More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1537 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 		 580 aa  1190    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  45.06 
 
 		 548 aa  520  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  52.46 
 
 		 554 aa  517  1.0000000000000001e-145  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.2 
 
 		 543 aa  514  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  48.63 
 
 		 552 aa  496  1e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  49.46 
 
 		 553 aa  498  1e-139  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  52.46 
 
 		 539 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  49.58 
 
 		 556 aa  485  1e-135  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  49.89 
 
 		 511 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  48.39 
 
 		 519 aa  473  1e-132  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  44.25 
 
 		 528 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  47.97 
 
 		 517 aa  473  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  47.97 
 
 		 519 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  49.25 
 
 		 527 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  48.83 
 
 		 517 aa  461  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  48.39 
 
 		 532 aa  455  1.0000000000000001e-126  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  48.19 
 
 		 524 aa  450  1e-125  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  47.41 
 
 		 550 aa  430  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  44.7 
 
 		 515 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  44.49 
 
 		 515 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  44.16 
 
 		 515 aa  411  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  44.49 
 
 		 515 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  42.95 
 
 		 515 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  42.95 
 
 		 515 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  42.95 
 
 		 515 aa  405  1e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  42.95 
 
 		 519 aa  404  1e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  39.6 
 
 		 518 aa  403  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  41.88 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  43.5 
 
 		 515 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 517 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  40.46 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  40.84 
 
 		 479 aa  387  1e-106  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  43.35 
 
 		 534 aa  387  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  42 
 
 		 534 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.72 
 
 		 530 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  42.67 
 
 		 498 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  42.22 
 
 		 442 aa  355  2e-96  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  41.98 
 
 		 442 aa  352  8.999999999999999e-96  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  40.2 
 
 		 495 aa  351  2e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  40.45 
 
 		 527 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  39.83 
 
 		 518 aa  347  3e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  40.17 
 
 		 485 aa  342  9e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  42.51 
 
 		 474 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  42.17 
 
 		 473 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  39.16 
 
 		 476 aa  332  1e-89  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  38.06 
 
 		 492 aa  332  2e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  40.22 
 
 		 476 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  40.22 
 
 		 476 aa  329  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  41.3 
 
 		 446 aa  316  9.999999999999999e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  40.61 
 
 		 445 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  32.06 
 
 		 546 aa  300  5e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  34.32 
 
 		 499 aa  300  6e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  34.32 
 
 		 487 aa  298  1e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  42.04 
 
 		 570 aa  296  5e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1973  lytic transglycosylase catalytic  41.08 
 
 		 578 aa  293  5e-78  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.203467 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.95 
 
 		 472 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.95 
 
 		 459 aa  290  4e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  41.04 
 
 		 557 aa  290  7e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  33.46 
 
 		 539 aa  289  9e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.94 
 
 		 457 aa  289  9e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.92 
 
 		 457 aa  289  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.9 
 
 		 395 aa  285  2.0000000000000002e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  39.01 
 
 		 516 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  39.01 
 
 		 516 aa  283  5.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  38.95 
 
 		 504 aa  283  8.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.25 
 
 		 464 aa  283  9e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  40.18 
 
 		 501 aa  282  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.3 
 
 		 455 aa  281  2e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  38.72 
 
 		 504 aa  281  2e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.92 
 
 		 465 aa  281  3e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.92 
 
 		 475 aa  281  3e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1021  lytic transglycosylase, catalytic  43.02 
 
 		 477 aa  280  5e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.847474  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  40.4 
 
 		 515 aa  280  7e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.47 
 
 		 455 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.18 
 
 		 406 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.42 
 
 		 406 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.18 
 
 		 406 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.18 
 
 		 406 aa  277  3e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2530  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  37.5 
 
 		 547 aa  277  4e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  37.25 
 
 		 525 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  38.53 
 
 		 528 aa  277  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  37.25 
 
 		 525 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  37.25 
 
 		 525 aa  276  6e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2278  lytic transglycosylase, catalytic  38.48 
 
 		 467 aa  276  7e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  37.57 
 
 		 426 aa  276  8e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.85 
 
 		 530 aa  276  8e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  37.08 
 
 		 531 aa  276  9e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  38.48 
 
 		 564 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  36.85 
 
 		 552 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.12 
 
 		 564 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1469  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  36.85 
 
 		 530 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.63 
 
 		 530 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  36.63 
 
 		 530 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.63 
 
 		 553 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  38.44 
 
 		 524 aa  274  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1276  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.63 
 
 		 530 aa  274  3e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.633105  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.57 
 
 		 452 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.57 
 
 		 452 aa  273  7e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  36.57 
 
 		 452 aa  273  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.57 
 
 		 452 aa  273  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>