135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp2912 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp2912  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  561  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2766  hypothetical protein  91.81 
 
 
278 aa  367  1e-100  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  31.47 
 
 
579 aa  144  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02344  tetratricopeptide repeat domain protein  35.31 
 
 
607 aa  134  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  32.08 
 
 
612 aa  126  4.0000000000000003e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1743  TPR domain-containing protein  35.39 
 
 
658 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2933  TPR repeat-containing protein  30.65 
 
 
588 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02706  TPR domain protein  33.45 
 
 
667 aa  105  1e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1658  TPR repeat-containing protein  31.76 
 
 
647 aa  102  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.95456  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  29.43 
 
 
644 aa  102  7e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1717  TPR repeat-containing von Willebrand factor, type A  29.5 
 
 
572 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2465  TPR repeat-containing protein  32.71 
 
 
663 aa  100  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3212  hypothetical protein  28.74 
 
 
578 aa  97.4  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.190926 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3763  TPR domain protein  28.62 
 
 
572 aa  96.3  5e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3231  TPR repeat-containing protein  32.78 
 
 
612 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439888  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2173  TPR domain-containing protein  34.65 
 
 
701 aa  94.7  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.081888 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1206  TPR repeat-containing protein  32.68 
 
 
220 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.89 
 
 
273 aa  94.4  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1560  TPR repeat-containing protein  28.74 
 
 
571 aa  92.8  5e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.535158 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1524  TPR repeat-containing protein  26.82 
 
 
691 aa  92.8  6e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2816  TPR repeat-containing protein  32.39 
 
 
657 aa  92.4  8e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18790  tetratricopeptide (TPR) repeat and VWA domain-containing protein  26.44 
 
 
577 aa  91.7  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00254687  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2139  hypothetical protein  33.33 
 
 
530 aa  92  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.488109  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2682  TPR repeat-containing protein  36.05 
 
 
701 aa  92  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3714  TPR repeat-containing protein  27.59 
 
 
572 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.325605  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3032  TPR repeat-containing protein  32.82 
 
 
650 aa  89.7  5e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.198571  normal  0.0885065 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2028  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 
572 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0793  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.52 
 
 
312 aa  86.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0444795 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0072  TPR repeat-containing protein  29.28 
 
 
664 aa  86.3  6e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2786  TPR repeat-containing protein  39.27 
 
 
693 aa  85.9  8e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2766  TPR repeat-containing protein  37.21 
 
 
690 aa  84.3  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1588  TPR repeat-containing protein  28.35 
 
 
572 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00107949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0867  TPR repeat-containing protein  24.61 
 
 
312 aa  82.8  0.000000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.225271  normal  0.0510852 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0827  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.61 
 
 
312 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.257865  normal  0.362947 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2887  tetratricopeptide TPR_4  29.67 
 
 
544 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0337019  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2431  TPR repeat-containing protein  30.49 
 
 
693 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0167557 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2604  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
653 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1388  TPR repeat-containing protein  23.92 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0606731  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3802  TPR repeat-containing protein  45.12 
 
 
522 aa  75.1  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2861  TPR repeat-containing protein  35.77 
 
 
692 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0393834 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1732  TPR repeat-containing protein  30.28 
 
 
587 aa  73.9  0.000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.966886  normal  0.26357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1592  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.9 
 
 
692 aa  73.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000228279 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4303  TPR repeat-containing protein  26.02 
 
 
306 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.341118  normal  0.0662026 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5137  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.46 
 
 
517 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal  0.644601 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2316  translation initiation factor IF-2  50.85 
 
 
1116 aa  72.4  0.000000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.100815  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3163  TPR domain-containing protein  34.29 
 
 
690 aa  72  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.185864  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4531  hypothetical protein  29.28 
 
 
531 aa  70.1  0.00000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.536979  normal  0.0526442 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24390  TPR domain-containing protein  27.93 
 
 
586 aa  68.2  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00557521  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1402  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 
681 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103328 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1467  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 
687 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.510289  hitchhiker  0.00291188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1455  TPR repeat-containing protein  41.12 
 
 
690 aa  65.9  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  unclonable  0.000000000112359 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0853  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
680 aa  65.9  0.0000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1946  hypothetical protein  17.56 
 
 
491 aa  64.7  0.000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1009  TPR repeat-containing protein  24.36 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3094  TPR domain-containing protein  34.65 
 
 
679 aa  63.5  0.000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1121  TPR repeat-containing protein  35.04 
 
 
209 aa  59.3  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.685815  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3385  von Willebrand factor, type A  28.22 
 
 
573 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.465184 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2066  hypothetical protein  28.72 
 
 
585 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05143  hypothetical protein  33.86 
 
 
601 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1107  hypothetical protein  24.05 
 
 
646 aa  55.5  0.0000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001268  TPR domain protein in aerotolerance operon  35.42 
 
 
599 aa  55.1  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0461  hypothetical protein  40.58 
 
 
224 aa  55.1  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  40.58 
 
 
250 aa  54.7  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3555  von Willebrand factor, type A  29.61 
 
 
573 aa  54.7  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3054  TPR repeat-containing protein  32.99 
 
 
533 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.350986  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0568  von Willebrand factor, type A  28.95 
 
 
573 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  47.06 
 
 
1276 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0310  pentapeptide MXKDX repeat protein  23.81 
 
 
109 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.109825  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5637  1A family penicillin-binding protein  41.6 
 
 
794 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.751111  normal  0.833891 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0298  pentapeptide MXKDX repeat protein  23.81 
 
 
109 aa  50.8  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0523  hypothetical protein  38.96 
 
 
619 aa  50.4  0.00003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  45.31 
 
 
543 aa  50.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02135  aerotolerance-related exported protein  32.35 
 
 
299 aa  50.4  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4508  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  41.79 
 
 
836 aa  50.4  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.885776 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2941  hypothetical protein  64.52 
 
 
560 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.000171884  normal  0.0147454 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  38.46 
 
 
3560 aa  49.7  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1782  TPR repeat-containing protein  29.91 
 
 
467 aa  49.3  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1850  TPR repeat-containing protein  52.38 
 
 
123 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1876  TPR repeat-containing protein  52.38 
 
 
123 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  44 
 
 
3035 aa  48.9  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2834  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  43.08 
 
 
439 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.950152 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1221  hypothetical protein  31.11 
 
 
623 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2461  hypothetical protein  44.64 
 
 
398 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.125521  normal  0.0258605 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  44.07 
 
 
1979 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4355  TPR repeat-containing protein  46.3 
 
 
1192 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.862224  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1342  TPR repeat-containing protein  40.35 
 
 
391 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  41.18 
 
 
927 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3289  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  41.54 
 
 
439 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3314  tetratricopeptide TPR_2  36.07 
 
 
1240 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.689174  normal  0.286856 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2540  hypothetical protein  29.09 
 
 
1612 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.27 
 
 
397 aa  46.6  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1947  tetratricopeptide TPR_2  29.69 
 
 
564 aa  46.6  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0106408 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  37.36 
 
 
1056 aa  46.6  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  51.16 
 
 
4079 aa  46.6  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  61.54 
 
 
878 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  57.14 
 
 
810 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  40.68 
 
 
634 aa  46.2  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  46.15 
 
 
4489 aa  46.2  0.0007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2367  protein kinase  37.04 
 
 
623 aa  45.8  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1922  tetratricopeptide TPR_2  35.94 
 
 
142 aa  45.8  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>