More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4943 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  99.53 
 
 
645 aa  1326    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  99.69 
 
 
645 aa  1329    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  86.2 
 
 
645 aa  1184    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  90.54 
 
 
645 aa  1221    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  57.99 
 
 
643 aa  764    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  99.53 
 
 
645 aa  1326    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  90.39 
 
 
645 aa  1219    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  63.74 
 
 
642 aa  862    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  99.69 
 
 
645 aa  1329    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  99.53 
 
 
645 aa  1327    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  99.53 
 
 
645 aa  1327    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  57.5 
 
 
643 aa  763    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  63.74 
 
 
639 aa  859    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  60.34 
 
 
641 aa  821    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  63.74 
 
 
639 aa  859    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  100 
 
 
645 aa  1335    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  60.81 
 
 
644 aa  824    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  99.69 
 
 
645 aa  1329    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  99.53 
 
 
645 aa  1326    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  90.23 
 
 
645 aa  1216    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  63.74 
 
 
639 aa  859    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  90.39 
 
 
645 aa  1220    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  90.39 
 
 
645 aa  1220    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  35.06 
 
 
644 aa  416  9.999999999999999e-116  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  35.34 
 
 
648 aa  408  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  34.88 
 
 
645 aa  402  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  34.84 
 
 
648 aa  400  9.999999999999999e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  31.99 
 
 
651 aa  362  1e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  31.14 
 
 
637 aa  348  2e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  33.28 
 
 
645 aa  335  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  31.46 
 
 
650 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  30 
 
 
643 aa  327  3e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.61 
 
 
638 aa  326  9e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  31.05 
 
 
641 aa  318  2e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  30.89 
 
 
641 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  30.89 
 
 
641 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  30.89 
 
 
641 aa  317  4e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  30.89 
 
 
641 aa  317  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  30.34 
 
 
649 aa  316  9e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
660 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  30.75 
 
 
642 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  30.06 
 
 
640 aa  296  7e-79  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  29.21 
 
 
641 aa  294  4e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  28.89 
 
 
641 aa  291  2e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  30.89 
 
 
641 aa  291  2e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  29.21 
 
 
641 aa  291  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  29.21 
 
 
641 aa  291  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  32.62 
 
 
650 aa  290  7e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  32.91 
 
 
643 aa  289  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  32.19 
 
 
641 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  32.19 
 
 
649 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  33.44 
 
 
642 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  32.04 
 
 
657 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  33.28 
 
 
642 aa  283  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  32.45 
 
 
642 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  31.37 
 
 
642 aa  279  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.54 
 
 
642 aa  278  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  33.69 
 
 
661 aa  271  2.9999999999999997e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  30.61 
 
 
686 aa  250  5e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  28.06 
 
 
669 aa  241  2e-62  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  31.6 
 
 
677 aa  239  1e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  29.34 
 
 
661 aa  232  2e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  30.02 
 
 
593 aa  214  4.9999999999999996e-54  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  28.65 
 
 
576 aa  214  4.9999999999999996e-54  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  30.02 
 
 
593 aa  213  9e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  30.32 
 
 
643 aa  206  1e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  26.03 
 
 
643 aa  197  6e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  23.66 
 
 
663 aa  195  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  26.88 
 
 
661 aa  196  2e-48  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  27.85 
 
 
647 aa  195  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  26.77 
 
 
651 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  26.77 
 
 
651 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  26.77 
 
 
651 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  26.77 
 
 
651 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  26.77 
 
 
651 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  26.77 
 
 
651 aa  191  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  26.77 
 
 
651 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  26.77 
 
 
651 aa  191  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  25.55 
 
 
671 aa  188  2e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  26.15 
 
 
649 aa  185  3e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  25.72 
 
 
650 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  25.99 
 
 
649 aa  182  2e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  25.72 
 
 
650 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  26.65 
 
 
657 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  27.6 
 
 
654 aa  180  7e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  26.72 
 
 
655 aa  180  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  25.65 
 
 
607 aa  178  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  25.4 
 
 
650 aa  179  2e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  26.72 
 
 
655 aa  178  3e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  24.41 
 
 
637 aa  177  8e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  25.36 
 
 
650 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  25.36 
 
 
650 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  25.36 
 
 
650 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  26.96 
 
 
716 aa  170  6e-41  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  23.98 
 
 
655 aa  169  1e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  25.99 
 
 
644 aa  162  2e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 
650 aa  158  3e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  25.74 
 
 
647 aa  158  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  25.81 
 
 
657 aa  157  6e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  25.55 
 
 
653 aa  155  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>