More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2010 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  59.92 
 
 
519 aa  648    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  84.47 
 
 
515 aa  890    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  60.51 
 
 
511 aa  643    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  100 
 
 
515 aa  1058    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  98.46 
 
 
519 aa  1028    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  61.14 
 
 
517 aa  664    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  61.7 
 
 
519 aa  666    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  85.63 
 
 
515 aa  901    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  85.44 
 
 
515 aa  899    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  99.42 
 
 
515 aa  1053    Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  85.83 
 
 
515 aa  901    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  99.22 
 
 
515 aa  1051    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  83.88 
 
 
514 aa  879    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  54.35 
 
 
517 aa  570  1e-161  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  50.86 
 
 
518 aa  551  1e-155  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  53.58 
 
 
474 aa  508  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  50.94 
 
 
485 aa  492  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  49.57 
 
 
554 aa  483  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  46.17 
 
 
552 aa  463  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  44.51 
 
 
517 aa  458  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  46.85 
 
 
553 aa  458  1e-127  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  47.66 
 
 
495 aa  450  1e-125  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  47.28 
 
 
527 aa  443  1e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  44.12 
 
 
528 aa  443  1e-123  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  43.4 
 
 
543 aa  438  1e-121  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  43.12 
 
 
532 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  44.68 
 
 
548 aa  422  1e-117  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  42.95 
 
 
580 aa  412  1e-114  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  42.74 
 
 
524 aa  405  1e-111  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  38.08 
 
 
539 aa  396  1e-109  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  40.25 
 
 
556 aa  394  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  39.63 
 
 
550 aa  375  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  40.35 
 
 
498 aa  365  1e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  38.56 
 
 
534 aa  351  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  40.99 
 
 
515 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.42 
 
 
530 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  38.1 
 
 
534 aa  345  1e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  39.66 
 
 
479 aa  329  9e-89  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  39.74 
 
 
479 aa  327  2.0000000000000001e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  36.12 
 
 
527 aa  324  2e-87  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  37.86 
 
 
546 aa  319  9e-86  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.36 
 
 
459 aa  302  8.000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.36 
 
 
472 aa  302  9e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  35.9 
 
 
487 aa  301  2e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.9 
 
 
499 aa  300  6e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.99 
 
 
395 aa  293  4e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  38.6 
 
 
518 aa  292  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  36.27 
 
 
442 aa  290  5.0000000000000004e-77  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  39.51 
 
 
445 aa  290  6e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.92 
 
 
465 aa  288  1e-76  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.28 
 
 
475 aa  288  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  36.27 
 
 
442 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.2 
 
 
464 aa  286  5e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.91 
 
 
457 aa  286  5e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.74 
 
 
457 aa  286  8e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  35.35 
 
 
492 aa  285  9e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  36.73 
 
 
476 aa  280  4e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.77 
 
 
455 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  36.8 
 
 
473 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  35.97 
 
 
476 aa  277  3e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  35.97 
 
 
476 aa  276  7e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  33.84 
 
 
474 aa  273  6e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  33.78 
 
 
474 aa  272  9e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  33.63 
 
 
474 aa  272  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  34.37 
 
 
471 aa  272  1e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.3 
 
 
455 aa  271  2.9999999999999997e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.14 
 
 
406 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.14 
 
 
406 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.14 
 
 
406 aa  269  7e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.14 
 
 
406 aa  269  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  38.02 
 
 
446 aa  267  2.9999999999999995e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.6 
 
 
452 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.6 
 
 
452 aa  264  3e-69  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.6 
 
 
452 aa  264  3e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.6 
 
 
452 aa  264  3e-69  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  32.6 
 
 
452 aa  264  3e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  32.6 
 
 
452 aa  264  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  32.63 
 
 
539 aa  263  8e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.15 
 
 
406 aa  260  3e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.15 
 
 
406 aa  260  3e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  37.12 
 
 
570 aa  260  4e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  32.34 
 
 
483 aa  260  5.0000000000000005e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  34.43 
 
 
501 aa  259  7e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  36.93 
 
 
511 aa  258  1e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  32.54 
 
 
477 aa  258  2e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  32.13 
 
 
483 aa  257  4e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1742  lytic transglycosylase, catalytic  33.26 
 
 
504 aa  256  6e-67  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.785643  normal  0.0879149 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  31.7 
 
 
483 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  31.91 
 
 
483 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1976  Lytic transglycosylase catalytic  33.06 
 
 
504 aa  254  3e-66  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  34.69 
 
 
564 aa  253  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.81 
 
 
612 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  34.81 
 
 
612 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  35.68 
 
 
557 aa  251  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  34.46 
 
 
564 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  34.76 
 
 
515 aa  250  4e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  37.76 
 
 
426 aa  248  1e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  35.44 
 
 
561 aa  248  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  36.43 
 
 
528 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  35.92 
 
 
525 aa  248  2e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>