229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3231 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 612 aa  1191    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  57.09 
 
 		 607 aa  579  1e-164  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  32.37 
 
 		 647 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  29 
 
 		 657 aa  247  4.9999999999999997e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  35.03 
 
 		 579 aa  236  8e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  27.11 
 
 		 667 aa  223  6e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 572 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  27.65 
 
 		 658 aa  217  5e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  31.99 
 
 		 572 aa  216  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 644 aa  215  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  33.76 
 
 		 572 aa  208  3e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  33.92 
 
 		 572 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  31.26 
 
 		 571 aa  206  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  27.95 
 
 		 679 aa  205  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  31.41 
 
 		 612 aa  204  4e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  29.67 
 
 		 663 aa  204  4e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  33.33 
 
 		 585 aa  203  6e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  27.72 
 
 		 701 aa  200  7e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 		 588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  33.03 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  27.89 
 
 		 690 aa  192  1e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  32.51 
 
 		 578 aa  192  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  32.92 
 
 		 586 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  28.88 
 
 		 690 aa  190  7e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 		 664 aa  187  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  30.41 
 
 		 619 aa  187  6e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  30.76 
 
 		 572 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  30.14 
 
 		 701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  27.79 
 
 		 650 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  28.51 
 
 		 692 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 693 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.29 
 
 		 692 aa  178  3e-43  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  28.3 
 
 		 693 aa  177  5e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 		 681 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  32.75 
 
 		 690 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  31.7 
 
 		 599 aa  173  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  31.29 
 
 		 601 aa  171  4e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  28.16 
 
 		 653 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  36.68 
 
 		 577 aa  167  4e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.12 
 
 		 517 aa  163  7e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  23.7 
 
 		 587 aa  163  7e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  32.21 
 
 		 544 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  32.73 
 
 		 531 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  30.32 
 
 		 691 aa  159  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000305  TPR domain protein in aerotolerance operon  29.25 
 
 		 576 aa  157  6e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  30.51 
 
 		 522 aa  154  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  30.35 
 
 		 533 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  28.55 
 
 		 646 aa  153  8.999999999999999e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  29.57 
 
 		 573 aa  139  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2913  hypothetical protein  31.25 
 
 		 310 aa  139  2e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2767  hypothetical protein  31.25 
 
 		 310 aa  138  4e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  28.5 
 
 		 573 aa  137  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  29.91 
 
 		 573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3117  hypothetical protein  30.04 
 
 		 503 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.10336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1205  hypothetical protein  35.79 
 
 		 304 aa  117  8.999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1740  hypothetical protein  27.09 
 
 		 564 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0649  von Willebrand factor, type A  22.73 
 
 		 471 aa  99  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1482  von Willebrand factor type A  23.88 
 
 		 344 aa  98.6  3e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.428182  normal  0.250576 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2395  von Willebrand factor type A  31.33 
 
 		 611 aa  96.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.850853  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_002950  PG1583  batB protein  30.16 
 
 		 339 aa  89.4  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0906  von Willebrand factor type A  25.61 
 
 		 345 aa  86.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.519509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5483  von Willebrand factor type A  23.32 
 
 		 320 aa  85.9  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1122  von Willebrand factor type A  24.72 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.51147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0073  von Willebrand factor, type A  27.21 
 
 		 349 aa  83.6  0.000000000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2914  hypothetical protein  28.96 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2768  hypothetical protein  28.96 
 
 		 344 aa  82.4  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1538  von Willebrand factor type A  24.35 
 
 		 347 aa  81.3  0.00000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.634535  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0099  von Willebrand factor, type A  23.5 
 
 		 651 aa  79.7  0.0000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6107  von Willebrand factor type A  22.96 
 
 		 359 aa  77.8  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3211  von Willebrand factor, type A  30 
 
 		 359 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.161906 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0719  von Willebrand factor, type A  22.74 
 
 		 334 aa  77.4  0.0000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.887647  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1561  von Willebrand factor type A  29.63 
 
 		 358 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.604958 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1680  von Willebrand factor type A  24.83 
 
 		 333 aa  75.5  0.000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.233991  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3846  von Willebrand factor type A  25.65 
 
 		 339 aa  74.7  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.341342  normal  0.622551 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0523  von Willebrand factor type A  32.49 
 
 		 344 aa  75.1  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1106  hypothetical protein  27.22 
 
 		 318 aa  74.7  0.000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0442  von Willebrand factor type A  31.18 
 
 		 329 aa  74.3  0.000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.570722  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0441  von Willebrand factor type A  33.33 
 
 		 339 aa  73.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126065  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2029  von Willebrand factor type A domain-containing protein  28.96 
 
 		 358 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.34439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3713  von Willebrand factor, type A  28.96 
 
 		 358 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.512513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0524  hypothetical protein  25.55 
 
 		 320 aa  71.6  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  41.41 
 
 		 220 aa  71.2  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2932  von Willebrand factor, type A  30.77 
 
 		 334 aa  71.2  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.922939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1887  von Willebrand factor, type A  27.36 
 
 		 334 aa  70.9  0.00000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.615946  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3762  von Willebrand factor type A domain protein  28.71 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0098  von Willebrand factor, type A  23.51 
 
 		 363 aa  70.1  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02150  aerotolerance-related membrane protein  23.84 
 
 		 334 aa  70.1  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1718  von Willebrand factor, type A  28.19 
 
 		 352 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.060135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0242  von Willebrand factor type A  28.68 
 
 		 336 aa  67.8  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0239154  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1481  von Willebrand factor type A  23.79 
 
 		 332 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587986  normal  0.160763 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0720  von Willebrand factor, type A  22.77 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.799777  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1589  von Willebrand factor type A  30.09 
 
 		 358 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327037  hitchhiker  0.00013363 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1007  von Willebrand factor type A  29.72 
 
 		 324 aa  65.9  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0193109  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  49.21 
 
 		 293 aa  65.9  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  49.21 
 
 		 278 aa  66.2  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18800  von Willebrand factor, type A (VWA) domain protein  28.45 
 
 		 335 aa  65.5  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00117552  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5138  von Willebrand factor type A  29.26 
 
 		 329 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.585465 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02705  von Willebrand factor, type A  26.47 
 
 		 349 aa  65.1  0.000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3278  von Willebrand factor domain-containing protein  31.39 
 
 		 328 aa  65.1  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.173273  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001269  protein BatA  24.09 
 
 		 334 aa  65.1  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.687935  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>