More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0518 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 682 aa  1370    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  48.26 
 
 		 679 aa  537  1e-151  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  44.41 
 
 		 672 aa  486  1e-136  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  34 
 
 		 664 aa  255  2.0000000000000002e-66  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  33.45 
 
 		 686 aa  246  8e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  32.33 
 
 		 804 aa  245  1.9999999999999999e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  33.22 
 
 		 735 aa  236  1.0000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  34.79 
 
 		 788 aa  233  1e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  32.46 
 
 		 749 aa  231  3e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  34.75 
 
 		 653 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  32.78 
 
 		 757 aa  231  5e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  32.56 
 
 		 747 aa  230  7e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  34.92 
 
 		 677 aa  229  1e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  32.23 
 
 		 746 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  33.16 
 
 		 726 aa  229  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  30.36 
 
 		 654 aa  226  1e-57  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  33.89 
 
 		 776 aa  225  2e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 		 774 aa  224  3e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  32.48 
 
 		 685 aa  224  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  33.39 
 
 		 774 aa  224  4.9999999999999996e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  32.58 
 
 		 747 aa  224  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  32.77 
 
 		 760 aa  223  9.999999999999999e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 649 aa  222  1.9999999999999999e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  34.79 
 
 		 680 aa  221  3e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  31.38 
 
 		 655 aa  221  5e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  32.16 
 
 		 691 aa  220  7e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  31.47 
 
 		 768 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  31.9 
 
 		 652 aa  219  2e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  31.46 
 
 		 745 aa  218  2e-55  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  32.86 
 
 		 691 aa  217  5.9999999999999996e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  32.94 
 
 		 649 aa  217  7e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  32.31 
 
 		 673 aa  216  9e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  32.64 
 
 		 709 aa  216  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  33.57 
 
 		 680 aa  215  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  31.34 
 
 		 685 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  31.39 
 
 		 712 aa  210  6e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 747 aa  203  8e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  29.59 
 
 		 723 aa  188  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  30.27 
 
 		 772 aa  177  8e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  32.89 
 
 		 677 aa  172  3e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 716 aa  162  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  33.6 
 
 		 808 aa  134  6.999999999999999e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  35.1 
 
 		 616 aa  131  3e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  51.54 
 
 		 374 aa  130  6e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  41.15 
 
 		 669 aa  130  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  33.54 
 
 		 650 aa  125  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  33.86 
 
 		 650 aa  124  4e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  33.54 
 
 		 650 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  33.22 
 
 		 637 aa  124  5e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  35.27 
 
 		 663 aa  122  9.999999999999999e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  33.23 
 
 		 657 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  32.57 
 
 		 655 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  50.38 
 
 		 640 aa  117  5e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  33.98 
 
 		 655 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  34.06 
 
 		 690 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  28.75 
 
 		 649 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  41.88 
 
 		 642 aa  115  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  31.11 
 
 		 657 aa  114  5e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  32.81 
 
 		 653 aa  114  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  33.01 
 
 		 650 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  33.01 
 
 		 650 aa  114  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 693 aa  114  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  32.53 
 
 		 650 aa  114  6e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  33.01 
 
 		 650 aa  114  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  33.33 
 
 		 651 aa  113  9e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  34.87 
 
 		 642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  33.12 
 
 		 657 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  32.68 
 
 		 655 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  46.67 
 
 		 643 aa  113  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  34.87 
 
 		 642 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  28.92 
 
 		 642 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  45.93 
 
 		 641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  32.57 
 
 		 716 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  48.12 
 
 		 641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  31.43 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  33.01 
 
 		 607 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  33.54 
 
 		 641 aa  112  3e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 651 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  33.33 
 
 		 651 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 651 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  33.33 
 
 		 651 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  32.99 
 
 		 628 aa  112  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  32.36 
 
 		 650 aa  112  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 651 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  33.33 
 
 		 651 aa  112  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 		 651 aa  112  3e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  47.33 
 
 		 645 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  48.51 
 
 		 643 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  32.67 
 
 		 642 aa  111  4.0000000000000004e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  35.9 
 
 		 641 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  36.32 
 
 		 641 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 721 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  47.73 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  47.73 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  35.9 
 
 		 641 aa  111  5e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  32.36 
 
 		 650 aa  111  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  32.8 
 
 		 652 aa  111  6e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>