More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2700 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  48.78 
 
 		 709 aa  638    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  49.07 
 
 		 709 aa  652    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 715 aa  1457    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  45.61 
 
 		 719 aa  569  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.46 
 
 		 747 aa  536  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  39.43 
 
 		 721 aa  466  9.999999999999999e-131  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  35.01 
 
 		 698 aa  370  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  26.46 
 
 		 797 aa  185  3e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  30.65 
 
 		 756 aa  177  8e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  27.47 
 
 		 748 aa  167  8e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  31.4 
 
 		 750 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  25.99 
 
 		 798 aa  159  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  29.54 
 
 		 750 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  30.21 
 
 		 750 aa  157  9e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  26.09 
 
 		 730 aa  150  7e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  25.58 
 
 		 729 aa  150  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  25.93 
 
 		 724 aa  147  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  30.73 
 
 		 690 aa  144  8e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  25.27 
 
 		 731 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  29.41 
 
 		 726 aa  129  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31.87 
 
 		 669 aa  128  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  28.84 
 
 		 782 aa  127  8.000000000000001e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  29.39 
 
 		 788 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  32.75 
 
 		 643 aa  126  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  29.72 
 
 		 776 aa  125  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  31.13 
 
 		 661 aa  124  4e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  43.71 
 
 		 688 aa  124  8e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  30.93 
 
 		 654 aa  123  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  29.2 
 
 		 730 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  31.72 
 
 		 735 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  31.23 
 
 		 663 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  30.42 
 
 		 730 aa  120  6e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  29.67 
 
 		 774 aa  120  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  29.33 
 
 		 774 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  29.94 
 
 		 833 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  37.96 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  30.77 
 
 		 644 aa  118  3e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  28.94 
 
 		 643 aa  118  3.9999999999999997e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  44.23 
 
 		 187 aa  118  3.9999999999999997e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  30.87 
 
 		 641 aa  117  6e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  44.2 
 
 		 804 aa  117  6.9999999999999995e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  39.63 
 
 		 190 aa  117  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  32.64 
 
 		 643 aa  117  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  32.41 
 
 		 660 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  31.46 
 
 		 641 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  30.72 
 
 		 757 aa  117  7.999999999999999e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  42.76 
 
 		 717 aa  116  1.0000000000000001e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  34.6 
 
 		 735 aa  117  1.0000000000000001e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  44 
 
 		 642 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  44 
 
 		 642 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  31.45 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  44 
 
 		 677 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  35.45 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  37.58 
 
 		 739 aa  115  3e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  24.12 
 
 		 777 aa  115  3e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  26.87 
 
 		 720 aa  115  3e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  31.38 
 
 		 709 aa  114  6e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  26.51 
 
 		 677 aa  114  6e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  27.95 
 
 		 700 aa  114  7.000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  30.72 
 
 		 760 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  39.53 
 
 		 664 aa  114  7.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  30.39 
 
 		 643 aa  114  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 		 201 aa  114  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  28.64 
 
 		 641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  40.67 
 
 		 642 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  39.46 
 
 		 735 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  29.28 
 
 		 661 aa  113  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  40.67 
 
 		 637 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  27.66 
 
 		 641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  30.29 
 
 		 576 aa  112  3e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  42.55 
 
 		 195 aa  112  3e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  29 
 
 		 686 aa  111  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  31.51 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  31.51 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  31.51 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  40.51 
 
 		 195 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  40.67 
 
 		 642 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  27.66 
 
 		 641 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  40.67 
 
 		 642 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  43.36 
 
 		 747 aa  110  8.000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  28.65 
 
 		 673 aa  110  9.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  38.56 
 
 		 800 aa  110  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  33.04 
 
 		 641 aa  109  1e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 650 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  31.51 
 
 		 641 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  28.78 
 
 		 647 aa  110  1e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  27.44 
 
 		 641 aa  110  1e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2689  Lytic transglycosylase catalytic  41.45 
 
 		 752 aa  110  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  31.51 
 
 		 641 aa  110  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  40.91 
 
 		 647 aa  109  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  27.84 
 
 		 772 aa  108  2e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  31.25 
 
 		 651 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  31.25 
 
 		 651 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  31.25 
 
 		 651 aa  108  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  27.79 
 
 		 745 aa  108  3e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  31.25 
 
 		 651 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  37.41 
 
 		 749 aa  108  3e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  31.25 
 
 		 651 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  31.25 
 
 		 651 aa  108  4e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  27.41 
 
 		 747 aa  108  4e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>