More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1517 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1517  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  100 
 
 		 1000 aa  1960    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.261003  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00175  TPR-domain containing protein  23.85 
 
 		 1006 aa  201  3.9999999999999996e-50  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2246  TPR repeat-containing protein  22.44 
 
 		 1004 aa  175  5e-42  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2038  TPR repeat-containing protein  23.16 
 
 		 1024 aa  171  7e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.144797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1052  TPR repeat-containing protein  23.08 
 
 		 1019 aa  168  4e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.273667 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1962  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1031 aa  167  8e-40  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0551  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.03 
 
 		 1001 aa  159  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.874554  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1538  TPR repeat-containing protein  22.53 
 
 		 1012 aa  159  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0101738  normal  0.837321 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1172  Tetratricopeptide domain protein  22.98 
 
 		 1005 aa  145  3e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2327  TPR repeat-containing protein  23.62 
 
 		 1023 aa  140  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.930727  normal  0.708749 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3586  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.01 
 
 		 1077 aa  117  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  24.97 
 
 		 4079 aa  112  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  25.54 
 
 		 1979 aa  109  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  22.29 
 
 		 927 aa  104  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1987  TPR repeat-containing protein  24.8 
 
 		 934 aa  100  1e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0465352  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1651  TPR domain-containing protein  23.99 
 
 		 995 aa  99.8  2e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.874566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3996  tetratricopeptide TPR_2  25.09 
 
 		 1694 aa  98.2  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.271204  normal  0.601264 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  23.01 
 
 		 1676 aa  95.9  3e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0157  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 465 aa  93.6  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0471  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 1297 aa  91.7  6e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  26.45 
 
 		 878 aa  90.1  2e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  24.79 
 
 		 543 aa  87.8  9e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1312  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 1069 aa  87.8  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.530092  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.81 
 
 		 810 aa  87.4  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  28.5 
 
 		 562 aa  85.9  0.000000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  21.79 
 
 		 1737 aa  82  0.00000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1552  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.76 
 
 		 707 aa  81.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0225548 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0011  hypothetical protein  21.66 
 
 		 1138 aa  79  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.41301  normal  0.0644501 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  26.15 
 
 		 3035 aa  78.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0364  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.44 
 
 		 938 aa  78.6  0.0000000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000435275  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2811  tetratricopeptide TPR_2  23.49 
 
 		 782 aa  77.8  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0319314  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0967  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.35 
 
 		 890 aa  75.5  0.000000000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000215323  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2406  tetratricopeptide TPR_2  25.76 
 
 		 436 aa  75.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0114  TPR repeat-containing protein  23.48 
 
 		 602 aa  75.5  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.606428  normal  0.312557 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24171  hypothetical protein  24.11 
 
 		 733 aa  75.1  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0200  TPR repeat-containing protein  25.1 
 
 		 505 aa  72.8  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4301  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.02 
 
 		 363 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.124533 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2439  TPR repeat-containing protein  22.56 
 
 		 448 aa  70.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0207467  normal  0.980065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2809  tetratricopeptide TPR_2  22.97 
 
 		 985 aa  70.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00683217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2597  hypothetical protein  22.84 
 
 		 1238 aa  70.5  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0183256  normal  0.576788 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4239  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.57 
 
 		 363 aa  70.5  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  25.06 
 
 		 573 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1653  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  20.81 
 
 		 758 aa  69.3  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1449  tetratricopeptide TPR_2  23.12 
 
 		 1067 aa  69.7  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3023  glycosyl transferase, group 1/2 family protein  27.55 
 
 		 2401 aa  68.9  0.0000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2880  hypothetical protein  30.7 
 
 		 289 aa  68.9  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  20.57 
 
 		 1056 aa  69.3  0.0000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3102  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 313 aa  68.6  0.0000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000142669  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.94 
 
 		 639 aa  68.9  0.0000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  25.59 
 
 		 1276 aa  68.9  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2231  TPR repeat-containing protein  26.51 
 
 		 265 aa  68.6  0.0000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000000660918  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  30.21 
 
 		 703 aa  68.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2072  hypothetical protein  32.86 
 
 		 288 aa  68.2  0.0000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986938 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0626  tetratricopeptide TPR_2  20.15 
 
 		 2059 aa  67.8  0.0000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00762464 
 
 
-
 
NC_004310  BR1422  competence protein ComL, putative  31.19 
 
 		 287 aa  67  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.225309  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  24.24 
 
 		 747 aa  66.6  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  29.72 
 
 		 512 aa  66.6  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1378  putative competence protein ComL  31.19 
 
 		 287 aa  67  0.000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.374682  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  22.95 
 
 		 715 aa  67  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0901  TPR repeat-containing protein  22.4 
 
 		 409 aa  65.9  0.000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0858  TPR repeat-containing protein  21.74 
 
 		 589 aa  66.2  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4362  tetratricopeptide TPR_2  23.59 
 
 		 725 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.714509 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0698  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  21.54 
 
 		 784 aa  65.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3028  TPR repeat-containing protein  30.82 
 
 		 620 aa  65.5  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.985806  normal  0.0142271 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3100  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  27.08 
 
 		 306 aa  65.5  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.425844  normal  0.735542 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.94 
 
 		 397 aa  65.1  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  26.26 
 
 		 719 aa  65.1  0.000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.84 
 
 		 632 aa  65.1  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2321  TPR repeat-containing protein  23.17 
 
 		 750 aa  64.7  0.000000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  26.17 
 
 		 648 aa  64.7  0.000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1752  competence protein ComL  30.35 
 
 		 287 aa  64.3  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2960  cellulose binding, type IV  31.25 
 
 		 952 aa  63.9  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3466  TPR repeat-containing protein  26.87 
 
 		 374 aa  64.3  0.00000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4437  glycosyl transferase family protein  28.93 
 
 		 1061 aa  63.5  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2348  putative lipoprotein  30.69 
 
 		 293 aa  63.5  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0280  TPR domain-containing protein  24.61 
 
 		 1013 aa  63.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.416311 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2843  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.69 
 
 		 281 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0736024  hitchhiker  0.007363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1653  TPR repeat-containing protein  24.66 
 
 		 466 aa  63.5  0.00000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2584  outer membrane assembly lipoprotein YfiO  30.69 
 
 		 281 aa  63.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.000140761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 3560 aa  62.8  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1225  hypothetical protein  31.64 
 
 		 941 aa  63.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  23.79 
 
 		 887 aa  63.2  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0823  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  29.87 
 
 		 296 aa  62  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0401477 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0995  tetratricopeptide TPR_2  22.96 
 
 		 614 aa  62  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.129848  normal  0.103443 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  29.45 
 
 		 1127 aa  62  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  21.9 
 
 		 1154 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  21.88 
 
 		 1486 aa  62  0.00000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0959  hypothetical protein  30.91 
 
 		 620 aa  62  0.00000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.868556 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20.8 
 
 		 3172 aa  62  0.00000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  23.53 
 
 		 395 aa  61.6  0.00000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0531  putative lipoprotein  36.27 
 
 		 236 aa  61.6  0.00000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  23.19 
 
 		 594 aa  61.2  0.00000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  26.77 
 
 		 265 aa  61.6  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  27.13 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.93 
 
 		 767 aa  61.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.6 
 
 		 1034 aa  60.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2596  hypothetical protein  32.59 
 
 		 320 aa  60.5  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  24.11 
 
 		 1252 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2712  hypothetical protein  29.91 
 
 		 304 aa  60.8  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.228832  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0996  TPR repeat-containing protein  23.64 
 
 		 634 aa  61.2  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.325764  normal  0.0470836 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>