132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_3117 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  100 
 
 		 503 aa  981    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  35.09 
 
 		 544 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  35.63 
 
 		 522 aa  276  4e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  34.98 
 
 		 531 aa  256  9e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.44 
 
 		 517 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 		 533 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  33.9 
 
 		 530 aa  223  7e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  29.87 
 
 		 576 aa  221  1.9999999999999999e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  30.23 
 
 		 658 aa  209  9e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  29.24 
 
 		 573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  30.42 
 
 		 679 aa  187  5e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  28.9 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  29.08 
 
 		 573 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  27.57 
 
 		 564 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  28 
 
 		 664 aa  178  2e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  28.96 
 
 		 701 aa  177  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  32.75 
 
 		 701 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  27.31 
 
 		 644 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  30.92 
 
 		 690 aa  170  4e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  29.01 
 
 		 572 aa  170  5e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 		 647 aa  168  2e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 681 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 687 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 693 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  29.33 
 
 		 572 aa  161  3e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  32.58 
 
 		 572 aa  157  4e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  30.07 
 
 		 663 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  27.58 
 
 		 599 aa  155  1e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  27.05 
 
 		 601 aa  156  1e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  32.35 
 
 		 572 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  30.22 
 
 		 693 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.36 
 
 		 692 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  30.29 
 
 		 692 aa  154  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  34.22 
 
 		 586 aa  152  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  29.71 
 
 		 690 aa  152  1e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 612 aa  152  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  30.21 
 
 		 578 aa  151  3e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  33.42 
 
 		 577 aa  150  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  28.72 
 
 		 571 aa  150  7e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  31.65 
 
 		 588 aa  149  8e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  26.07 
 
 		 657 aa  149  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  39.07 
 
 		 304 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  31.43 
 
 		 691 aa  145  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 650 aa  145  1e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  29.5 
 
 		 646 aa  144  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  31.54 
 
 		 607 aa  143  6e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  33.78 
 
 		 680 aa  142  9.999999999999999e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  33.18 
 
 		 585 aa  140  7e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  32.35 
 
 		 310 aa  139  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  32.68 
 
 		 310 aa  139  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  30.75 
 
 		 579 aa  138  2e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  25.1 
 
 		 667 aa  137  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  23.23 
 
 		 619 aa  137  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  26.32 
 
 		 690 aa  136  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  31.95 
 
 		 572 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  29.02 
 
 		 653 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  28.81 
 
 		 612 aa  114  5e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 587 aa  113  7.000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 220 aa  97.1  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  23.65 
 
 		 651 aa  79.7  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.39 
 
 		 611 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  24.39 
 
 		 335 aa  72  0.00000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  24.86 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  25.95 
 
 		 320 aa  63.5  0.000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  27.65 
 
 		 336 aa  63.5  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  31.93 
 
 		 293 aa  62.4  0.00000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  31.15 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  24.12 
 
 		 339 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  27.91 
 
 		 349 aa  60.5  0.00000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2318  von Willebrand factor type A  26.49 
 
 		 339 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  27.22 
 
 		 339 aa  59.7  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02145  hypothetical protein  23.16 
 
 		 346 aa  59.7  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2085  von Willebrand factor type A  29.58 
 
 		 336 aa  60.1  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  31.41 
 
 		 344 aa  58.9  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  26.32 
 
 		 359 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2655  BatA-like protein, aerotolerance-related  23.2 
 
 		 351 aa  58.5  0.0000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  20.81 
 
 		 344 aa  58.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.69 
 
 		 273 aa  57  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  32.99 
 
 		 339 aa  57  0.0000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  21.16 
 
 		 595 aa  56.6  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  30.46 
 
 		 344 aa  56.6  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4901  hypothetical protein  24.68 
 
 		 330 aa  56.6  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.908989  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2455  von Willebrand factor type A  22.45 
 
 		 338 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  30.77 
 
 		 344 aa  55.8  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1908  hypothetical protein  25.16 
 
 		 319 aa  55.8  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.137204 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  30.37 
 
 		 329 aa  55.8  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2438  von Willebrand factor type A  30.65 
 
 		 315 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1251  batB protein, putative  26.43 
 
 		 322 aa  53.9  0.000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.711324  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1582  batA protein  22.4 
 
 		 327 aa  53.5  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2086  von Willebrand factor type A  25.53 
 
 		 327 aa  53.5  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  26.15 
 
 		 333 aa  52  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0173  von Willebrand factor type A domain protein  27.92 
 
 		 333 aa  52.4  0.00002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.0526529  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  24.32 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0430  hypothetical protein  23.97 
 
 		 336 aa  51.6  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  31.61 
 
 		 334 aa  51.2  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2147  hypothetical protein  33.08 
 
 		 321 aa  50.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.130278  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  24.76 
 
 		 320 aa  50.8  0.00005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1812  von Willebrand factor type A  29.03 
 
 		 318 aa  50.8  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4900  von Willebrand factor type A  20.38 
 
 		 337 aa  50.4  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  21.5 
 
 		 334 aa  50.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>