More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0924 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 663 aa  1375    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  30.45 
 
 		 660 aa  340  4e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  32.4 
 
 		 642 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  31.79 
 
 		 641 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  31.95 
 
 		 649 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  31.95 
 
 		 657 aa  333  8e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  32.58 
 
 		 642 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  32.74 
 
 		 642 aa  331  3e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  32.07 
 
 		 650 aa  325  1e-87  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  29.92 
 
 		 686 aa  324  4e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  31.2 
 
 		 642 aa  318  2e-85  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  30.94 
 
 		 642 aa  317  5e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  30.63 
 
 		 643 aa  313  4.999999999999999e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  29.92 
 
 		 661 aa  309  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  29.13 
 
 		 643 aa  305  2.0000000000000002e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  32.28 
 
 		 643 aa  303  9e-81  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  32.36 
 
 		 637 aa  299  1e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.35 
 
 		 669 aa  298  2e-79  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  31.84 
 
 		 637 aa  265  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  28.19 
 
 		 642 aa  259  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  29.39 
 
 		 716 aa  259  1e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  29.62 
 
 		 641 aa  254  3e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  27.75 
 
 		 648 aa  254  3e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  26.71 
 
 		 671 aa  254  5.000000000000001e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  29.62 
 
 		 641 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  29.62 
 
 		 641 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  29.46 
 
 		 641 aa  252  1e-65  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  29.46 
 
 		 641 aa  251  3e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  27.77 
 
 		 576 aa  251  3e-65  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  30.08 
 
 		 645 aa  250  7e-65  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  29.13 
 
 		 641 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  29.13 
 
 		 641 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  29.13 
 
 		 641 aa  248  3e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  28.52 
 
 		 643 aa  247  6e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  27.98 
 
 		 651 aa  246  9e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  27.13 
 
 		 643 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  28.07 
 
 		 651 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  28.07 
 
 		 651 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  28.07 
 
 		 651 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  28.07 
 
 		 651 aa  243  7e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  28.07 
 
 		 651 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  28.07 
 
 		 651 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  28.07 
 
 		 651 aa  243  1e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  28.97 
 
 		 641 aa  241  4e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  28.23 
 
 		 650 aa  241  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  26.07 
 
 		 643 aa  236  8e-61  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  28.5 
 
 		 641 aa  236  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  29.55 
 
 		 644 aa  235  2.0000000000000002e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  27.2 
 
 		 661 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  27.4 
 
 		 650 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  27.4 
 
 		 650 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  27.74 
 
 		 650 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 		 647 aa  232  2e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  26.67 
 
 		 649 aa  231  3e-59  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  27.33 
 
 		 650 aa  231  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  26.5 
 
 		 649 aa  230  5e-59  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  28.1 
 
 		 678 aa  229  1e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  27.14 
 
 		 650 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  26.5 
 
 		 655 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  27.5 
 
 		 607 aa  224  3e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  27.08 
 
 		 649 aa  224  3e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  26.66 
 
 		 650 aa  224  4e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  27.73 
 
 		 642 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  27.09 
 
 		 654 aa  221  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  27.9 
 
 		 638 aa  220  6e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  26.02 
 
 		 655 aa  219  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  26.16 
 
 		 644 aa  218  2e-55  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  26.11 
 
 		 657 aa  218  4e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  27.6 
 
 		 676 aa  217  4e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  26.04 
 
 		 593 aa  217  5e-55  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  25 
 
 		 639 aa  217  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  25 
 
 		 639 aa  217  5.9999999999999996e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  25 
 
 		 639 aa  216  8e-55  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  26.39 
 
 		 651 aa  215  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  28.31 
 
 		 628 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  26.12 
 
 		 661 aa  214  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  26.04 
 
 		 593 aa  213  7e-54  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  28.01 
 
 		 640 aa  213  1e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  23.96 
 
 		 642 aa  209  1e-52  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  27.86 
 
 		 690 aa  208  2e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  26.47 
 
 		 660 aa  207  7e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  27.81 
 
 		 657 aa  206  1e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  25.7 
 
 		 650 aa  206  1e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  27.02 
 
 		 652 aa  206  1e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  25.36 
 
 		 641 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  26.81 
 
 		 677 aa  205  2e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  26.25 
 
 		 653 aa  204  5e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  25.2 
 
 		 645 aa  203  6e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  26.39 
 
 		 693 aa  204  6e-51  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  25.55 
 
 		 650 aa  204  6e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  25.25 
 
 		 645 aa  202  1.9999999999999998e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  25.04 
 
 		 645 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  25.04 
 
 		 645 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  25.04 
 
 		 645 aa  202  1.9999999999999998e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  24.88 
 
 		 645 aa  201  5e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  24.12 
 
 		 645 aa  200  7.999999999999999e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  25.65 
 
 		 644 aa  199  2.0000000000000003e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  27.94 
 
 		 659 aa  199  2.0000000000000003e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  27.04 
 
 		 663 aa  196  8.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  23.97 
 
 		 645 aa  196  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>