67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1009 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 301 aa  578  1e-164  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  87.74 
 
 		 298 aa  449  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.46 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  56.6 
 
 		 312 aa  259  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  56.6 
 
 		 312 aa  259  4e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  57.96 
 
 		 306 aa  225  8e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  39.47 
 
 		 273 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 		 612 aa  103  3e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  33.06 
 
 		 572 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  33.47 
 
 		 572 aa  88.2  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  33.61 
 
 		 572 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  26.17 
 
 		 664 aa  87.4  3e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0461  hypothetical protein  31.91 
 
 		 224 aa  86.3  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 572 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  34.69 
 
 		 572 aa  85.5  9e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  31.67 
 
 		 579 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 571 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 588 aa  80.1  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  33.33 
 
 		 577 aa  78.6  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  27.89 
 
 		 578 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  27.61 
 
 		 647 aa  76.3  0.0000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  42.86 
 
 		 667 aa  69.3  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  40.15 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  24.48 
 
 		 587 aa  67  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  33.33 
 
 		 531 aa  63.2  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  47.83 
 
 		 293 aa  62.8  0.000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1130  hypothetical protein  28.99 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.489621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  18.79 
 
 		 657 aa  60.5  0.00000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  29.86 
 
 		 644 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  38.55 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4013  hypothetical protein  36.43 
 
 		 198 aa  58.5  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.573909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  34.07 
 
 		 619 aa  58.9  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  40.86 
 
 		 530 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  39.24 
 
 		 646 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  32.48 
 
 		 585 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 650 aa  56.2  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  38.16 
 
 		 653 aa  56.2  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  27.18 
 
 		 607 aa  55.5  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  40 
 
 		 517 aa  54.7  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  39.06 
 
 		 690 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  29.39 
 
 		 586 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 693 aa  53.9  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  37.97 
 
 		 522 aa  53.5  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 701 aa  53.1  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  40 
 
 		 544 aa  52.4  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 687 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  35.8 
 
 		 681 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  34.15 
 
 		 679 aa  51.6  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  32.26 
 
 		 601 aa  51.2  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  34.01 
 
 		 680 aa  51.2  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  30.69 
 
 		 690 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  32.26 
 
 		 599 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2807  tetratricopeptide TPR_2  33.91 
 
 		 576 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.233123 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  34.21 
 
 		 692 aa  48.9  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  33.62 
 
 		 690 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  38.6 
 
 		 691 aa  46.6  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.46 
 
 		 692 aa  46.6  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  35.53 
 
 		 693 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1138 aa  45.4  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0965  tol-pal system protein YbgF  41.1 
 
 		 487 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.666424  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  37.5 
 
 		 701 aa  45.1  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1852  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 318 aa  45.1  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.776683 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3281  hypothetical protein  35.9 
 
 		 198 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.116552  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  27.5 
 
 		 658 aa  43.5  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  41.79 
 
 		 1450 aa  43.1  0.006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  33.64 
 
 		 740 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  41.94 
 
 		 465 aa  42.4  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>