More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3610 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  98.92 
 
 		 657 aa  1319    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  79.11 
 
 		 642 aa  1039    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  70.25 
 
 		 642 aa  910    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  80.13 
 
 		 642 aa  1040    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  84.28 
 
 		 650 aa  1123    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  98.44 
 
 		 641 aa  1298    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  94.24 
 
 		 642 aa  1211    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 649 aa  1332    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  74.84 
 
 		 643 aa  942    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  70.56 
 
 		 642 aa  912    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  76.24 
 
 		 660 aa  1023    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  34.46 
 
 		 669 aa  355  2e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  31.36 
 
 		 663 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  34.12 
 
 		 643 aa  342  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  33.02 
 
 		 686 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  33.92 
 
 		 643 aa  334  3e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  33.81 
 
 		 650 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  33.92 
 
 		 642 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  32.81 
 
 		 641 aa  316  7e-85  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  32.04 
 
 		 649 aa  314  3.9999999999999997e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  31.75 
 
 		 641 aa  313  9e-84  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  32.18 
 
 		 641 aa  312  1e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  32.18 
 
 		 641 aa  311  2e-83  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  34.93 
 
 		 661 aa  309  9e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  33.64 
 
 		 645 aa  309  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 		 641 aa  307  3e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.17 
 
 		 641 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  32.08 
 
 		 641 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 		 641 aa  307  5.0000000000000004e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  32.23 
 
 		 641 aa  306  6e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 		 641 aa  306  7e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  32.16 
 
 		 637 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  33.23 
 
 		 640 aa  305  1.0000000000000001e-81  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  32.5 
 
 		 645 aa  300  6e-80  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  32.5 
 
 		 645 aa  299  1e-79  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  32.5 
 
 		 645 aa  298  2e-79  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  32.5 
 
 		 645 aa  298  2e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  32.5 
 
 		 645 aa  298  2e-79  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  32.15 
 
 		 642 aa  298  3e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  32.35 
 
 		 645 aa  296  6e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  32.35 
 
 		 645 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  32.35 
 
 		 645 aa  295  2e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  32.35 
 
 		 645 aa  295  2e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  32.91 
 
 		 645 aa  294  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  32.3 
 
 		 643 aa  292  1e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  31.83 
 
 		 645 aa  292  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  31.68 
 
 		 645 aa  291  3e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  31.68 
 
 		 645 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  31.52 
 
 		 645 aa  290  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  30.84 
 
 		 637 aa  288  2e-76  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  31.68 
 
 		 645 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  31.15 
 
 		 639 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  31.15 
 
 		 639 aa  284  4.0000000000000003e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  31.15 
 
 		 639 aa  284  5.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  32.21 
 
 		 643 aa  282  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.36 
 
 		 644 aa  282  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.5 
 
 		 638 aa  281  3e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  31.13 
 
 		 671 aa  279  1e-73  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  30.85 
 
 		 576 aa  276  1.0000000000000001e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  31.19 
 
 		 644 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  30.73 
 
 		 648 aa  274  3e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  31.2 
 
 		 641 aa  274  4.0000000000000004e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  29.15 
 
 		 645 aa  270  7e-71  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  31.18 
 
 		 643 aa  269  2e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  32.37 
 
 		 661 aa  267  4e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  29.46 
 
 		 648 aa  263  6e-69  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  30.88 
 
 		 654 aa  251  4e-65  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.5 
 
 		 649 aa  249  7e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  30.35 
 
 		 649 aa  248  2e-64  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  29.61 
 
 		 593 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  29.5 
 
 		 593 aa  248  2e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  30.97 
 
 		 650 aa  241  2.9999999999999997e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31.74 
 
 		 716 aa  241  4e-62  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  31.44 
 
 		 657 aa  234  3e-60  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  30.3 
 
 		 647 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  30.39 
 
 		 661 aa  233  6e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  29.98 
 
 		 650 aa  229  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  29.35 
 
 		 657 aa  228  3e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  30.25 
 
 		 653 aa  226  7e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  29.62 
 
 		 655 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  31.26 
 
 		 657 aa  226  2e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  30.28 
 
 		 644 aa  224  4.9999999999999996e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  29.9 
 
 		 650 aa  223  9e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  29.62 
 
 		 655 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  28.94 
 
 		 650 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  29.24 
 
 		 642 aa  219  1e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  28.64 
 
 		 650 aa  219  1e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  29.11 
 
 		 650 aa  218  2e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  29.39 
 
 		 650 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  29.39 
 
 		 650 aa  218  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  29.92 
 
 		 693 aa  217  4e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  31.41 
 
 		 677 aa  217  5e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  29.35 
 
 		 607 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  29.87 
 
 		 651 aa  216  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  31.83 
 
 		 660 aa  215  1.9999999999999998e-54  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  29.39 
 
 		 676 aa  214  2.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  28.75 
 
 		 650 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  30.21 
 
 		 659 aa  212  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  29.78 
 
 		 651 aa  210  6e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  29.78 
 
 		 651 aa  210  6e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>