More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A0290 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00204  predicted membrane-bound lytic murein transglycosylase D  91.63 
 
 		 452 aa  770    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133928  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0223  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  91.87 
 
 		 406 aa  768    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3454  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  91.63 
 
 		 452 aa  770    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  100 
 
 		 406 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  99.75 
 
 		 406 aa  829    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  99.75 
 
 		 455 aa  834    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00209  hypothetical protein  91.63 
 
 		 452 aa  770    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.133083  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  88.18 
 
 		 455 aa  746    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0215  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  91.63 
 
 		 452 aa  770    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00533886  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0207  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  91.38 
 
 		 452 aa  768    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  100 
 
 		 406 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  100 
 
 		 406 aa  832    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0216  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  91.63 
 
 		 452 aa  770    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.806422  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0225  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  91.87 
 
 		 406 aa  768    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.459174  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  68.05 
 
 		 457 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  68.05 
 
 		 457 aa  567  1e-160  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  67.82 
 
 		 459 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  67.82 
 
 		 472 aa  562  1.0000000000000001e-159  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  65.21 
 
 		 475 aa  558  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  67.41 
 
 		 395 aa  555  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  65.51 
 
 		 465 aa  549  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  64.23 
 
 		 464 aa  541  1e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  39.66 
 
 		 553 aa  323  5e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  41.5 
 
 		 554 aa  315  7e-85  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  42.68 
 
 		 473 aa  310  2e-83  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  39.47 
 
 		 539 aa  306  5.0000000000000004e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  42.03 
 
 		 534 aa  306  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  42.75 
 
 		 530 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.32 
 
 		 552 aa  300  3e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.32 
 
 		 532 aa  298  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  38.17 
 
 		 524 aa  298  2e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  39.9 
 
 		 476 aa  296  4e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  39.9 
 
 		 476 aa  295  7e-79  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  39.9 
 
 		 476 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  42.04 
 
 		 498 aa  293  3e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  39.24 
 
 		 492 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  37.99 
 
 		 517 aa  293  4e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.56 
 
 		 543 aa  292  9e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  38.63 
 
 		 517 aa  285  9e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  35.84 
 
 		 518 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  40.05 
 
 		 515 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  37.1 
 
 		 511 aa  282  8.000000000000001e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  39.55 
 
 		 534 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  38.28 
 
 		 556 aa  280  2e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  37.31 
 
 		 517 aa  280  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  37.38 
 
 		 528 aa  280  4e-74  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  36.41 
 
 		 519 aa  278  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  38.18 
 
 		 580 aa  277  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  37.13 
 
 		 527 aa  276  6e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0583  Lytic transglycosylase catalytic  39.16 
 
 		 612 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0421  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.16 
 
 		 612 aa  274  2.0000000000000002e-72  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3414  MltD domain-containing protein  36.39 
 
 		 474 aa  271  1e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.387896 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  36.72 
 
 		 519 aa  271  2e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  37.17 
 
 		 548 aa  270  2.9999999999999997e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3584  MltD domain-containing protein  36.75 
 
 		 474 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0538  MltD domain-containing protein  35.9 
 
 		 474 aa  266  4e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  35.32 
 
 		 515 aa  266  5e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  35.32 
 
 		 515 aa  266  5e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  34.4 
 
 		 514 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3257  lytic transglycosylase, catalytic  34.95 
 
 		 471 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  35.07 
 
 		 515 aa  265  8.999999999999999e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  38.5 
 
 		 445 aa  264  2e-69  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  35.07 
 
 		 515 aa  264  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0652  MltD domain-containing protein  34.91 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0625  MltD domain-containing protein  35.14 
 
 		 483 aa  263  4e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4017  Slt family transglycosylase  35.32 
 
 		 477 aa  263  4.999999999999999e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  35.14 
 
 		 515 aa  262  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0648  MLTD_N domain protein  34.91 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3737  MltD domain-containing protein  34.91 
 
 		 483 aa  261  2e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  34.89 
 
 		 515 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  34.89 
 
 		 515 aa  260  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  36.96 
 
 		 446 aa  259  6e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  34.64 
 
 		 519 aa  258  1e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  33.49 
 
 		 474 aa  254  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  37.97 
 
 		 495 aa  252  6e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  33.74 
 
 		 479 aa  252  8.000000000000001e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  33.74 
 
 		 479 aa  250  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  35.63 
 
 		 550 aa  248  2e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 485 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  37.14 
 
 		 527 aa  245  9e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  35.19 
 
 		 539 aa  245  9e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  36.96 
 
 		 570 aa  242  7.999999999999999e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  32.92 
 
 		 487 aa  237  2e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  36.98 
 
 		 557 aa  237  3e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  32.92 
 
 		 499 aa  237  4e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1378  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  43.38 
 
 		 495 aa  231  1e-59  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1273  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  44.19 
 
 		 1001 aa  231  2e-59  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000430428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1112  lytic transglycosylase, catalytic  44.19 
 
 		 1021 aa  231  2e-59  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0269179  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  36.27 
 
 		 528 aa  231  2e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  31.44 
 
 		 442 aa  229  4e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1189  SLT:MLTD_N  44.27 
 
 		 507 aa  229  6e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.103616 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  36.03 
 
 		 524 aa  229  7e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  34.72 
 
 		 546 aa  229  8e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  35.7 
 
 		 529 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  30.99 
 
 		 442 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  35.7 
 
 		 529 aa  228  2e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  44.96 
 
 		 562 aa  227  3e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  35.78 
 
 		 525 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  35.78 
 
 		 525 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  35.78 
 
 		 525 aa  227  3e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>