More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtox_2419 on replicon NC_013216
Organism: Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 
193 aa  400  1e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  57.41 
 
 
179 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  54.88 
 
 
190 aa  207  1e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1021  Lytic transglycosylase catalytic  58.28 
 
 
197 aa  192  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  53.75 
 
 
182 aa  176  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  43.68 
 
 
187 aa  175  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  44.44 
 
 
199 aa  166  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  41.53 
 
 
195 aa  165  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  43.37 
 
 
201 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  40.22 
 
 
195 aa  144  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1960  secreted protein  45.3 
 
 
181 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2248  Slt family transglycosylase  44.75 
 
 
181 aa  139  3e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.469686  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  46.41 
 
 
729 aa  135  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  38.83 
 
 
188 aa  135  4e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  44.59 
 
 
187 aa  132  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2874  Lytic transglycosylase catalytic  45.95 
 
 
214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0680806  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2342  Lytic transglycosylase catalytic  36.79 
 
 
219 aa  126  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000870082  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  39.35 
 
 
735 aa  121  6e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  40.52 
 
 
731 aa  121  7e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  36.81 
 
 
724 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 
603 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  37.91 
 
 
730 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  37.91 
 
 
730 aa  115  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  41.67 
 
 
690 aa  115  5e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  40.14 
 
 
663 aa  112  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1328  Lytic transglycosylase catalytic  37.57 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000594554  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  37.66 
 
 
650 aa  108  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  33.33 
 
 
739 aa  107  1e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  37.66 
 
 
650 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  37.66 
 
 
650 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 
651 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  37.91 
 
 
660 aa  106  2e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0233  lytic murein transglycosylase, putative  36.36 
 
 
651 aa  106  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  36.36 
 
 
651 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  36.36 
 
 
651 aa  106  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 
651 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  36.36 
 
 
651 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 
651 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  36.36 
 
 
651 aa  106  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  35.48 
 
 
798 aa  105  4e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  37.01 
 
 
607 aa  104  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  38.31 
 
 
709 aa  104  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
735 aa  104  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  36.77 
 
 
782 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  38.31 
 
 
709 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 
748 aa  102  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  34.84 
 
 
833 aa  102  3e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  36.31 
 
 
663 aa  102  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 
650 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 
650 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 
650 aa  102  4e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0176  Lytic transglycosylase catalytic  38.76 
 
 
556 aa  101  6e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  34.48 
 
 
654 aa  101  6e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2022  lytic transglycosylase, catalytic  37.18 
 
 
166 aa  101  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  33.33 
 
 
642 aa  100  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  36.88 
 
 
756 aa  100  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  38.89 
 
 
661 aa  100  1e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  36.6 
 
 
657 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  36.6 
 
 
657 aa  100  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  35.85 
 
 
653 aa  99.8  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  37.25 
 
 
715 aa  99.4  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 
671 aa  99.4  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2410  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 
208 aa  98.6  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2092  lytic transglycosylase, catalytic  34.62 
 
 
720 aa  99  4e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.467729 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 
750 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  36.08 
 
 
750 aa  98.6  5e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  36.49 
 
 
642 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  36.11 
 
 
642 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  37.93 
 
 
660 aa  98.2  6e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  33.55 
 
 
800 aa  98.2  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0977  putative transglycosylase signal peptide protein  40.14 
 
 
285 aa  97.4  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.121304  normal  0.131274 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  35.81 
 
 
650 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  35.44 
 
 
750 aa  97.4  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  34.84 
 
 
777 aa  97.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  38.41 
 
 
657 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  37.42 
 
 
648 aa  96.3  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0830  Lytic transglycosylase catalytic  39.44 
 
 
296 aa  96.3  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0921738  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  36.36 
 
 
655 aa  95.9  3e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0901  Lytic transglycosylase catalytic  39.44 
 
 
296 aa  96.3  3e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.408914  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  34.62 
 
 
659 aa  96.3  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  34.68 
 
 
645 aa  95.9  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  35.81 
 
 
657 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  39.57 
 
 
643 aa  95.1  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  36.81 
 
 
642 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  35.81 
 
 
641 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  35.81 
 
 
649 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  36.81 
 
 
642 aa  95.1  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  36.36 
 
 
655 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  31.45 
 
 
706 aa  95.1  6e-19  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  35.17 
 
 
647 aa  94.4  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  35.71 
 
 
719 aa  94  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 
693 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  38.67 
 
 
664 aa  94.4  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  33.55 
 
 
643 aa  94  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  39.31 
 
 
641 aa  94  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  34.12 
 
 
760 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.86 
 
 
641 aa  92.8  2e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  37.76 
 
 
776 aa  93.2  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  39.19 
 
 
677 aa  93.2  2e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 
641 aa  92.8  2e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>