More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_1431 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  55.95 
 
 		 652 aa  672    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  100 
 
 		 709 aa  1425    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  62.32 
 
 		 691 aa  855    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  62.89 
 
 		 691 aa  865    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  60.66 
 
 		 685 aa  813    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  53.1 
 
 		 685 aa  670    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  52.25 
 
 		 712 aa  684    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  47.11 
 
 		 654 aa  586  1e-166  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  50.89 
 
 		 680 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  39.64 
 
 		 757 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  40.29 
 
 		 760 aa  379  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  40.32 
 
 		 772 aa  382  1e-104  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  37.8 
 
 		 745 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  39.62 
 
 		 747 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  40.49 
 
 		 788 aa  372  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  39.3 
 
 		 746 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  41.75 
 
 		 747 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  37.5 
 
 		 735 aa  362  2e-98  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  37.03 
 
 		 749 aa  359  9.999999999999999e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  36.83 
 
 		 804 aa  353  5e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  40.93 
 
 		 747 aa  335  1e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  39.37 
 
 		 768 aa  335  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 		 723 aa  335  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  38.87 
 
 		 774 aa  330  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  39.2 
 
 		 776 aa  330  6e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  38.7 
 
 		 774 aa  329  9e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  33.73 
 
 		 686 aa  323  6e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  37.18 
 
 		 726 aa  310  5e-83  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  35.17 
 
 		 664 aa  279  1e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  34.98 
 
 		 677 aa  267  5.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  34.98 
 
 		 653 aa  265  2e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  36.89 
 
 		 680 aa  265  3e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  36.14 
 
 		 649 aa  255  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  34.42 
 
 		 679 aa  243  7e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  32.97 
 
 		 649 aa  236  1.0000000000000001e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  32.25 
 
 		 655 aa  233  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  33.39 
 
 		 672 aa  217  5e-55  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  32.29 
 
 		 682 aa  206  1e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  32.7 
 
 		 673 aa  192  2e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  33.84 
 
 		 716 aa  192  2.9999999999999997e-47  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  33.59 
 
 		 677 aa  162  3e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  32.52 
 
 		 616 aa  126  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  31.16 
 
 		 648 aa  123  9.999999999999999e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  33.44 
 
 		 669 aa  122  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  35.22 
 
 		 686 aa  120  6e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  32.66 
 
 		 645 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  34.11 
 
 		 628 aa  117  6.9999999999999995e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.8 
 
 		 645 aa  116  1.0000000000000001e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  30.87 
 
 		 593 aa  115  3e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  31.38 
 
 		 715 aa  114  5e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  29.5 
 
 		 643 aa  114  7.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  30.55 
 
 		 593 aa  113  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  33.44 
 
 		 652 aa  111  5e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  46.09 
 
 		 374 aa  111  6e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  30.61 
 
 		 637 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  31.35 
 
 		 648 aa  109  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  31.65 
 
 		 808 aa  110  1e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  43.24 
 
 		 638 aa  109  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  32.57 
 
 		 650 aa  108  3e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  26.85 
 
 		 735 aa  108  4e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  30.38 
 
 		 641 aa  106  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  30.69 
 
 		 649 aa  105  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  30.72 
 
 		 748 aa  105  4e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  43.04 
 
 		 641 aa  103  8e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 		 639 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 		 639 aa  103  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 		 639 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  43.04 
 
 		 644 aa  103  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  29.4 
 
 		 678 aa  103  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  33.54 
 
 		 750 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2105  lytic transglycosylase, catalytic  31.68 
 
 		 641 aa  103  2e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.828929  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  42.07 
 
 		 643 aa  103  2e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  33.78 
 
 		 640 aa  103  2e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  30.02 
 
 		 716 aa  102  2e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  40.49 
 
 		 690 aa  102  3e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  31.02 
 
 		 590 aa  102  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  40 
 
 		 643 aa  101  4e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  29.04 
 
 		 654 aa  101  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  30.79 
 
 		 663 aa  101  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  37.89 
 
 		 642 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  40.51 
 
 		 643 aa  101  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1892  Lytic transglycosylase catalytic  26.52 
 
 		 643 aa  101  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  37.89 
 
 		 650 aa  101  6e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  29.71 
 
 		 739 aa  100  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  32.33 
 
 		 657 aa  100  8e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  28.26 
 
 		 709 aa  100  8e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  44.12 
 
 		 660 aa  100  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  28.1 
 
 		 709 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  39.13 
 
 		 642 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  32.3 
 
 		 750 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  32.3 
 
 		 750 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  32.34 
 
 		 574 aa  100  1e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  30.79 
 
 		 677 aa  100  1e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  44.76 
 
 		 663 aa  100  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  33 
 
 		 661 aa  100  1e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  29.39 
 
 		 641 aa  100  1e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2273  lytic transglycosylase catalytic  31.02 
 
 		 641 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  28.71 
 
 		 641 aa  99.8  2e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2100  lytic transglycosylase catalytic  31.02 
 
 		 641 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.254828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2285  Lytic transglycosylase catalytic  31.02 
 
 		 641 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.014604  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>