More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_41090 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  60.99 
 
 		 530 aa  649    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  60.76 
 
 		 534 aa  647    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  96.89 
 
 		 515 aa  1031    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  100 
 
 		 534 aa  1097    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  60.2 
 
 		 498 aa  618  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  57.47 
 
 		 473 aa  597  1e-169  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  57.69 
 
 		 476 aa  588  1e-167  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  53.47 
 
 		 492 aa  565  1e-160  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  57.51 
 
 		 476 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  57.29 
 
 		 476 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  52.38 
 
 		 446 aa  436  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.34 
 
 		 543 aa  415  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  43.35 
 
 		 580 aa  387  1e-106  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  43.04 
 
 		 539 aa  382  1e-105  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  41.81 
 
 		 548 aa  377  1e-103  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  42.39 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  38.15 
 
 		 552 aa  364  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  39.2 
 
 		 515 aa  361  2e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  38.31 
 
 		 519 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  39.39 
 
 		 511 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  39.05 
 
 		 515 aa  356  5e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  39.05 
 
 		 515 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  39.05 
 
 		 515 aa  354  2e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.42 
 
 		 554 aa  354  2e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  39.2 
 
 		 514 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  38.81 
 
 		 524 aa  349  8e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 		 553 aa  348  1e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  36.36 
 
 		 519 aa  347  3e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  36.77 
 
 		 517 aa  345  8e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  38.56 
 
 		 515 aa  345  8.999999999999999e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  38.37 
 
 		 515 aa  343  4e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  38.37 
 
 		 515 aa  342  7e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  38.04 
 
 		 519 aa  342  1e-92  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.78 
 
 		 532 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.65 
 
 		 528 aa  338  1.9999999999999998e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  41 
 
 		 518 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.78 
 
 		 527 aa  336  7e-91  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1378  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  50.15 
 
 		 495 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1189  SLT:MLTD_N  50 
 
 		 507 aa  331  2e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  35.56 
 
 		 517 aa  330  3e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  37.98 
 
 		 527 aa  322  9.999999999999999e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  38.23 
 
 		 550 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  37.63 
 
 		 517 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  37.7 
 
 		 539 aa  317  3e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  42.05 
 
 		 495 aa  311  2e-83  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  39.64 
 
 		 501 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  35.61 
 
 		 518 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  36.55 
 
 		 479 aa  301  3e-80  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.07 
 
 		 452 aa  300  4e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  40.56 
 
 		 570 aa  300  5e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.07 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.07 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.07 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  38.07 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.07 
 
 		 452 aa  298  1e-79  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  36.13 
 
 		 479 aa  298  2e-79  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.39 
 
 		 472 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.39 
 
 		 459 aa  298  2e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  36.91 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  37.77 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  36.62 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  37.7 
 
 		 483 aa  292  8e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.04 
 
 		 455 aa  291  1e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  36.97 
 
 		 474 aa  292  1e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.04 
 
 		 455 aa  291  2e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  39.95 
 
 		 511 aa  290  5.0000000000000004e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  37.47 
 
 		 483 aa  289  7e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  40.79 
 
 		 564 aa  289  8e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.89 
 
 		 457 aa  289  9e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  40.99 
 
 		 531 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.54 
 
 		 564 aa  288  1e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.91 
 
 		 464 aa  289  1e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  43.47 
 
 		 445 aa  288  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1469  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.74 
 
 		 530 aa  288  2e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.16 
 
 		 395 aa  288  2e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  34.92 
 
 		 612 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.92 
 
 		 612 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  35.82 
 
 		 485 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.6 
 
 		 465 aa  286  5e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  37.24 
 
 		 483 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  37.24 
 
 		 483 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  36.08 
 
 		 557 aa  286  8e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  36.68 
 
 		 499 aa  286  8e-76  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  40.4 
 
 		 529 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  40.49 
 
 		 552 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  41.1 
 
 		 525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  39.53 
 
 		 525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  40.9 
 
 		 525 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.33 
 
 		 457 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.49 
 
 		 530 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.26 
 
 		 475 aa  285  2.0000000000000002e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  39.56 
 
 		 561 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  36.46 
 
 		 487 aa  284  3.0000000000000004e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  40.4 
 
 		 529 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2530  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  40.48 
 
 		 547 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.25 
 
 		 553 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.25 
 
 		 530 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  40.25 
 
 		 530 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1276  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.25 
 
 		 530 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.633105  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  40.4 
 
 		 524 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>