124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1205 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  100 
 
 		 304 aa  585  1e-166  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  38.77 
 
 		 530 aa  168  8e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  37.27 
 
 		 522 aa  168  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  34.52 
 
 		 576 aa  166  4e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  39.6 
 
 		 503 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.11 
 
 		 517 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  34.57 
 
 		 533 aa  160  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  38.18 
 
 		 544 aa  157  2e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  35.85 
 
 		 573 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  30.67 
 
 		 701 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  30.63 
 
 		 658 aa  140  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  35.85 
 
 		 573 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  38.44 
 
 		 531 aa  136  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  35.53 
 
 		 573 aa  136  4e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  31.4 
 
 		 679 aa  123  4e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  30.94 
 
 		 310 aa  123  4e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  30.65 
 
 		 310 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  36.53 
 
 		 612 aa  120  3.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  30.37 
 
 		 644 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  28.57 
 
 		 647 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  35.15 
 
 		 667 aa  108  1e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  28.11 
 
 		 619 aa  107  2e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 664 aa  106  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  35.17 
 
 		 701 aa  105  7e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  35.45 
 
 		 693 aa  105  9e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  37.91 
 
 		 578 aa  102  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.87 
 
 		 692 aa  102  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  36.87 
 
 		 690 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  29.64 
 
 		 650 aa  102  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  34.43 
 
 		 607 aa  101  1e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 690 aa  101  2e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  37.21 
 
 		 646 aa  101  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  36.87 
 
 		 693 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  36.87 
 
 		 692 aa  101  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 681 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  31.5 
 
 		 687 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 663 aa  98.2  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  39.59 
 
 		 691 aa  96.7  4e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  30.26 
 
 		 585 aa  93.6  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  33.67 
 
 		 586 aa  92.8  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 680 aa  91.7  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  26 
 
 		 690 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  28.62 
 
 		 653 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  32.67 
 
 		 599 aa  90.1  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 572 aa  89.4  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  29.06 
 
 		 572 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  34.5 
 
 		 571 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  33 
 
 		 572 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  29.31 
 
 		 564 aa  85.9  8e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  29.04 
 
 		 572 aa  84  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  30.5 
 
 		 601 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  34.97 
 
 		 588 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  29.94 
 
 		 572 aa  79.7  0.00000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  38.24 
 
 		 577 aa  79  0.00000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 657 aa  79  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  35.56 
 
 		 579 aa  77.8  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  33.17 
 
 		 612 aa  75.5  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 		 611 aa  65.1  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  23.01 
 
 		 587 aa  64.7  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  22.55 
 
 		 335 aa  65.1  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  25.14 
 
 		 339 aa  62.4  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  22.52 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  25.64 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  29.55 
 
 		 344 aa  57.4  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  32.53 
 
 		 299 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  29.32 
 
 		 315 aa  56.6  0.0000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  29.5 
 
 		 344 aa  55.1  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  29.13 
 
 		 336 aa  52.8  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  29.47 
 
 		 318 aa  52.8  0.000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25.9 
 
 		 344 aa  52.8  0.000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  37.5 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  27.89 
 
 		 651 aa  52  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 		 339 aa  52.4  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  27.85 
 
 		 321 aa  51.6  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  21.17 
 
 		 346 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  30.05 
 
 		 311 aa  51.2  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2080  von Willebrand factor type A  28.3 
 
 		 327 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.829092  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0796  von Willebrand factor type A  24.34 
 
 		 328 aa  50.4  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000131986  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  23.11 
 
 		 318 aa  50.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  26.53 
 
 		 337 aa  50.4  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1250  batA protein, putative  29.63 
 
 		 332 aa  50.1  0.00005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.367863  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  30.56 
 
 		 334 aa  50.1  0.00005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1733  von Willebrand factor type A  27.88 
 
 		 342 aa  50.1  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.818001  normal  0.561199 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000306  protein BatA  25.57 
 
 		 356 aa  50.1  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2455  hypothetical protein  28.77 
 
 		 335 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.16032  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2500  hypothetical protein  28.77 
 
 		 335 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.672748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2492  hypothetical protein  28.77 
 
 		 335 aa  49.7  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.882923  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  32 
 
 		 358 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  32 
 
 		 358 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  21.9 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3280  hypothetical protein  30.05 
 
 		 311 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.207213  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  24.06 
 
 		 471 aa  48.5  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  21.32 
 
 		 319 aa  48.5  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  32 
 
 		 358 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2468  von Willebrand factor type A  32.07 
 
 		 309 aa  47.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.722461 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  21.9 
 
 		 332 aa  47  0.0004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  27.59 
 
 		 329 aa  46.6  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  23.94 
 
 		 334 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2406  von Willebrand factor type A  31.88 
 
 		 325 aa  46.6  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  25.12 
 
 		 333 aa  45.8  0.0009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>