More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2861 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 804 aa  1625    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  38.7 
 
 		 686 aa  451  1e-125  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  38.74 
 
 		 760 aa  414  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  37.98 
 
 		 757 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  37.41 
 
 		 768 aa  405  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  37.22 
 
 		 735 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  40.31 
 
 		 726 aa  405  1e-111  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  37.16 
 
 		 745 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  38.18 
 
 		 747 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  37.54 
 
 		 749 aa  393  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  36.55 
 
 		 747 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  36.28 
 
 		 746 aa  388  1e-106  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  37.25 
 
 		 774 aa  382  1e-104  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  38.25 
 
 		 664 aa  377  1e-103  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  37.54 
 
 		 776 aa  379  1e-103  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  37.69 
 
 		 774 aa  379  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  37.97 
 
 		 788 aa  368  1e-100  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  35.74 
 
 		 772 aa  363  5.0000000000000005e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  36.3 
 
 		 685 aa  362  2e-98  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  36.83 
 
 		 709 aa  359  9.999999999999999e-98  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  36.96 
 
 		 685 aa  358  2.9999999999999997e-97  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  36.96 
 
 		 652 aa  357  5e-97  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 712 aa  351  3e-95  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  38.09 
 
 		 691 aa  351  3e-95  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  39.41 
 
 		 653 aa  350  8e-95  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  38.16 
 
 		 680 aa  348  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  39.56 
 
 		 677 aa  348  3e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  37.44 
 
 		 691 aa  347  4e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  34.68 
 
 		 723 aa  346  8e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  34.56 
 
 		 654 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  37.56 
 
 		 680 aa  334  3e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  36.12 
 
 		 747 aa  332  2e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  35.48 
 
 		 649 aa  321  3e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  35.33 
 
 		 655 aa  303  8.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  33.17 
 
 		 649 aa  298  2e-79  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  33.77 
 
 		 679 aa  267  5e-70  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  34.7 
 
 		 716 aa  248  2e-64  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  32.17 
 
 		 682 aa  238  2e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  32.64 
 
 		 673 aa  233  9e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  31.04 
 
 		 672 aa  230  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  29.88 
 
 		 677 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  27.87 
 
 		 808 aa  135  1.9999999999999998e-30  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  33.52 
 
 		 590 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  33.44 
 
 		 719 aa  125  4e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  31.98 
 
 		 616 aa  124  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  34.02 
 
 		 690 aa  124  9e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2449  lytic transglycosylase, catalytic  34.53 
 
 		 644 aa  121  6e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  25.72 
 
 		 628 aa  120  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  42.44 
 
 		 663 aa  120  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  30.09 
 
 		 715 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  31.05 
 
 		 650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  31.23 
 
 		 652 aa  119  1.9999999999999998e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  31.49 
 
 		 650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  33.01 
 
 		 678 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  29.06 
 
 		 721 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  32.95 
 
 		 574 aa  118  3.9999999999999997e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  30.67 
 
 		 655 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  45.04 
 
 		 374 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  30.03 
 
 		 663 aa  117  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  31.17 
 
 		 650 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  32.63 
 
 		 657 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31.48 
 
 		 716 aa  116  2.0000000000000002e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  30.65 
 
 		 653 aa  115  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  30.87 
 
 		 657 aa  114  6e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  30.79 
 
 		 654 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  40.13 
 
 		 698 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  42.96 
 
 		 657 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  42.96 
 
 		 649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  42.96 
 
 		 641 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  33.98 
 
 		 750 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1088  lytic transglycosylase, catalytic  42.28 
 
 		 653 aa  112  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  31.75 
 
 		 638 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  31.87 
 
 		 660 aa  112  4.0000000000000004e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2689  Lytic transglycosylase catalytic  41.61 
 
 		 752 aa  111  5e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  43.84 
 
 		 643 aa  111  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  30.16 
 
 		 642 aa  111  6e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  39.51 
 
 		 709 aa  111  6e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  37.85 
 
 		 669 aa  111  7.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.59 
 
 		 747 aa  110  8.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  46 
 
 		 677 aa  110  8.000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  32.22 
 
 		 642 aa  110  9.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  32.68 
 
 		 750 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  32.22 
 
 		 642 aa  110  1e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  43.36 
 
 		 650 aa  110  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  31.13 
 
 		 655 aa  110  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  32.68 
 
 		 750 aa  109  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  40.94 
 
 		 693 aa  109  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  44.68 
 
 		 660 aa  109  2e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  40.24 
 
 		 644 aa  108  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  29.43 
 
 		 642 aa  108  3e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  31.27 
 
 		 659 aa  108  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  42.57 
 
 		 641 aa  108  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  30.69 
 
 		 655 aa  108  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  29.83 
 
 		 650 aa  108  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  42.96 
 
 		 642 aa  108  6e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  25.15 
 
 		 739 aa  108  6e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  30.42 
 
 		 661 aa  107  6e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  41.26 
 
 		 642 aa  107  9e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  38.89 
 
 		 643 aa  107  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  41.61 
 
 		 709 aa  107  9e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>