More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1439 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 187 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  43.9 
 
 		 201 aa  153  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  38.3 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 182 aa  143  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  40.88 
 
 		 181 aa  134  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  40.88 
 
 		 181 aa  134  9e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  45.16 
 
 		 193 aa  132  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  40.53 
 
 		 219 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  45.03 
 
 		 197 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 195 aa  129  2.0000000000000002e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 		 166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 190 aa  124  6e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  38.8 
 
 		 199 aa  124  1e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  45.06 
 
 		 188 aa  123  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  42.76 
 
 		 214 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  41.06 
 
 		 729 aa  120  1.9999999999999998e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  39.1 
 
 		 179 aa  118  3.9999999999999996e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  39.74 
 
 		 731 aa  117  9.999999999999999e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  38.98 
 
 		 187 aa  115  3e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 748 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 730 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  37.91 
 
 		 735 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  40.13 
 
 		 719 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 730 aa  112  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  37.02 
 
 		 218 aa  112  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  36.13 
 
 		 603 aa  110  8.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  37.18 
 
 		 690 aa  110  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  38.06 
 
 		 777 aa  106  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  36.6 
 
 		 833 aa  105  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  38.96 
 
 		 721 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  46.38 
 
 		 672 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  39.19 
 
 		 690 aa  105  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  37.91 
 
 		 709 aa  105  5e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  39.47 
 
 		 756 aa  105  5e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.87 
 
 		 747 aa  105  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 724 aa  104  7e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  36.65 
 
 		 715 aa  103  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  34.62 
 
 		 678 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  40.54 
 
 		 669 aa  103  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  41.79 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  35.8 
 
 		 663 aa  103  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  40.54 
 
 		 206 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  38.82 
 
 		 750 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  35.95 
 
 		 709 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  39.18 
 
 		 649 aa  102  4e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  38.82 
 
 		 750 aa  102  4e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  34.76 
 
 		 660 aa  102  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  41.38 
 
 		 204 aa  101  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  38.6 
 
 		 649 aa  101  8e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  38.16 
 
 		 750 aa  101  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  35.19 
 
 		 657 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  35.19 
 
 		 657 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  41.38 
 
 		 203 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  41.38 
 
 		 204 aa  100  1e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  39.33 
 
 		 661 aa  100  2e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  33.94 
 
 		 653 aa  99  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  44 
 
 		 207 aa  98.6  5e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  43.7 
 
 		 679 aa  98.2  6e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  41.91 
 
 		 682 aa  97.8  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  40 
 
 		 202 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  36.42 
 
 		 698 aa  97.4  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  33.54 
 
 		 693 aa  96.7  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  36.31 
 
 		 300 aa  96.3  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  34.44 
 
 		 730 aa  96.3  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  40.58 
 
 		 212 aa  95.9  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  34.64 
 
 		 800 aa  95.9  3e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  40.27 
 
 		 643 aa  95.5  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 		 292 aa  95.5  4e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  38.26 
 
 		 243 aa  95.5  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  35.53 
 
 		 218 aa  95.5  4e-19  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  36.65 
 
 		 637 aa  95.5  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  33.95 
 
 		 659 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  35.58 
 
 		 664 aa  95.1  5e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 798 aa  95.1  5e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  35.17 
 
 		 661 aa  95.1  5e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  40.56 
 
 		 279 aa  94.4  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  42.5 
 
 		 282 aa  94  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  35.03 
 
 		 166 aa  94.4  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 198 aa  94  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  33.76 
 
 		 782 aa  93.6  2e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 739 aa  93.2  2e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  34.81 
 
 		 663 aa  92.8  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2149  lytic transglycosylase, catalytic  41.06 
 
 		 191 aa  92.8  2e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.213234  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  33.99 
 
 		 654 aa  92.8  3e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  38.51 
 
 		 638 aa  92.8  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  35.17 
 
 		 677 aa  92  4e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 		 374 aa  92  4e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 735 aa  92  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  35.09 
 
 		 661 aa  92  4e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  34.42 
 
 		 774 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  34.59 
 
 		 673 aa  91.7  5e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  34.42 
 
 		 774 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 776 aa  91.7  5e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  40.58 
 
 		 235 aa  91.7  6e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  44.12 
 
 		 198 aa  91.3  7e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1341  lytic transglycosylase, catalytic  41.35 
 
 		 281 aa  91.3  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0557803  normal  0.620551 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  39.39 
 
 		 640 aa  91.3  7e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1154  lytic transglycosylase, catalytic  39.71 
 
 		 283 aa  91.3  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.40288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  34.84 
 
 		 651 aa  91.3  8e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2981  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 438 aa  91.3  8e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>