More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1778 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  100 
 
 		 669 aa  1387    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  36.68 
 
 		 660 aa  394  1e-108  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  35.33 
 
 		 643 aa  359  7e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  35.12 
 
 		 650 aa  355  2e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  34.85 
 
 		 642 aa  355  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  35.12 
 
 		 641 aa  353  4e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  35.78 
 
 		 642 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  35.78 
 
 		 642 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  34.41 
 
 		 642 aa  352  1e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  34.63 
 
 		 657 aa  348  2e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  34.63 
 
 		 649 aa  348  3e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  34.04 
 
 		 642 aa  346  6e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  32.47 
 
 		 641 aa  329  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  32.83 
 
 		 641 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  34.4 
 
 		 645 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  32.16 
 
 		 641 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  32.83 
 
 		 641 aa  327  4.0000000000000003e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  32.37 
 
 		 641 aa  326  1e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  32.01 
 
 		 641 aa  325  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  31.47 
 
 		 641 aa  323  4e-87  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  32.37 
 
 		 641 aa  323  8e-87  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  32.48 
 
 		 650 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  32.22 
 
 		 641 aa  322  1.9999999999999998e-86  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  31.84 
 
 		 686 aa  320  6e-86  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  34.07 
 
 		 643 aa  318  2e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.7 
 
 		 641 aa  318  3e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  34.01 
 
 		 640 aa  316  8e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  32.3 
 
 		 637 aa  311  2e-83  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  33.9 
 
 		 661 aa  310  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  32.11 
 
 		 637 aa  308  2.0000000000000002e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  31.65 
 
 		 649 aa  307  4.0000000000000004e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.49 
 
 		 638 aa  302  1e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 663 aa  298  2e-79  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  31.44 
 
 		 643 aa  298  3e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  31.23 
 
 		 642 aa  295  1e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  32.14 
 
 		 648 aa  292  1e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  31.09 
 
 		 644 aa  292  1e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  31.64 
 
 		 648 aa  292  2e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  31.29 
 
 		 645 aa  289  1e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  34.49 
 
 		 576 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  32.06 
 
 		 643 aa  280  8e-74  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  30.29 
 
 		 643 aa  277  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  29.94 
 
 		 639 aa  270  5e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  29.94 
 
 		 639 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  29.94 
 
 		 639 aa  269  1e-70  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  30.23 
 
 		 644 aa  269  2e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  31.38 
 
 		 643 aa  267  5.999999999999999e-70  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  31.59 
 
 		 661 aa  267  5.999999999999999e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  30.08 
 
 		 641 aa  263  8.999999999999999e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  32.13 
 
 		 593 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  31.96 
 
 		 593 aa  251  2e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  29.43 
 
 		 642 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  28.23 
 
 		 645 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  28.23 
 
 		 645 aa  243  6e-63  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  28.23 
 
 		 645 aa  243  6e-63  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  28.23 
 
 		 645 aa  243  7.999999999999999e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  28.06 
 
 		 645 aa  242  2e-62  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  28.06 
 
 		 645 aa  242  2e-62  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  28.06 
 
 		 645 aa  242  2e-62  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  28.06 
 
 		 645 aa  242  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  28.06 
 
 		 645 aa  241  2e-62  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  28.66 
 
 		 645 aa  241  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 		 645 aa  240  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 		 645 aa  240  6.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  28.03 
 
 		 645 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  28.5 
 
 		 645 aa  239  1e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  28.53 
 
 		 645 aa  236  9e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  30.59 
 
 		 661 aa  236  1.0000000000000001e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  30.41 
 
 		 649 aa  235  2.0000000000000002e-60  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.07 
 
 		 649 aa  234  4.0000000000000004e-60  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  30.05 
 
 		 647 aa  226  9e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  29.5 
 
 		 654 aa  223  7e-57  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  30.45 
 
 		 677 aa  222  9.999999999999999e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  27.83 
 
 		 651 aa  221  3e-56  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  26.83 
 
 		 671 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  28.69 
 
 		 644 aa  211  3e-53  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  28.79 
 
 		 716 aa  199  9e-50  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  26.24 
 
 		 642 aa  199  1.0000000000000001e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  27.6 
 
 		 650 aa  187  6e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  26.57 
 
 		 647 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  28.31 
 
 		 678 aa  185  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  27.33 
 
 		 650 aa  182  1e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  28.21 
 
 		 650 aa  180  8e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  27.97 
 
 		 650 aa  180  9e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  25.84 
 
 		 655 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  26.56 
 
 		 657 aa  177  7e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  25.99 
 
 		 650 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  25.99 
 
 		 650 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  27.02 
 
 		 651 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  27.02 
 
 		 651 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  27.02 
 
 		 651 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  27.02 
 
 		 651 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  27.02 
 
 		 651 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  27.02 
 
 		 651 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  27.02 
 
 		 651 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  25.86 
 
 		 653 aa  174  5e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  26.51 
 
 		 607 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  26.84 
 
 		 650 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  26.68 
 
 		 650 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  25.82 
 
 		 650 aa  172  1e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>