More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1606 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
166 aa  340  7e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  41.77 
 
 
201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  38.76 
 
 
181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  38.76 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  38.22 
 
 
195 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  38.64 
 
 
188 aa  99.4  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0358  Lytic transglycosylase catalytic  43.75 
 
 
247 aa  98.6  3e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  3.77747e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  38.31 
 
 
669 aa  97.8  6e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1769  lytic transglycosylase, catalytic  41.23 
 
 
189 aa  94.7  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  36.77 
 
 
187 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1010  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 
153 aa  93.2  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0664563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4417  lytic transglycosylase, catalytic  41.94 
 
 
251 aa  92.4  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0006  lytic transglycosylase, catalytic  34.59 
 
 
154 aa  90.9  8e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1873  lytic transglycosylase catalytic protein  39.2 
 
 
204 aa  90.5  9e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.249488  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  37.12 
 
 
654 aa  89.7  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2337  Lytic transglycosylase catalytic  39.2 
 
 
204 aa  90.5  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2811  Lytic transglycosylase catalytic  38.21 
 
 
282 aa  89.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4054  lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 
247 aa  89.4  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 
196 aa  89.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 
642 aa  89.4  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  39.5 
 
 
195 aa  89  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0348  lytic transglycosylase, catalytic  36.29 
 
 
204 aa  88.6  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0301  lytic murein transglycosylase, putative  39.17 
 
 
196 aa  88.6  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0006  lytic transglycosylase catalytic  35.22 
 
 
154 aa  88.6  4e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2486  lytic murein transglycosylase, putative  37.19 
 
 
241 aa  88.2  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  42.74 
 
 
174 aa  88.2  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4023  Lytic transglycosylase catalytic  39.83 
 
 
260 aa  87.8  7e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34117e-17 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  39.13 
 
 
637 aa  87.8  7e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2511  lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 
217 aa  87  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  35.82 
 
 
285 aa  86.3  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0827  lytic transglycosylase, catalytic  37.8 
 
 
206 aa  85.9  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0929  Lytic transglycosylase catalytic  35.71 
 
 
300 aa  85.5  3e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.316405  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2357  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 
260 aa  85.5  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3939  lytic transglycosylase catalytic protein  39.83 
 
 
260 aa  85.5  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.126837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3262  lytic transglycosylase, catalytic  39.17 
 
 
198 aa  85.5  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.205126  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2105  Lytic transglycosylase catalytic  39.37 
 
 
212 aa  85.5  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0670803  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1015  lytic transglycosylase, catalytic  35.97 
 
 
292 aa  85.1  4e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  35.97 
 
 
166 aa  85.1  4e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0872  lytic transglycosylase, catalytic  37.9 
 
 
258 aa  85.1  4e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0272824  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3239  Lytic transglycosylase catalytic  39.83 
 
 
211 aa  84.3  6e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2135  lytic transglycosylase catalytic  51.09 
 
 
233 aa  84.3  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.525775 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  35.61 
 
 
296 aa  84.3  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  40.91 
 
 
716 aa  84.3  7e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4513  Lytic transglycosylase catalytic  37.9 
 
 
230 aa  84.3  7e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141969  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  39.73 
 
 
798 aa  84.3  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  32.8 
 
 
219 aa  84  8e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1794  lytic transglycosylase, catalytic  35.95 
 
 
152 aa  84  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1826  lytic murein transglycosylase, putative  36 
 
 
202 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0287682  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  33.83 
 
 
730 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1200  lytic transglycosylase, catalytic  41.27 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1953  lytic transglycosylase, catalytic  35.94 
 
 
203 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000518233  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  33.83 
 
 
730 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  35.92 
 
 
657 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4037  lytic transglycosylase, catalytic  38.28 
 
 
233 aa  83.6  0.000000000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  35.92 
 
 
657 aa  83.6  0.000000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  38.93 
 
 
721 aa  84  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  38.67 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  35.61 
 
 
296 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1321  lytic murein transglycosylase, putative  35.53 
 
 
188 aa  82  0.000000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  32.58 
 
 
724 aa  82  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2291  putative transglycosylase protein  36.29 
 
 
198 aa  81.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.128594  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  33.8 
 
 
660 aa  81.3  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0370  Lytic transglycosylase catalytic  37.1 
 
 
216 aa  81.3  0.000000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.149841 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  37.84 
 
 
218 aa  81.3  0.000000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  38.21 
 
 
207 aa  81.3  0.000000000000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  35.61 
 
 
729 aa  81.3  0.000000000000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  34.31 
 
 
187 aa  81.3  0.000000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0265  transglycosylase SLT domain protein  38.26 
 
 
717 aa  80.9  0.000000000000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00304053  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0815  Lytic transglycosylase catalytic  40.15 
 
 
235 aa  80.9  0.000000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.328303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3427  Lytic transglycosylase catalytic  40.94 
 
 
295 aa  80.9  0.000000000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  34.18 
 
 
661 aa  80.5  0.000000000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 
653 aa  80.5  0.000000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1881  lytic transglycosylase catalytic  34.81 
 
 
297 aa  80.5  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.520099  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0192  transglycosylase, putative  37.1 
 
 
221 aa  80.5  0.000000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0931975  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1946  soluble lytic murein transglycosylase precursor  34.81 
 
 
297 aa  80.5  0.000000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.378225  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4758  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.04 
 
 
217 aa  80.5  0.00000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 
661 aa  80.1  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  36.84 
 
 
642 aa  80.5  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3562  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.09 
 
 
226 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3631  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2905  lytic transglycosylase, catalytic  33.82 
 
 
237 aa  79.3  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.739036  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  40.91 
 
 
663 aa  79.7  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3565  lytic transglycosylase, catalytic  35.61 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  33.8 
 
 
659 aa  79.3  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  30.99 
 
 
638 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  31.33 
 
 
640 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
655 aa  79.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3650  lytic transglycosylase, catalytic  36.15 
 
 
243 aa  79  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2486  lytic transglycosylase, catalytic  36.8 
 
 
198 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000427479  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  35.86 
 
 
199 aa  79.7  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3705  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 
209 aa  79.7  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  34.13 
 
 
650 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3422  lytic transglycosylase  35.77 
 
 
197 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  35.34 
 
 
688 aa  79  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  34.21 
 
 
593 aa  79  0.00000000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 
653 aa  79  0.00000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3164  lytic transglycosylase, catalytic  40.48 
 
 
284 aa  79  0.00000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.611179  normal  0.205276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2340  lytic transglycosylase, catalytic  35.77 
 
 
218 aa  79  0.00000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  37.38 
 
 
603 aa  78.6  0.00000000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>