 
 		 322 aa  60.1  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  29.2 
 
 		 339 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  35.19 
 
 		 293 aa  59.3  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 		 273 aa  59.3  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  24.18 
 
 		 347 aa  59.7  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 306 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2291  von Willebrand factor type A  25.66 
 
 		 340 aa  59.3  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  22.89 
 
 		 320 aa  59.3  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  26.28 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  22.99 
 
 		 346 aa  58.2  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 		 320 aa  57.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1247  von Willebrand factor, type A  25.82 
 
 		 319 aa  57  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.513072 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1137  von Willebrand factor type A  25.58 
 
 		 319 aa  56.6  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.178204  hitchhiker  0.0000350269 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1797  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 		 315 aa  56.2  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.152806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  27.89 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  24.71 
 
 		 334 aa  55.1  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  25.27 
 
 		 304 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  24.79 
 
 		 332 aa  54.7  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  25.56 
 
 		 334 aa  54.7  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  27.33 
 
 		 333 aa  54.7  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1384  von Willebrand factor, type A  30.16 
 
 		 319 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.410804  hitchhiker  0.00717595 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5131  von Willebrand factor type A  29.79 
 
 		 319 aa  53.5  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.210447  normal  0.0623627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4304  von Willebrand factor type A  24.63 
 
 		 309 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.0946838 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  28.57 
 
 		 327 aa  52.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  23.47 
 
 		 329 aa  52  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1123  von Willebrand factor type A  25.96 
 
 		 373 aa  52  0.00003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>