More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2347 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  53.83 
 
 		 641 aa  691    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  52.42 
 
 		 641 aa  680    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  53.83 
 
 		 641 aa  690    Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  54.45 
 
 		 650 aa  693    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  53.83 
 
 		 641 aa  690    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  52.57 
 
 		 641 aa  685    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 640 aa  1330    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  53.83 
 
 		 641 aa  691    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  53.83 
 
 		 641 aa  691    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  52.35 
 
 		 643 aa  664    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  52.8 
 
 		 645 aa  674    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  53.35 
 
 		 641 aa  691    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  53.35 
 
 		 641 aa  691    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  59.1 
 
 		 642 aa  770    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  53.68 
 
 		 649 aa  702    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  53.35 
 
 		 641 aa  691    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  49.06 
 
 		 638 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  35.22 
 
 		 644 aa  347  4e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.33 
 
 		 645 aa  335  1e-90  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  31.89 
 
 		 648 aa  318  2e-85  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  33.59 
 
 		 660 aa  317  4e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.01 
 
 		 669 aa  316  7e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  33.38 
 
 		 648 aa  310  6.999999999999999e-83  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  30.76 
 
 		 645 aa  306  9.000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  30.76 
 
 		 645 aa  306  1.0000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  34.43 
 
 		 637 aa  305  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  30.76 
 
 		 645 aa  305  2.0000000000000002e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  30.76 
 
 		 645 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  30.76 
 
 		 645 aa  303  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  32.87 
 
 		 657 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  32.47 
 
 		 641 aa  301  2e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  30.39 
 
 		 645 aa  300  6e-80  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  30.39 
 
 		 645 aa  300  6e-80  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  30.39 
 
 		 645 aa  300  6e-80  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  32.42 
 
 		 642 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  30.39 
 
 		 645 aa  299  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  32.72 
 
 		 649 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  30.23 
 
 		 645 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  30.23 
 
 		 645 aa  298  2e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  30.23 
 
 		 645 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  30.23 
 
 		 645 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  32.42 
 
 		 642 aa  298  2e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  33.12 
 
 		 643 aa  298  3e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  32.58 
 
 		 642 aa  297  5e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  31.19 
 
 		 642 aa  296  6e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  30.42 
 
 		 645 aa  296  6e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  30.06 
 
 		 645 aa  296  7e-79  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  31.18 
 
 		 643 aa  296  9e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  30.95 
 
 		 643 aa  295  2e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 		 650 aa  292  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  31.72 
 
 		 642 aa  291  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.5 
 
 		 642 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  30.05 
 
 		 639 aa  290  6e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  30.4 
 
 		 639 aa  290  7e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  30.4 
 
 		 639 aa  290  8e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  31.13 
 
 		 661 aa  289  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  29.62 
 
 		 644 aa  283  5.000000000000001e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  31.82 
 
 		 643 aa  280  5e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  29.73 
 
 		 641 aa  280  7e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  29.14 
 
 		 651 aa  270  5e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  28.11 
 
 		 686 aa  258  3e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  29.4 
 
 		 637 aa  232  1e-59  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  29.67 
 
 		 643 aa  225  2e-57  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  29.43 
 
 		 576 aa  220  6e-56  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  28.01 
 
 		 663 aa  213  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  29.52 
 
 		 677 aa  204  3e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  28.9 
 
 		 593 aa  201  3e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  28.72 
 
 		 593 aa  199  2.0000000000000003e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  27.85 
 
 		 649 aa  179  2e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  25.57 
 
 		 661 aa  176  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  27.49 
 
 		 644 aa  174  5.999999999999999e-42  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  27.52 
 
 		 649 aa  172  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  26.87 
 
 		 654 aa  169  1e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  24.35 
 
 		 671 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  27.4 
 
 		 661 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  27.6 
 
 		 647 aa  156  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  25.86 
 
 		 650 aa  151  4e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  26.2 
 
 		 650 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  25.21 
 
 		 655 aa  145  2e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  27.1 
 
 		 716 aa  145  3e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  23.88 
 
 		 657 aa  144  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  25.72 
 
 		 650 aa  144  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  24.55 
 
 		 653 aa  142  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  27.13 
 
 		 653 aa  139  1e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  25.08 
 
 		 690 aa  139  1e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  24.67 
 
 		 660 aa  139  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  23.88 
 
 		 655 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  24.35 
 
 		 628 aa  138  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  24.68 
 
 		 652 aa  134  5e-30  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  25 
 
 		 657 aa  134  6e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  23.76 
 
 		 678 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  24.28 
 
 		 642 aa  130  8.000000000000001e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  29.12 
 
 		 663 aa  130  9.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  28.96 
 
 		 657 aa  130  1.0000000000000001e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  23.93 
 
 		 655 aa  128  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  25.04 
 
 		 707 aa  126  1e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  30.06 
 
 		 659 aa  124  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  29.81 
 
 		 647 aa  124  5e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  24.96 
 
 		 693 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  24.05 
 
 		 651 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>