More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1484 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  100 
 
 		 747 aa  1503    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  54.94 
 
 		 719 aa  734    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  43.72 
 
 		 715 aa  535  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  42 
 
 		 709 aa  523  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  41.57 
 
 		 709 aa  512  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  38.69 
 
 		 721 aa  419  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  35.74 
 
 		 698 aa  360  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  30.24 
 
 		 750 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  29.64 
 
 		 750 aa  156  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  28.88 
 
 		 730 aa  157  1e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  29.51 
 
 		 750 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  30.62 
 
 		 748 aa  154  8e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  29 
 
 		 798 aa  152  3e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  30.13 
 
 		 756 aa  146  1e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  24.69 
 
 		 724 aa  135  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5914  Lytic transglycosylase catalytic  24.3 
 
 		 797 aa  135  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  30.88 
 
 		 782 aa  128  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  29.26 
 
 		 690 aa  125  3e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  27.34 
 
 		 730 aa  123  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 		 628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  29.34 
 
 		 730 aa  122  3e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  28.77 
 
 		 663 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  33.68 
 
 		 652 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  26.01 
 
 		 731 aa  118  5e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  31.41 
 
 		 645 aa  117  8.999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  30.67 
 
 		 661 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  31 
 
 		 669 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  28.16 
 
 		 720 aa  116  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  33.11 
 
 		 660 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  25.72 
 
 		 777 aa  114  5e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  31.55 
 
 		 655 aa  114  9e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  40.59 
 
 		 637 aa  113  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  27.82 
 
 		 735 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  30.45 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  30.84 
 
 		 642 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  29.29 
 
 		 673 aa  112  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  33.22 
 
 		 651 aa  112  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  30.59 
 
 		 637 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  27.6 
 
 		 661 aa  111  5e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  33.22 
 
 		 651 aa  111  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.06 
 
 		 638 aa  110  6e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  33.22 
 
 		 651 aa  111  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  33.22 
 
 		 651 aa  111  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  33.22 
 
 		 651 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  33.22 
 
 		 651 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  33.22 
 
 		 651 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  33.22 
 
 		 651 aa  110  7.000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  29.63 
 
 		 641 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  32.42 
 
 		 661 aa  110  8.000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  30.82 
 
 		 655 aa  110  9.000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  30.13 
 
 		 649 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  44.2 
 
 		 804 aa  110  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  30.82 
 
 		 657 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1597  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.67 
 
 		 651 aa  108  3e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.116163  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  36.81 
 
 		 643 aa  108  4e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  30.84 
 
 		 642 aa  108  4e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  31.02 
 
 		 650 aa  108  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  30.91 
 
 		 654 aa  107  7e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 195 aa  107  8e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  30.17 
 
 		 650 aa  107  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  36.18 
 
 		 593 aa  106  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  41.67 
 
 		 664 aa  106  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  31.88 
 
 		 677 aa  107  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  31.67 
 
 		 650 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  36.18 
 
 		 593 aa  106  2e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  30.89 
 
 		 647 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  31.67 
 
 		 650 aa  106  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  32.89 
 
 		 607 aa  105  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  29.6 
 
 		 640 aa  105  3e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  27.02 
 
 		 808 aa  105  4e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  32.56 
 
 		 650 aa  104  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  26.52 
 
 		 686 aa  104  5e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  37.84 
 
 		 642 aa  104  6e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  28.53 
 
 		 681 aa  104  6e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  32.56 
 
 		 650 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  32.56 
 
 		 650 aa  104  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  27.22 
 
 		 645 aa  104  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  27.22 
 
 		 645 aa  104  7e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  27.22 
 
 		 645 aa  104  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  29.8 
 
 		 642 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  30.9 
 
 		 643 aa  104  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  31.94 
 
 		 603 aa  104  8e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  31.33 
 
 		 650 aa  104  8e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  27.22 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  27.22 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  39.87 
 
 		 187 aa  103  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 201 aa  103  1e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  27.22 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  27.22 
 
 		 645 aa  103  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  31.33 
 
 		 650 aa  102  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03735  putative soluble lytic murein transglycosylase  27.73 
 
 		 576 aa  102  2e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  27.22 
 
 		 645 aa  103  2e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  27.22 
 
 		 645 aa  103  2e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  32.05 
 
 		 800 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  28.28 
 
 		 643 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  31.53 
 
 		 642 aa  102  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  32.49 
 
 		 641 aa  102  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  28.39 
 
 		 648 aa  102  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  38.51 
 
 		 642 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  32.43 
 
 		 642 aa  101  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>