More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_0176 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  57.84 
 
 		 651 aa  699    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  69.31 
 
 		 650 aa  916    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  57.84 
 
 		 651 aa  699    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  57.84 
 
 		 651 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  57.84 
 
 		 651 aa  699    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  83.05 
 
 		 653 aa  1092    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  57.84 
 
 		 651 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  58.69 
 
 		 607 aa  710    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  68.69 
 
 		 650 aa  906    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  56.51 
 
 		 655 aa  703    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  57.81 
 
 		 651 aa  700    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  53.74 
 
 		 652 aa  687    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  55.03 
 
 		 628 aa  692    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  58.44 
 
 		 650 aa  709    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  56.03 
 
 		 655 aa  699    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 655 aa  1341    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  57.3 
 
 		 657 aa  711    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  58.28 
 
 		 650 aa  706    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  68.85 
 
 		 650 aa  907    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  57.99 
 
 		 650 aa  717    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  58.28 
 
 		 650 aa  706    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  57.84 
 
 		 651 aa  699    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  58.77 
 
 		 650 aa  723    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  57.84 
 
 		 651 aa  699    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  59.42 
 
 		 650 aa  710    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  43.26 
 
 		 659 aa  452  1.0000000000000001e-126  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  40.77 
 
 		 642 aa  442  9.999999999999999e-123  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  42.88 
 
 		 676 aa  441  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  42.66 
 
 		 660 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  42.02 
 
 		 657 aa  437  1e-121  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  42.14 
 
 		 678 aa  433  1e-120  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  38.9 
 
 		 653 aa  432  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  41.71 
 
 		 657 aa  422  1e-116  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  39.55 
 
 		 707 aa  411  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  40.25 
 
 		 663 aa  412  1e-113  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  38.18 
 
 		 693 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  34.93 
 
 		 671 aa  362  1e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  36.13 
 
 		 644 aa  360  6e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  38.13 
 
 		 690 aa  357  2.9999999999999997e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  37.12 
 
 		 654 aa  354  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 647 aa  345  1e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  37.9 
 
 		 735 aa  216  9e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  37.16 
 
 		 706 aa  215  1.9999999999999998e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  37.8 
 
 		 739 aa  215  2.9999999999999995e-54  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  29.35 
 
 		 660 aa  211  3e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29.53 
 
 		 642 aa  203  9e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  30.68 
 
 		 642 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  29.4 
 
 		 650 aa  200  6e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  28.12 
 
 		 661 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0658  soluble lytic murein transglycosylase precursor  27.5 
 
 		 644 aa  196  9e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.597018  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  28.48 
 
 		 642 aa  195  3e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  29.55 
 
 		 641 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  28.91 
 
 		 649 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  28.48 
 
 		 657 aa  189  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  29.82 
 
 		 642 aa  189  2e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  28.33 
 
 		 645 aa  188  2e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  24.8 
 
 		 663 aa  187  4e-46  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  30.37 
 
 		 642 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  29.7 
 
 		 643 aa  185  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  28.02 
 
 		 643 aa  181  4.999999999999999e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  26.01 
 
 		 641 aa  178  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  28.11 
 
 		 661 aa  178  3e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  25.84 
 
 		 669 aa  177  4e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  26.72 
 
 		 643 aa  177  5e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  26.6 
 
 		 643 aa  177  6e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  25.85 
 
 		 641 aa  177  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  25.85 
 
 		 641 aa  177  8e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  33.43 
 
 		 686 aa  173  7.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  26.05 
 
 		 641 aa  171  3e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  23.98 
 
 		 645 aa  170  7e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  23.98 
 
 		 645 aa  170  7e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  25.7 
 
 		 641 aa  170  7e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  23.98 
 
 		 645 aa  170  7e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  23.98 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  23.98 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  23.98 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  23.98 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  23.98 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  23.98 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  33.23 
 
 		 637 aa  169  1e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  24.6 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  24.27 
 
 		 645 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  24.27 
 
 		 645 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  24.27 
 
 		 645 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  26.55 
 
 		 648 aa  168  2.9999999999999998e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  24.27 
 
 		 645 aa  168  2.9999999999999998e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  27.08 
 
 		 649 aa  168  2.9999999999999998e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  25.21 
 
 		 641 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  24.27 
 
 		 645 aa  167  4e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  28.45 
 
 		 649 aa  167  5.9999999999999996e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 716 aa  166  8e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  25.04 
 
 		 641 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  25.04 
 
 		 641 aa  166  9e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  25.57 
 
 		 644 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  25.2 
 
 		 639 aa  165  2.0000000000000002e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  25.73 
 
 		 641 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  24.88 
 
 		 639 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  25.08 
 
 		 639 aa  165  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  26.49 
 
 		 647 aa  164  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  25.04 
 
 		 641 aa  163  9e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>