More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1960 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  100 
 
 		 181 aa  369  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  97.79 
 
 		 181 aa  363  1e-100  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  50 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  51.48 
 
 		 195 aa  173  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  52.15 
 
 		 201 aa  164  9e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  44.07 
 
 		 199 aa  153  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  48.03 
 
 		 179 aa  148  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  42.2 
 
 		 187 aa  140  9.999999999999999e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  46.75 
 
 		 193 aa  135  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  43.87 
 
 		 182 aa  133  9.999999999999999e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  44.08 
 
 		 190 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  44.37 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  44.03 
 
 		 187 aa  125  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  37.91 
 
 		 195 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  37.25 
 
 		 798 aa  115  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  38.76 
 
 		 166 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 		 603 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  39.87 
 
 		 731 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  37.01 
 
 		 735 aa  108  5e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  40.13 
 
 		 166 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  37.01 
 
 		 724 aa  107  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  30.56 
 
 		 218 aa  103  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  38.56 
 
 		 729 aa  102  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  38.41 
 
 		 642 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  38.41 
 
 		 642 aa  101  6e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  34.21 
 
 		 782 aa  100  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  33.76 
 
 		 833 aa  100  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  37.16 
 
 		 661 aa  100  1e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  33.97 
 
 		 730 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  33.97 
 
 		 730 aa  99.4  3e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  38 
 
 		 660 aa  99  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  36.42 
 
 		 643 aa  97.8  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  37.75 
 
 		 642 aa  97.8  8e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  34.39 
 
 		 777 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  37.09 
 
 		 650 aa  97.1  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  37.75 
 
 		 657 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  37.09 
 
 		 642 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  37.09 
 
 		 642 aa  96.7  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  37.33 
 
 		 654 aa  96.7  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  37.75 
 
 		 649 aa  96.3  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  35.03 
 
 		 214 aa  96.7  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  37.75 
 
 		 641 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  37.74 
 
 		 715 aa  95.9  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  35.95 
 
 		 663 aa  95.9  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 659 aa  95.5  4e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  32.48 
 
 		 800 aa  95.1  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  37.5 
 
 		 698 aa  95.1  5e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  38.96 
 
 		 669 aa  94.7  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  34.46 
 
 		 649 aa  94.7  6e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  33.77 
 
 		 653 aa  94  9e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 		 655 aa  94  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.78 
 
 		 649 aa  94  1e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  36.42 
 
 		 663 aa  94  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  37.01 
 
 		 709 aa  92.8  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  34.84 
 
 		 643 aa  91.3  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 		 660 aa  91.3  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  36.6 
 
 		 643 aa  90.9  9e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  38.73 
 
 		 693 aa  90.1  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  34.9 
 
 		 830 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  36.08 
 
 		 653 aa  90.1  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2260  Lytic transglycosylase catalytic  34.9 
 
 		 763 aa  90.1  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  34.9 
 
 		 593 aa  89.4  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  37.09 
 
 		 645 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  37.09 
 
 		 645 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  37.09 
 
 		 645 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  37.01 
 
 		 709 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  37.09 
 
 		 645 aa  89.7  2e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  35.1 
 
 		 686 aa  89  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  33.77 
 
 		 639 aa  89  3e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  34.9 
 
 		 593 aa  89  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  33.77 
 
 		 639 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  37.09 
 
 		 645 aa  89  3e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  33.77 
 
 		 639 aa  89  3e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 643 aa  88.6  4e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  37.06 
 
 		 657 aa  89  4e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 		 748 aa  88.6  4e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  37.06 
 
 		 657 aa  89  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2348  Lytic transglycosylase catalytic  34.23 
 
 		 763 aa  88.2  5e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0502018  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  35.53 
 
 		 721 aa  88.6  5e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  32.03 
 
 		 651 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  32.03 
 
 		 651 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  32.03 
 
 		 651 aa  88.2  6e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  32.03 
 
 		 651 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  32.03 
 
 		 651 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  32.03 
 
 		 651 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  32.03 
 
 		 651 aa  88.2  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  36.05 
 
 		 677 aa  87.8  7e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  32.03 
 
 		 651 aa  87.8  8e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  29.26 
 
 		 219 aa  87.4  9e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  35.1 
 
 		 661 aa  87.4  9e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  39.58 
 
 		 285 aa  87.4  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  36.18 
 
 		 647 aa  86.7  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  34.23 
 
 		 607 aa  85.9  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  34.9 
 
 		 671 aa  85.5  3e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  33.56 
 
 		 650 aa  85.1  4e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  33.56 
 
 		 650 aa  85.1  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  34.44 
 
 		 645 aa  85.1  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  31.58 
 
 		 730 aa  85.1  5e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  36.13 
 
 		 678 aa  85.1  5e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  34.64 
 
 		 642 aa  85.1  5e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>