74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1129 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1129  von Willebrand factor, type A  100 
 
 		 315 aa  582  1.0000000000000001e-165  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.2871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4304  von Willebrand factor type A  40.26 
 
 		 309 aa  138  2e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.30548  normal  0.0946838 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3280  hypothetical protein  42.91 
 
 		 311 aa  126  5e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.207213  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4012  hypothetical protein  42.91 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.523385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0826  von Willebrand factor type A  38.71 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.420191  normal  0.367588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0866  von Willebrand factor type A  38.71 
 
 		 307 aa  122  8e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.258212  normal  0.0493979 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0792  von Willebrand factor type A  41.63 
 
 		 307 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.026316 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1387  von Willebrand factor type A  41.54 
 
 		 307 aa  119  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.353054  normal  0.0827017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1008  von Willebrand factor type A  42.61 
 
 		 306 aa  104  2e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.851254  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2468  von Willebrand factor type A  36.67 
 
 		 309 aa  100  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.722461 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0460  hypothetical protein  31.76 
 
 		 299 aa  98.6  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  27.99 
 
 		 701 aa  97.8  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  30.03 
 
 		 679 aa  90.5  3e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  31.72 
 
 		 647 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 644 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  31.84 
 
 		 658 aa  76.6  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  32.7 
 
 		 691 aa  76.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  33.96 
 
 		 663 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  30.49 
 
 		 607 aa  73.9  0.000000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35 
 
 		 692 aa  73.9  0.000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  29.29 
 
 		 619 aa  72.8  0.000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 690 aa  72.8  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  35.18 
 
 		 692 aa  72  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  35.18 
 
 		 693 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 690 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  25.21 
 
 		 310 aa  71.6  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 681 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  33.84 
 
 		 687 aa  70.5  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  28.14 
 
 		 576 aa  70.9  0.00000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  32.47 
 
 		 571 aa  70.5  0.00000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  33.66 
 
 		 701 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  24.79 
 
 		 310 aa  70.1  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  31.47 
 
 		 657 aa  69.7  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  32.14 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 572 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  32.83 
 
 		 653 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  26.57 
 
 		 664 aa  67.4  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  30.23 
 
 		 690 aa  66.6  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  30.3 
 
 		 599 aa  65.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  30.33 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  31.42 
 
 		 667 aa  65.1  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  31.38 
 
 		 693 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 650 aa  64.3  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  30.69 
 
 		 601 aa  63.2  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.42 
 
 		 517 aa  62.8  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 533 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  26.29 
 
 		 573 aa  60.8  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  26.29 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  25.59 
 
 		 573 aa  59.3  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  29.49 
 
 		 611 aa  58.2  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  32.85 
 
 		 646 aa  56.6  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  31.67 
 
 		 579 aa  56.2  0.0000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  28.18 
 
 		 544 aa  55.8  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  29.17 
 
 		 578 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 572 aa  54.3  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  28.92 
 
 		 612 aa  54.3  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  28.99 
 
 		 530 aa  52.8  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  30 
 
 		 572 aa  52.4  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  29.25 
 
 		 345 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  25.21 
 
 		 344 aa  50.1  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  31.15 
 
 		 588 aa  49.7  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  33.33 
 
 		 531 aa  49.7  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  28.33 
 
 		 572 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  28.98 
 
 		 680 aa  49.3  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  24.31 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  28.16 
 
 		 586 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  32.11 
 
 		 612 aa  47.8  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0825  von Willebrand factor type A  28.47 
 
 		 339 aa  46.2  0.0007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.431264  normal  0.379491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  27.96 
 
 		 304 aa  46.2  0.0008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  24.62 
 
 		 522 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  24.47 
 
 		 335 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  22.22 
 
 		 320 aa  43.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  30.89 
 
 		 585 aa  43.1  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  24.28 
 
 		 564 aa  42.7  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>