66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17029_4012 on replicon NC_009050
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  100 
 
 		 311 aa  566  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3280  hypothetical protein  98.07 
 
 		 311 aa  551  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.207213  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4304  von Willebrand factor type A  44.88 
 
 		 309 aa  162  9e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.0946838 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1129  von Willebrand factor, type A  42.91 
 
 		 315 aa  136  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0866  von Willebrand factor type A  41.5 
 
 		 307 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258212  normal  0.0493979 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0826  von Willebrand factor type A  41.18 
 
 		 307 aa  134  3e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420191  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0792  von Willebrand factor type A  40.85 
 
 		 307 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.026316 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1008  von Willebrand factor type A  38.43 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.851254  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1387  von Willebrand factor type A  40.57 
 
 		 307 aa  120  3e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353054  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2468  von Willebrand factor type A  40.94 
 
 		 309 aa  119  6e-26  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.722461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  34.6 
 
 		 299 aa  115  8.999999999999998e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  29.82 
 
 		 701 aa  89  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  31.85 
 
 		 679 aa  88.6  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  28.62 
 
 		 607 aa  82  0.00000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 644 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  28.08 
 
 		 310 aa  76.3  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  26.33 
 
 		 576 aa  74.3  0.000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  27.67 
 
 		 310 aa  72  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  28.7 
 
 		 650 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 690 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 687 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  33.18 
 
 		 681 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  28.92 
 
 		 619 aa  68.9  0.00000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  34.4 
 
 		 663 aa  67  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  30.98 
 
 		 571 aa  66.6  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  35.44 
 
 		 690 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.44 
 
 		 692 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 		 692 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 		 693 aa  65.1  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  34.8 
 
 		 693 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  30.46 
 
 		 572 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  30.46 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  27.5 
 
 		 657 aa  63.9  0.000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  27.51 
 
 		 647 aa  63.9  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  28.05 
 
 		 658 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  33.33 
 
 		 646 aa  60.1  0.00000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  29.38 
 
 		 599 aa  59.3  0.00000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  29.15 
 
 		 612 aa  58.9  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  33 
 
 		 701 aa  57.8  0.0000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  27.78 
 
 		 522 aa  57  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  31.88 
 
 		 601 aa  57  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  31.31 
 
 		 691 aa  57  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  31.92 
 
 		 680 aa  55.1  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  31.75 
 
 		 304 aa  53.5  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  28.89 
 
 		 578 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  28.16 
 
 		 690 aa  52.4  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  22.58 
 
 		 345 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2452  von Willebrand factor, type A  28.99 
 
 		 344 aa  50.8  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  28.81 
 
 		 530 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.91 
 
 		 517 aa  50.4  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  24.92 
 
 		 533 aa  49.3  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  25.7 
 
 		 595 aa  48.5  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  30.2 
 
 		 653 aa  48.5  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  26.38 
 
 		 611 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  30.41 
 
 		 503 aa  47.4  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  30.39 
 
 		 612 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  38.95 
 
 		 667 aa  45.8  0.0009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  31.25 
 
 		 318 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  27.64 
 
 		 336 aa  45.1  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  28.35 
 
 		 573 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  28.35 
 
 		 573 aa  45.1  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  23.53 
 
 		 339 aa  43.1  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  27.06 
 
 		 572 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  25.57 
 
 		 579 aa  42.7  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  28.39 
 
 		 573 aa  42.4  0.009  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  28.99 
 
 		 664 aa  42.4  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>