More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0953 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0953  lytic transglycosylase, catalytic  100 
 
 
556 aa  1123    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1995  lytic transglycosylase, catalytic  54.53 
 
 
539 aa  498  1e-140  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0964783  normal  0.42715 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1998  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  44.49 
 
 
552 aa  487  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1537  lytic transglycosylase, catalytic  49.58 
 
 
580 aa  485  1e-136  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.324928  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1894  lytic transglycosylase, catalytic  42.42 
 
 
553 aa  483  1e-135  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0630277  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01980  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  46.36 
 
 
554 aa  484  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.531039  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1701  lytic transglycosylase catalytic  44.18 
 
 
548 aa  480  1e-134  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000779386  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2024  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  44.22 
 
 
543 aa  476  1e-133  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000444434  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2402  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  44.24 
 
 
517 aa  471  1.0000000000000001e-131  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1988  lytic transglycosylase, catalytic  42.99 
 
 
519 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.010206  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1588  lytic transglycosylase, catalytic  51.91 
 
 
550 aa  463  1e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.128959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2612  lytic transglycosylase catalytic  45.42 
 
 
517 aa  456  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00320162  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2115  lytic transglycosylase, catalytic  46.07 
 
 
511 aa  456  1e-127  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000101549  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2407  lytic transglycosylase catalytic  46.32 
 
 
519 aa  450  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000206679  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002769  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  41.67 
 
 
527 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0709625  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1829  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.88 
 
 
532 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03214  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  41.07 
 
 
528 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2564  Slt family transglycosylase  41.51 
 
 
515 aa  397  1e-109  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2022  lytic transglycosylase, catalytic  36.14 
 
 
518 aa  397  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000299101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2370  MltD domain-containing protein  41.09 
 
 
515 aa  397  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000191622  normal  0.0274164 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2162  MltD domain-containing protein  41.3 
 
 
515 aa  394  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000015187  normal  0.0463947 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2239  MltD domain-containing protein  41.3 
 
 
515 aa  395  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000290674  normal  0.325041 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2208  lytic transglycosylase, catalytic  39.41 
 
 
517 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.738412  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2010  MltD domain-containing protein  40.25 
 
 
515 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000075439  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2328  MLTD_N domain protein  40.25 
 
 
515 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000191267  hitchhiker  0.00043621 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2058  MltD domain-containing protein  40.25 
 
 
515 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000280518  decreased coverage  0.000141788 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1995  MltD domain-containing protein  40.25 
 
 
519 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0597997  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1775  MltD domain-containing protein  39.87 
 
 
514 aa  387  1e-106  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000157284  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2063  lytic transglycosylase, catalytic  41.45 
 
 
498 aa  382  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.829079  normal  0.0945255 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3484  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  42.06 
 
 
515 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0499239  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0498  Lytic transglycosylase catalytic  43.97 
 
 
527 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.112584  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0499  lytic transglycosylase, catalytic  38.76 
 
 
524 aa  378  1e-103  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0979868 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3715  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  40.55 
 
 
530 aa  373  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.284464  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41090  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  42.39 
 
 
534 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1760  peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N  40.25 
 
 
534 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.721447 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1257  hypothetical protein  38.2 
 
 
479 aa  364  2e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1256  hypothetical protein  38.2 
 
 
479 aa  363  6e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1988  lytic transglycosylase, catalytic  41.02 
 
 
474 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.49985  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1482  lytic transglycosylase, catalytic  40.6 
 
 
518 aa  351  2e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00124104  normal  0.157348 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1857  lytic transglycosylase, catalytic  41.15 
 
 
485 aa  346  8e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1127  hypothetical protein  41.91 
 
 
442 aa  343  4e-93  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3717  MltD domain-containing protein  43.33 
 
 
476 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2183  lytic transglycosylase, catalytic  42.45 
 
 
492 aa  341  2e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.96919  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1123  hypothetical protein  41.18 
 
 
442 aa  340  5e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4145  lytic murein transglycosylase D  40.96 
 
 
476 aa  339  7e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.895478  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3470  MltD domain-containing protein  43.43 
 
 
473 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.898295  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1720  MltD domain-containing protein  40.96 
 
 
476 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.131331  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1885  Slt family transglycosylase  39.83 
 
 
495 aa  325  2e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000159239  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1945  lytic transglycosylase  42.18 
 
 
445 aa  312  1e-83  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.106918  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0925  lytic transglycosylase, catalytic  31.92 
 
 
546 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1767  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  35.74 
 
 
499 aa  299  7e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.247006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1666  peptidoglycan-binding protein LysM  41.6 
 
 
501 aa  298  1e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0420  Slt family transglycosylase  35.53 
 
 
487 aa  297  3e-79  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00605393  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3139  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.37 
 
 
457 aa  295  1e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.336186  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1105  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.21 
 
 
472 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1051  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  34.21 
 
 
459 aa  295  2e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.550893  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1006  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.81 
 
 
465 aa  292  9e-78  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2842  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.74 
 
 
464 aa  290  3e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29630  Peptidoglycan-binding LysM:SLT:MLTD_N domain protein  39.6 
 
 
446 aa  289  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0925428  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1140  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.08 
 
 
457 aa  286  5.999999999999999e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2686  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  36.52 
 
 
395 aa  286  5.999999999999999e-76  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.83719  normal  0.0402839 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0304  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.92 
 
 
455 aa  285  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2205  lytic transglycosylase, catalytic  41.29 
 
 
570 aa  285  2.0000000000000002e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.803173  normal  0.257061 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4898  lytic transglycosylase catalytic  40.1 
 
 
511 aa  282  9e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1177  lytic transglycosylase catalytic  36.55 
 
 
529 aa  282  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  unclonable  0.00000000111267  normal  0.0154135 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1571  Lytic transglycosylase catalytic  32.48 
 
 
539 aa  281  2e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.55441  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0290  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.28 
 
 
406 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.720037 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0298  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.28 
 
 
406 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.349591  normal  0.759355 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2186  peptidoglycan-binding LysM:lytic transglycosylase, catalytic:MLTD_N  38.28 
 
 
557 aa  281  3e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0285  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.28 
 
 
406 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0283  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  38.28 
 
 
406 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.632709  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4430  lytic transglycosylase like protein  36.22 
 
 
524 aa  280  4e-74  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000408016  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0908  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  33.4 
 
 
475 aa  280  4e-74  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1165  lytic transglycosylase, catalytic  36.42 
 
 
529 aa  280  6e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00000346061  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2038  MLTD_N domain protein  40.49 
 
 
516 aa  279  8e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.464579  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2028  membrane-bound lytic murein transglycosylase, putative  35.06 
 
 
562 aa  279  1e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2870  Lytic transglycosylase catalytic  35.57 
 
 
564 aa  279  1e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00000269929  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0871  lytic transglycosylase catalytic  39.81 
 
 
561 aa  278  2e-73  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000448288  normal  0.420997 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1205  membrane-bound lytic murein transglycosylase D precursor  42.68 
 
 
426 aa  278  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.627815  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2787  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  38.06 
 
 
531 aa  278  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000442386  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2278  lytic transglycosylase, catalytic  37.72 
 
 
467 aa  278  2e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1730  MLTD_N domain protein  40.24 
 
 
516 aa  278  2e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0587435  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2337  Lytic transglycosylase catalytic  39.61 
 
 
538 aa  277  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.627607  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1254  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  37.74 
 
 
564 aa  278  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000724921  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1259  lytic transglycosylase catalytic  36.11 
 
 
525 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000373485  normal  0.0984249 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1288  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 
525 aa  277  4e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  unclonable  0.000000000451956  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0807  lytic transglycosylase, catalytic  36.11 
 
 
525 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  unclonable  0.0000000488034  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2032  lytic transglycosylase catalytic  35.89 
 
 
528 aa  276  9e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00000000277955  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1499  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.2 
 
 
530 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.261564  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1603  putative exported transglycosylase protein  40.2 
 
 
552 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0745  membrane-bound lytic murein transglycosylase D  35.37 
 
 
455 aa  273  4.0000000000000004e-72  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.551604  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1469  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase  40.2 
 
 
530 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.554784  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0559  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.95 
 
 
530 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0592  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.95 
 
 
553 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0766  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  39.95 
 
 
530 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1276  putative membrane-bound lytic murein transglycosylase D  39.95 
 
 
530 aa  272  1e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.633105  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1677  lytic transglycosylase, catalytic  37.27 
 
 
524 aa  271  2.9999999999999997e-71  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.728963 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2530  membrane-bound lytic murein transglycosylase D, putative  37.83 
 
 
547 aa  270  5e-71  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.171076  normal  0.494902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0590  lytic transglycosylase, catalytic  39.95 
 
 
515 aa  270  7e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1461  lytic transglycosylase, catalytic  38.46 
 
 
509 aa  267  4e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.0063107  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>