62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_3280 on replicon NC_007494
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007494  RSP_3280  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  568  1e-161  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.207213  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  98.07 
 
 		 311 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4304  von Willebrand factor type A  44.55 
 
 		 309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.0946838 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0866  von Willebrand factor type A  41.5 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258212  normal  0.0493979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0826  von Willebrand factor type A  41.18 
 
 		 307 aa  139  7.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420191  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1129  von Willebrand factor, type A  42.91 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0792  von Willebrand factor type A  40.85 
 
 		 307 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.026316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1008  von Willebrand factor type A  38.43 
 
 		 306 aa  125  6e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.851254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1387  von Willebrand factor type A  40.57 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353054  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2468  von Willebrand factor type A  41.16 
 
 		 309 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.722461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  34.19 
 
 		 299 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  30.52 
 
 		 679 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  27.41 
 
 		 701 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 644 aa  80.1  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  28.85 
 
 		 607 aa  79.7  0.00000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  26.33 
 
 		 576 aa  73.6  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  26.43 
 
 		 310 aa  68.6  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 690 aa  66.6  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  28.43 
 
 		 619 aa  65.1  0.000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 687 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  32.73 
 
 		 681 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 650 aa  63.9  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  25.16 
 
 		 310 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 692 aa  62.8  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 663 aa  62.8  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.31 
 
 		 692 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 690 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  34.31 
 
 		 693 aa  62  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  26.5 
 
 		 657 aa  61.6  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  29.35 
 
 		 571 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 693 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  25.52 
 
 		 658 aa  59.3  0.00000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  28.86 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  28.86 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  32.02 
 
 		 701 aa  58.2  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  33.33 
 
 		 646 aa  57.4  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  26.86 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  30.66 
 
 		 691 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 612 aa  56.6  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  30.99 
 
 		 680 aa  56.2  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  31.85 
 
 		 599 aa  56.2  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  31.21 
 
 		 601 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  29.76 
 
 		 344 aa  52  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  31.52 
 
 		 304 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  30.41 
 
 		 503 aa  48.5  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  28.73 
 
 		 578 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  25.23 
 
 		 595 aa  48.1  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 653 aa  47  0.0004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  27.01 
 
 		 690 aa  46.6  0.0005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  25.37 
 
 		 533 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  23.95 
 
 		 611 aa  46.2  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 522 aa  45.8  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  22.9 
 
 		 345 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 612 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  31.96 
 
 		 667 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  27.99 
 
 		 573 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  27.99 
 
 		 573 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.23 
 
 		 517 aa  43.9  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  26.57 
 
 		 530 aa  43.5  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2451  von Willebrand factor, type A  24.09 
 
 		 337 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  21.26 
 
 		 335 aa  42.4  0.01  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>