More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1328 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 218 aa  442  1e-123  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  42 
 
 		 182 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  42 
 
 		 197 aa  128  7.000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  38.98 
 
 		 199 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  41.72 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  37.33 
 
 		 179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 187 aa  109  3e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  34.29 
 
 		 188 aa  107  1e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  41.33 
 
 		 193 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  35.68 
 
 		 195 aa  104  9e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  38.12 
 
 		 729 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  30.56 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  30.56 
 
 		 181 aa  103  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  35.63 
 
 		 195 aa  101  7e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  39.22 
 
 		 731 aa  101  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  39.33 
 
 		 190 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  40.67 
 
 		 166 aa  100  2e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  41.55 
 
 		 724 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  34.64 
 
 		 187 aa  97.1  2e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 682 aa  95.9  4e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  38.19 
 
 		 735 aa  95.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  38.56 
 
 		 672 aa  91.3  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  42.54 
 
 		 637 aa  91.3  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  38.51 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  38.03 
 
 		 660 aa  90.1  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  40.15 
 
 		 698 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  37.86 
 
 		 214 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  36.62 
 
 		 730 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  37.76 
 
 		 690 aa  88.6  7e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  37.68 
 
 		 730 aa  88.2  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  37.42 
 
 		 669 aa  88.2  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  39.44 
 
 		 679 aa  87.4  1e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  32 
 
 		 641 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  38.22 
 
 		 648 aa  87.8  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  32 
 
 		 644 aa  87.4  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  36.55 
 
 		 693 aa  87.4  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  33.96 
 
 		 798 aa  86.3  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  36.62 
 
 		 663 aa  85.5  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  34.34 
 
 		 643 aa  85.1  7e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  37.34 
 
 		 661 aa  84.7  9e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  35.67 
 
 		 643 aa  84.7  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  32.32 
 
 		 642 aa  84  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 663 aa  83.6  0.000000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  35.97 
 
 		 644 aa  84  0.000000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 804 aa  83.6  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0772  Lytic transglycosylase catalytic  42.42 
 
 		 196 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  36.13 
 
 		 721 aa  83.2  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  46.22 
 
 		 638 aa  83.2  0.000000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 		 719 aa  82.4  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  34.72 
 
 		 678 aa  82.4  0.000000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  35 
 
 		 720 aa  82.4  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  34.48 
 
 		 660 aa  82.4  0.000000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  38.1 
 
 		 645 aa  82  0.000000000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  38.1 
 
 		 648 aa  81.6  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 774 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 774 aa  81.6  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  34.13 
 
 		 645 aa  81.6  0.000000000000008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 603 aa  81.6  0.000000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1606  Lytic transglycosylase catalytic  37.84 
 
 		 166 aa  81.3  0.00000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000533374  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 776 aa  81.3  0.00000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1627  Lytic transglycosylase catalytic  40.71 
 
 		 207 aa  81.3  0.00000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  37.68 
 
 		 686 aa  80.9  0.00000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  37.41 
 
 		 760 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  32.52 
 
 		 739 aa  80.9  0.00000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 757 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  33.53 
 
 		 645 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  34.93 
 
 		 649 aa  80.5  0.00000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35.03 
 
 		 747 aa  79.7  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  41.88 
 
 		 642 aa  79.7  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  34.25 
 
 		 649 aa  79.7  0.00000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  35.17 
 
 		 657 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  32.52 
 
 		 735 aa  79.7  0.00000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  35.17 
 
 		 657 aa  79.7  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 645 aa  79.7  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 645 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2827  Lytic transglycosylase catalytic  32.68 
 
 		 263 aa  79.3  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 645 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  32.57 
 
 		 747 aa  79.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  38.06 
 
 		 680 aa  79.3  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 645 aa  79.3  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 		 833 aa  79.3  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  34.01 
 
 		 659 aa  79  0.00000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  31.61 
 
 		 706 aa  79  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 645 aa  79  0.00000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  34.25 
 
 		 645 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  34.25 
 
 		 645 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  34.25 
 
 		 645 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  41.88 
 
 		 642 aa  78.6  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 645 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 645 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 645 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 645 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  34.25 
 
 		 645 aa  79  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  41.03 
 
 		 650 aa  78.6  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  34.18 
 
 		 756 aa  78.2  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  34.51 
 
 		 643 aa  77.8  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  33.11 
 
 		 653 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  34.01 
 
 		 690 aa  77.8  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  37.42 
 
 		 641 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>