129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02135 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02135  aerotolerance-related exported protein  100 
 
 
299 aa  588  1e-167  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1537  TPR repeat-containing protein  43.83 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.14244  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0721  TPR repeat-containing protein  45.45 
 
 
258 aa  98.2  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.925159  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1584  batC protein  44.55 
 
 
247 aa  83.2  0.000000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1483  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.71 
 
 
248 aa  82.8  0.000000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.102986  normal  0.222899 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0911  TPR domain-containing protein  37.74 
 
 
714 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1121  TPR repeat-containing protein  32.72 
 
 
209 aa  60.1  0.00000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.685815  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4628  TPR repeat-containing protein  34.81 
 
 
714 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.342126 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  40.21 
 
 
425 aa  58.9  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  37.76 
 
 
810 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2562  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.96 
 
 
364 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  30.14 
 
 
3560 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3697  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.43 
 
 
293 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.984045  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
639 aa  52.8  0.000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  36.73 
 
 
878 aa  52.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1093  TPR repeat-containing protein  38.32 
 
 
681 aa  52  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.353622  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2861  sulfotransferase  36.84 
 
 
681 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.392476 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  32.26 
 
 
887 aa  52  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2456  putative aerotolerance-related exported protein BatC containing TPR domain  25.6 
 
 
283 aa  52  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10215  peroxisomal targeting signal (PTS1) receptor protein peroxin 5 (Eurofung)  27.33 
 
 
655 aa  51.2  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00000612411  normal  0.654696 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  39.78 
 
 
816 aa  51.2  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1350  TPR repeat-containing protein  32.03 
 
 
766 aa  51.2  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 
3172 aa  50.8  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0955  TPR repeat-containing protein  38.3 
 
 
637 aa  50.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1949  TPR repeat-containing protein  26.16 
 
 
612 aa  50.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.931925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3832  TPR repeat-containing protein  33.71 
 
 
688 aa  49.7  0.00005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00173771 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  32.97 
 
 
1406 aa  49.7  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2467  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.23 
 
 
273 aa  49.7  0.00006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.724582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0052  von Willebrand factor type A  30.4 
 
 
589 aa  49.3  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.649054  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
637 aa  49.3  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
611 aa  49.3  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5981  hypothetical protein  33.66 
 
 
298 aa  48.9  0.00009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  37.5 
 
 
795 aa  48.5  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
635 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  35.05 
 
 
1694 aa  48.5  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
635 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4899  TPR repeat-containing protein  35.42 
 
 
246 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  32.29 
 
 
340 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3518  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.97 
 
 
320 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2859  sulfotransferase  29.63 
 
 
832 aa  47.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.398491 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0892  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
636 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.647896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1623  TPR repeat-containing protein  36.28 
 
 
644 aa  48.1  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000210321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0904  TPR repeat-containing protein  32.18 
 
 
612 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.587904  normal  0.769196 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1702  TPR repeat-containing protein  28.38 
 
 
226 aa  47.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.46 
 
 
632 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 
626 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.69 
 
 
441 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0902999 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0453  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 
626 aa  47  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.311085  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0657  von Willebrand factor, type A  32.98 
 
 
595 aa  47  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.676457  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4768  sulfotransferase  32.26 
 
 
676 aa  47  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.260339  normal  0.153237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1756  glycosyl transferase family 2  25.81 
 
 
1073 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.784743  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  36.17 
 
 
708 aa  47  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0730  TPR repeat-containing protein  23.91 
 
 
518 aa  47  0.0004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.444597  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4726  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  33.01 
 
 
730 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3015  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 
626 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3556  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
291 aa  46.6  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.276509  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2599  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 
614 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0734298  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0970  TPR domain-containing protein  31.03 
 
 
614 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2906  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
614 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0475913  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2967  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
614 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0177  TPR repeat-containing protein  31.03 
 
 
614 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0709  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.12 
 
 
864 aa  46.6  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635546 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  23.81 
 
 
2262 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.06 
 
 
639 aa  46.2  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2875  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
649 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  29.37 
 
 
979 aa  46.2  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0232  TPR repeat-containing protein  34.38 
 
 
649 aa  46.2  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  26.67 
 
 
1000 aa  45.8  0.0008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  32.29 
 
 
718 aa  45.8  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  37.5 
 
 
685 aa  45.8  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1635  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
502 aa  45.8  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.628977  normal  0.0608615 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  30.48 
 
 
4489 aa  45.8  0.0009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3086  TPR domain-containing protein  25.97 
 
 
579 aa  45.8  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.503806  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1288  TPR repeat-containing protein  27.33 
 
 
207 aa  45.4  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 
700 aa  45.1  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1181  tetratricopeptide TPR_2  32.98 
 
 
502 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.591026  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1909  aerotolerance protein  31.75 
 
 
237 aa  45.4  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.12502 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  34.41 
 
 
3301 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1009  TPR repeat-containing protein  27.22 
 
 
273 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0715627  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1661  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
502 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0601508  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 
1038 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0830  TPR repeat-containing protein  27.93 
 
 
1364 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29.63 
 
 
739 aa  45.4  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0191  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 
250 aa  45.8  0.001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.641193  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2716  TPR domain/sulfotransferase domain protein  31.31 
 
 
762 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0217  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 
646 aa  44.3  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2073  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.85 
 
 
214 aa  44.3  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0814777  normal  0.412873 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3719  TPR repeat-containing protein  27.46 
 
 
405 aa  44.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3748  TPR repeat-containing protein  32.98 
 
 
1450 aa  44.3  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2338  sulfotransferase  31.31 
 
 
762 aa  44.3  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.355943  normal  0.127881 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1565  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.25 
 
 
441 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1114  TPR domain-containing protein  24.76 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0729535  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2953  TPR repeat-containing protein  32.38 
 
 
711 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0781794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  26.89 
 
 
750 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0054  transcriptional regulator, MerR family  30.93 
 
 
377 aa  43.9  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.155443 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3268  TPR repeat-containing protein  32.26 
 
 
441 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 
374 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 
808 aa  43.9  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2853  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.26 
 
 
441 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0260503 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3177  TPR repeat-containing protein  26.05 
 
 
232 aa  43.5  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.095278 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>