More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0176 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0176  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 556 aa  1104    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  36.81 
 
 		 777 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  36.69 
 
 		 833 aa  109  1e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  38.28 
 
 		 782 aa  108  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 800 aa  107  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 798 aa  105  3e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  36.72 
 
 		 750 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  36.72 
 
 		 750 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2419  Lytic transglycosylase catalytic  38.76 
 
 		 193 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0123719 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  40.77 
 
 		 715 aa  100  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  36.36 
 
 		 735 aa  100  7e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  39.23 
 
 		 721 aa  100  7e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  36.72 
 
 		 750 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  35.51 
 
 		 748 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  38.46 
 
 		 756 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1888  Lytic transglycosylase catalytic  38.28 
 
 		 195 aa  97.4  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  34.42 
 
 		 749 aa  95.5  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 603 aa  93.6  9e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  34.19 
 
 		 768 aa  93.2  1e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  36.24 
 
 		 745 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  33.55 
 
 		 747 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  41.22 
 
 		 650 aa  91.7  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  37.69 
 
 		 661 aa  91.7  4e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 729 aa  91.3  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2154  lytic transglycosylase, catalytic  35.42 
 
 		 201 aa  91.7  4e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0579447  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1595  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 190 aa  90.5  8e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  36.36 
 
 		 669 aa  90.1  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2013  secreted protein  37.5 
 
 		 187 aa  89.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  36.15 
 
 		 730 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  33.86 
 
 		 663 aa  87.8  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  33.33 
 
 		 654 aa  87.4  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  37.3 
 
 		 647 aa  87.4  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  36.81 
 
 		 709 aa  87  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  37.69 
 
 		 719 aa  86.7  9e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1407  lytic transglycosylase, catalytic  35.16 
 
 		 179 aa  86.7  9e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.282461  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 		 640 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  34.68 
 
 		 731 aa  86.3  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0107  soluble lytic murein transglycosylase, putative  34.78 
 
 		 540 aa  85.5  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  37.4 
 
 		 649 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  37.69 
 
 		 649 aa  85.1  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  37.69 
 
 		 649 aa  85.1  0.000000000000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  31.69 
 
 		 804 aa  84.7  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1837  lytic transglycosylase, catalytic  35.66 
 
 		 182 aa  84.7  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192263  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  36.51 
 
 		 663 aa  84.7  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2280  Slt family transglycosylase  32.06 
 
 		 688 aa  84.3  0.000000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  35.06 
 
 		 685 aa  84  0.000000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  40.62 
 
 		 641 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  39.84 
 
 		 641 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.84 
 
 		 641 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  34.03 
 
 		 788 aa  82.8  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  33.85 
 
 		 709 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  32.14 
 
 		 747 aa  82  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  34.04 
 
 		 649 aa  82.4  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 		 641 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 		 641 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2473  Lytic transglycosylase catalytic  32.03 
 
 		 199 aa  81.6  0.00000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  2.84832e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  36.64 
 
 		 645 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  38.17 
 
 		 641 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  36.09 
 
 		 682 aa  81.6  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  38.17 
 
 		 641 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  33.06 
 
 		 690 aa  81.6  0.00000000000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1378  putative soluble lytic murein transglycosylase  39.26 
 
 		 542 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  32.89 
 
 		 746 aa  82  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  38.17 
 
 		 641 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0884  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 188 aa  82  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.10912  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  35.04 
 
 		 691 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  34.78 
 
 		 747 aa  82  0.00000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4559  hypothetical protein  38.17 
 
 		 641 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2053  lytic transglycosylase catalytic  38.17 
 
 		 641 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00204351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  35.04 
 
 		 691 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  36.51 
 
 		 657 aa  81.3  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  36.51 
 
 		 657 aa  81.3  0.00000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1546  transglycosylase SLT domain-containing protein  37.96 
 
 		 545 aa  81.3  0.00000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.145291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  37.5 
 
 		 642 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0930  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35 
 
 		 541 aa  80.9  0.00000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0395136  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  35.51 
 
 		 652 aa  80.9  0.00000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  35.51 
 
 		 685 aa  80.5  0.00000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0859  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35 
 
 		 541 aa  80.5  0.00000000000007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.509195  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35.11 
 
 		 638 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  36.92 
 
 		 747 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  36.23 
 
 		 712 aa  80.1  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  33.08 
 
 		 709 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0992  soluble lytic murein transglycosylase, putative  35 
 
 		 541 aa  79.7  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0469572  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1100  soluble lytic murein transglycosylase and related regulatory protein  33.6 
 
 		 174 aa  79.7  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  34.35 
 
 		 677 aa  80.1  0.0000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2073  Lytic transglycosylase catalytic  30.83 
 
 		 195 aa  79  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000112057  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02649  soluble lytic murein transglycosylase  37.8 
 
 		 647 aa  79  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.787033  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0517  lytic transglycosylase, catalytic  32.82 
 
 		 208 aa  79.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  32.58 
 
 		 671 aa  79  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1439  Lytic transglycosylase catalytic  34.38 
 
 		 187 aa  78.2  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  31.03 
 
 		 760 aa  78.6  0.0000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  34.11 
 
 		 644 aa  78.6  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  30.91 
 
 		 680 aa  78.2  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  40.87 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0276  soluble lytic transglycosylase  35.94 
 
 		 681 aa  78.2  0.0000000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  40.87 
 
 		 534 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  32.64 
 
 		 654 aa  77.8  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  34.38 
 
 		 653 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  31.51 
 
 		 757 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  30.99 
 
 		 774 aa  77.4  0.0000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>