More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1648 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  94.24 
 
 		 641 aa  1214    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  93.61 
 
 		 657 aa  1209    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  79.44 
 
 		 642 aa  1051    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  80.67 
 
 		 642 aa  1051    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  94.24 
 
 		 649 aa  1217    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  85.96 
 
 		 650 aa  1126    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  75.39 
 
 		 643 aa  961    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  71.18 
 
 		 642 aa  931    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  77.34 
 
 		 660 aa  1038    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  71.5 
 
 		 642 aa  934    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 642 aa  1313    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.78 
 
 		 669 aa  362  2e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  32.1 
 
 		 663 aa  347  3e-94  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  33.86 
 
 		 643 aa  340  7e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  34.71 
 
 		 650 aa  339  7e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  34.08 
 
 		 643 aa  338  1.9999999999999998e-91  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  33.77 
 
 		 686 aa  335  2e-90  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  35.14 
 
 		 642 aa  331  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  33.7 
 
 		 641 aa  326  8.000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  33.54 
 
 		 641 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 		 641 aa  325  1e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  33.54 
 
 		 641 aa  325  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  32.87 
 
 		 649 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.23 
 
 		 641 aa  320  7e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  35.2 
 
 		 661 aa  314  3.9999999999999997e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  32 
 
 		 637 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  32.18 
 
 		 641 aa  310  5e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  32.18 
 
 		 641 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  32.03 
 
 		 641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  32.03 
 
 		 641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  32.03 
 
 		 641 aa  308  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  32.57 
 
 		 640 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  33.44 
 
 		 645 aa  307  5.0000000000000004e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  32.61 
 
 		 645 aa  300  8e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  32.85 
 
 		 643 aa  299  1e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  32.61 
 
 		 645 aa  298  2e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  32.61 
 
 		 645 aa  297  3e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  32.61 
 
 		 645 aa  297  3e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  32.61 
 
 		 645 aa  297  3e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  32.91 
 
 		 645 aa  296  8e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  32.45 
 
 		 645 aa  296  9e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  32.45 
 
 		 645 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  32.45 
 
 		 645 aa  294  3e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  32.45 
 
 		 645 aa  294  3e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  32.35 
 
 		 642 aa  293  6e-78  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  32.14 
 
 		 645 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  32.19 
 
 		 639 aa  291  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  32.19 
 
 		 639 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  31.99 
 
 		 645 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  31.99 
 
 		 645 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  31.22 
 
 		 637 aa  289  9e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  32.04 
 
 		 639 aa  289  1e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  31.83 
 
 		 645 aa  289  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  31.99 
 
 		 645 aa  287  4e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  31.09 
 
 		 644 aa  286  1.0000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.83 
 
 		 638 aa  285  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  32.52 
 
 		 643 aa  283  7.000000000000001e-75  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  32.64 
 
 		 671 aa  282  2e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  32.65 
 
 		 644 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  32.5 
 
 		 641 aa  278  2e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  31.05 
 
 		 648 aa  276  6e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  30.74 
 
 		 576 aa  275  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  29.29 
 
 		 645 aa  274  4.0000000000000004e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  31.49 
 
 		 643 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  32.64 
 
 		 661 aa  265  1e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  29.46 
 
 		 648 aa  263  8.999999999999999e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.46 
 
 		 649 aa  258  3e-67  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  30.44 
 
 		 649 aa  256  8e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  29.61 
 
 		 593 aa  252  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  29.5 
 
 		 593 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  30.77 
 
 		 654 aa  250  5e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  32.41 
 
 		 657 aa  249  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  32.67 
 
 		 716 aa  249  1e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  31.95 
 
 		 650 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  32.22 
 
 		 657 aa  241  4e-62  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  31.48 
 
 		 653 aa  239  1e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  30.66 
 
 		 655 aa  238  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  30.79 
 
 		 650 aa  238  4e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  30.09 
 
 		 661 aa  235  2.0000000000000002e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  30.33 
 
 		 657 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  30.49 
 
 		 655 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  30.86 
 
 		 650 aa  233  1e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  30.05 
 
 		 647 aa  231  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  29.83 
 
 		 693 aa  230  5e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  30.56 
 
 		 644 aa  229  8e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  29.87 
 
 		 642 aa  226  8e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  31.84 
 
 		 660 aa  226  1e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 676 aa  225  2e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  29.67 
 
 		 650 aa  225  2e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  29.56 
 
 		 650 aa  224  4.9999999999999996e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  29.82 
 
 		 650 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  29.4 
 
 		 650 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  29.82 
 
 		 650 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  29.32 
 
 		 651 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  28.97 
 
 		 707 aa  221  1.9999999999999999e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  29.87 
 
 		 607 aa  220  5e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  30.78 
 
 		 659 aa  219  1e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  29.19 
 
 		 650 aa  219  1e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  30.73 
 
 		 663 aa  218  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  29.38 
 
 		 651 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>