More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_2092 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  50.3 
 
 		 730 aa  640    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  46.45 
 
 		 724 aa  646    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  50.15 
 
 		 730 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 720 aa  1469    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  47.52 
 
 		 731 aa  627  1e-178  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  46.69 
 
 		 735 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  44.94 
 
 		 729 aa  595  1e-168  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  36.99 
 
 		 690 aa  378  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  28.59 
 
 		 677 aa  201  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2068  soluble lytic transglycosylase  25.12 
 
 		 700 aa  167  6.9999999999999995e-40  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  25.83 
 
 		 681 aa  150  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  26.04 
 
 		 730 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  31.23 
 
 		 709 aa  124  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  30.67 
 
 		 721 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  41.26 
 
 		 663 aa  120  6e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  28.86 
 
 		 698 aa  120  6e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  29.93 
 
 		 709 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  27.91 
 
 		 750 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  27.67 
 
 		 750 aa  118  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.87 
 
 		 642 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  34.94 
 
 		 748 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  39.87 
 
 		 642 aa  117  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  28.16 
 
 		 747 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  39.87 
 
 		 657 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  39.87 
 
 		 642 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 		 650 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 		 649 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  39.87 
 
 		 641 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  36.14 
 
 		 659 aa  115  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  25.84 
 
 		 797 aa  115  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  26.87 
 
 		 715 aa  115  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  36.36 
 
 		 645 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 		 645 aa  114  5e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  36.36 
 
 		 645 aa  114  5e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 645 aa  114  5e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  39.26 
 
 		 628 aa  114  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 645 aa  114  5e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 645 aa  114  5e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  26.99 
 
 		 782 aa  114  5e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 645 aa  114  5e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 645 aa  114  5e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 		 645 aa  114  5e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  39.58 
 
 		 645 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  39.58 
 
 		 645 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  39.58 
 
 		 645 aa  114  7.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  37.91 
 
 		 645 aa  114  7.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  39.58 
 
 		 645 aa  114  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  39.58 
 
 		 645 aa  114  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 		 707 aa  114  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  28.1 
 
 		 719 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  43.26 
 
 		 645 aa  113  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  40.28 
 
 		 643 aa  113  1.0000000000000001e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  38.69 
 
 		 642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  38.27 
 
 		 693 aa  113  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  38.69 
 
 		 642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  40.38 
 
 		 648 aa  112  2.0000000000000002e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  38.19 
 
 		 639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  38.19 
 
 		 639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  38.19 
 
 		 639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  35.67 
 
 		 756 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  37.74 
 
 		 798 aa  112  3e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 		 660 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  38.56 
 
 		 651 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  38.56 
 
 		 651 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  38.56 
 
 		 651 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  38.56 
 
 		 651 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  38.56 
 
 		 651 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  38.56 
 
 		 651 aa  111  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  38.56 
 
 		 651 aa  111  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  38.56 
 
 		 651 aa  111  6e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  36.59 
 
 		 750 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 642 aa  110  7.000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  37.25 
 
 		 643 aa  110  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  29.05 
 
 		 777 aa  110  7.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  39.86 
 
 		 739 aa  110  9.000000000000001e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  39.58 
 
 		 643 aa  110  9.000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  36.36 
 
 		 688 aa  110  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  34.76 
 
 		 653 aa  110  1e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  38.65 
 
 		 652 aa  110  1e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  37.87 
 
 		 643 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  41.96 
 
 		 706 aa  109  2e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  35.95 
 
 		 179 aa  109  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  35.8 
 
 		 657 aa  108  3e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  36.48 
 
 		 660 aa  108  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  35.8 
 
 		 657 aa  108  4e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  36.42 
 
 		 678 aa  108  4e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  39.16 
 
 		 735 aa  108  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.74 
 
 		 638 aa  108  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  40.12 
 
 		 643 aa  107  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  41.13 
 
 		 648 aa  107  6e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  35.58 
 
 		 650 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 644 aa  107  7e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  37.5 
 
 		 641 aa  107  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 		 650 aa  107  8e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  40.28 
 
 		 671 aa  107  9e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  36.2 
 
 		 686 aa  107  9e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 650 aa  107  9e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  38.61 
 
 		 650 aa  106  1e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  40.85 
 
 		 669 aa  105  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  39.22 
 
 		 655 aa  105  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>