More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3413 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  66.72 
 
 
649 aa  860    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  74.06 
 
 
647 aa  952    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  66.72 
 
 
649 aa  857    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
661 aa  1333    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  34.57 
 
 
661 aa  290  4e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  30.22 
 
 
686 aa  259  2e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  30.7 
 
 
643 aa  245  1.9999999999999999e-63  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  28.47 
 
 
643 aa  244  5e-63  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.52 
 
 
669 aa  239  1e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  29.36 
 
 
637 aa  238  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  30.86 
 
 
641 aa  237  7e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  30.36 
 
 
642 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  30.46 
 
 
649 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  30.53 
 
 
657 aa  233  9e-60  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  30.62 
 
 
642 aa  233  9e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  30.45 
 
 
642 aa  231  5e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  30.25 
 
 
650 aa  230  7e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  30.53 
 
 
654 aa  223  9e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  28.86 
 
 
642 aa  223  9.999999999999999e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  28.84 
 
 
660 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  28.71 
 
 
642 aa  220  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  28.86 
 
 
642 aa  220  6e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  26.47 
 
 
663 aa  218  2e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  29.48 
 
 
643 aa  218  4e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  28.99 
 
 
671 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  28.48 
 
 
639 aa  213  7e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  28.75 
 
 
644 aa  213  7e-54  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  28.48 
 
 
639 aa  213  1e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  28.37 
 
 
639 aa  212  2e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  28.32 
 
 
637 aa  212  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  28.91 
 
 
576 aa  211  5e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  31.2 
 
 
647 aa  209  1e-52  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  29.08 
 
 
643 aa  207  3e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  29.65 
 
 
650 aa  207  4e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  27.17 
 
 
593 aa  205  2e-51  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  28.62 
 
 
661 aa  205  2e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  28.27 
 
 
641 aa  205  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  27.14 
 
 
593 aa  204  5e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  29.95 
 
 
650 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  27.72 
 
 
644 aa  200  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 
645 aa  199  1.0000000000000001e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  29.24 
 
 
650 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  26.88 
 
 
645 aa  199  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  27.04 
 
 
645 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  26.88 
 
 
645 aa  198  3e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  26.88 
 
 
645 aa  198  3e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  26.88 
 
 
645 aa  198  3e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  26.88 
 
 
645 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  26.88 
 
 
645 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  26.88 
 
 
645 aa  197  4.0000000000000005e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  26.88 
 
 
645 aa  197  5.000000000000001e-49  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  28.66 
 
 
645 aa  196  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  26.97 
 
 
643 aa  196  1e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  29.08 
 
 
651 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  29.08 
 
 
651 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  29.08 
 
 
651 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  29.08 
 
 
651 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  29.08 
 
 
651 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  29.08 
 
 
651 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  29.08 
 
 
651 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  28.71 
 
 
655 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  28.71 
 
 
655 aa  194  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 
645 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 
645 aa  194  4e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 
645 aa  194  5e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  27.67 
 
 
642 aa  194  5e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  29.28 
 
 
657 aa  194  5e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  28.39 
 
 
645 aa  192  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  28.91 
 
 
651 aa  191  4e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  28.95 
 
 
650 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  28.95 
 
 
650 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  27.93 
 
 
716 aa  189  2e-46  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  26.66 
 
 
648 aa  189  2e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  30.21 
 
 
653 aa  188  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  29.26 
 
 
607 aa  186  8e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  29.05 
 
 
650 aa  186  8e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  29.26 
 
 
650 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  28.24 
 
 
643 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  28.27 
 
 
655 aa  185  2.0000000000000003e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  27.8 
 
 
653 aa  183  7e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  26.9 
 
 
649 aa  182  1e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  28.93 
 
 
645 aa  182  1e-44  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  28.29 
 
 
650 aa  182  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  27.84 
 
 
650 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  28.69 
 
 
663 aa  179  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  28.16 
 
 
650 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  28.33 
 
 
660 aa  174  5.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  28.66 
 
 
677 aa  173  9e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  28.91 
 
 
707 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  27.4 
 
 
640 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  26.16 
 
 
648 aa  170  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  27.32 
 
 
678 aa  169  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  25.28 
 
 
644 aa  169  2e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  28.05 
 
 
657 aa  168  2.9999999999999998e-40  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  26.52 
 
 
659 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  29.62 
 
 
676 aa  166  2.0000000000000002e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  28.23 
 
 
628 aa  162  2e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  28.81 
 
 
638 aa  161  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  27.88 
 
 
693 aa  161  4e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  27.2 
 
 
642 aa  160  6e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>