More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_2874 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
214 aa  427  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  39.04 
 
 
199 aa  131  9e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  45.95 
 
 
193 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  42.68 
 
 
190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  49.03 
 
 
166 aa  124  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  42.76 
 
 
187 aa  122  5e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  43.05 
 
 
179 aa  120  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  36.92 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  41.72 
 
 
187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  37.75 
 
 
201 aa  112  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  36.84 
 
 
219 aa  111  7.000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  36.46 
 
 
195 aa  111  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  47.59 
 
 
649 aa  109  2.0000000000000002e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  47.33 
 
 
182 aa  109  4.0000000000000004e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  46.9 
 
 
649 aa  108  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  41.82 
 
 
690 aa  108  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  41.72 
 
 
197 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 
735 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  36.25 
 
 
724 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  44.16 
 
 
721 aa  103  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  41.78 
 
 
663 aa  102  4e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  43.18 
 
 
654 aa  102  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  38.75 
 
 
653 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  43.06 
 
 
715 aa  101  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  36.94 
 
 
731 aa  99.4  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  38.41 
 
 
637 aa  99.4  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 
188 aa  99  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 
661 aa  98.6  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  38.71 
 
 
660 aa  98.6  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  33.33 
 
 
181 aa  98.6  6e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  32.79 
 
 
181 aa  98.2  7e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  36.77 
 
 
678 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  38.16 
 
 
729 aa  97.4  1e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  36.77 
 
 
693 aa  97.1  2e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 
730 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 
730 aa  96.3  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  36.42 
 
 
603 aa  95.5  5e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  37.76 
 
 
671 aa  95.1  6e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  40.28 
 
 
686 aa  95.1  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  42.68 
 
 
207 aa  95.1  8e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  42.36 
 
 
719 aa  94.4  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  36.13 
 
 
659 aa  94  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  37.42 
 
 
657 aa  93.2  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  39.35 
 
 
690 aa  93.2  3e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  37.42 
 
 
657 aa  93.2  3e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  42.03 
 
 
663 aa  93.2  3e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  36.49 
 
 
644 aa  92.8  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  40.28 
 
 
643 aa  93.2  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  36.99 
 
 
706 aa  92.4  4e-18  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  41.61 
 
 
716 aa  92.4  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 
204 aa  92  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 
777 aa  92  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  38.19 
 
 
642 aa  92  6e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  36 
 
 
218 aa  91.7  7e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  38.19 
 
 
642 aa  91.7  7e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  34.69 
 
 
642 aa  90.9  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  37.33 
 
 
647 aa  90.9  1e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  40.67 
 
 
203 aa  90.9  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  36.88 
 
 
709 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 
660 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  36.65 
 
 
709 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  35.58 
 
 
648 aa  90.5  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1608  lytic transglycosylase, catalytic  41.26 
 
 
206 aa  89.4  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  39.58 
 
 
661 aa  89.4  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  38.1 
 
 
204 aa  89.4  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  40.97 
 
 
647 aa  89  5e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  45.04 
 
 
196 aa  89  5e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 
707 aa  89  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  40.69 
 
 
206 aa  88.6  7e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  42.47 
 
 
669 aa  88.6  7e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  38.93 
 
 
747 aa  88.2  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  36.48 
 
 
643 aa  88.2  8e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  34.36 
 
 
645 aa  88.2  8e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  39.46 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  36.81 
 
 
657 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 
739 aa  86.7  2e-16  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 
649 aa  86.7  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  43.17 
 
 
241 aa  86.3  3e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  34.25 
 
 
735 aa  86.7  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  40.6 
 
 
233 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  36.81 
 
 
641 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  41.61 
 
 
204 aa  86.3  3e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1300  Lytic transglycosylase catalytic  38.89 
 
 
218 aa  85.9  4e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0023245  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 
782 aa  85.9  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4660  transglycosylase SLT domain-containing protein  41.22 
 
 
239 aa  85.5  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  40.25 
 
 
247 aa  85.5  6e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  43.7 
 
 
677 aa  84.7  8e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  36.81 
 
 
643 aa  84.7  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  37.75 
 
 
189 aa  84.7  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  40.56 
 
 
285 aa  84  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  37.5 
 
 
641 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  36.81 
 
 
642 aa  84.3  0.000000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  36.2 
 
 
650 aa  84.3  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  41.22 
 
 
698 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  35.85 
 
 
628 aa  84  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 
641 aa  84.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 
720 aa  84  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  39.31 
 
 
650 aa  84  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  36.73 
 
 
198 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 
641 aa  84  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>