68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2468 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2468  von Willebrand factor type A  100 
 
 		 309 aa  586  1e-166  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.722461 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4304  von Willebrand factor type A  44.66 
 
 		 309 aa  187  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.0946838 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1008  von Willebrand factor type A  44.67 
 
 		 306 aa  172  6.999999999999999e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.851254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1387  von Willebrand factor type A  46.15 
 
 		 307 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353054  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0826  von Willebrand factor type A  42.11 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420191  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0792  von Willebrand factor type A  42.43 
 
 		 307 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.026316 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0866  von Willebrand factor type A  42.11 
 
 		 307 aa  159  5e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258212  normal  0.0493979 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  41.48 
 
 		 299 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3280  hypothetical protein  41.16 
 
 		 311 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.207213  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  40.94 
 
 		 311 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1129  von Willebrand factor, type A  35.97 
 
 		 315 aa  96.3  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2871  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  29.52 
 
 		 658 aa  79.7  0.00000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  27.19 
 
 		 310 aa  79.7  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  27.19 
 
 		 310 aa  79  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  33.85 
 
 		 571 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 701 aa  76.3  0.0000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  32.31 
 
 		 572 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  32.31 
 
 		 572 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  23.79 
 
 		 576 aa  68.6  0.0000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  29.87 
 
 		 607 aa  68.2  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 612 aa  67.8  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  26.54 
 
 		 679 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 644 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  29.81 
 
 		 647 aa  61.6  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  31.74 
 
 		 650 aa  60.5  0.00000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  34.68 
 
 		 572 aa  60.1  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  28.43 
 
 		 619 aa  60.1  0.00000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  29.95 
 
 		 657 aa  59.7  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  32.1 
 
 		 544 aa  59.3  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  23.28 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  31.39 
 
 		 599 aa  57.8  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 653 aa  57.4  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 690 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  28.71 
 
 		 667 aa  55.8  0.0000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 		 691 aa  55.8  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 588 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 687 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  29.65 
 
 		 681 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  30.5 
 
 		 578 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  33.77 
 
 		 693 aa  53.5  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  29.71 
 
 		 646 aa  52  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  28.35 
 
 		 503 aa  51.2  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  27.36 
 
 		 690 aa  50.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  30.98 
 
 		 579 aa  49.7  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  30.41 
 
 		 304 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  29.67 
 
 		 701 aa  49.3  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.64 
 
 		 692 aa  49.3  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 692 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 693 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  25.98 
 
 		 664 aa  48.1  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  28.64 
 
 		 690 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  27.85 
 
 		 601 aa  47.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  27.64 
 
 		 663 aa  47.4  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1886  von Willebrand factor, type A  28.82 
 
 		 329 aa  47  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.8 
 
 		 517 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  26.92 
 
 		 572 aa  45.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  28.25 
 
 		 522 aa  45.4  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  30.23 
 
 		 530 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  35.09 
 
 		 573 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  35.09 
 
 		 573 aa  43.9  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  31.6 
 
 		 531 aa  44.3  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  33.9 
 
 		 573 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 586 aa  43.9  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  30.81 
 
 		 577 aa  43.5  0.004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  30.41 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  24.02 
 
 		 564 aa  43.1  0.006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  21.12 
 
 		 344 aa  42.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>