More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0717 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 616 aa  1246    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  39.02 
 
 		 574 aa  332  2e-89  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  32.8 
 
 		 590 aa  223  6e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  33.57 
 
 		 592 aa  223  9e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1183  lytic transglycosylase, catalytic  34.55 
 
 		 588 aa  205  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.448186  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  34.28 
 
 		 608 aa  201  3.9999999999999996e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1286  Lytic transglycosylase catalytic  31.12 
 
 		 668 aa  180  4.999999999999999e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2165  lytic transglycosylase catalytic  39.45 
 
 		 499 aa  172  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0275906 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  34.39 
 
 		 808 aa  143  9.999999999999999e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  34.48 
 
 		 757 aa  139  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  33.14 
 
 		 726 aa  136  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  31.63 
 
 		 649 aa  136  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  32.98 
 
 		 788 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  35.1 
 
 		 682 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  32.27 
 
 		 760 aa  131  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  31.5 
 
 		 677 aa  131  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  33.6 
 
 		 685 aa  131  4.0000000000000003e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  32.38 
 
 		 664 aa  130  6e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  31.25 
 
 		 653 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  31.25 
 
 		 691 aa  128  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  32.1 
 
 		 691 aa  127  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  32.52 
 
 		 709 aa  127  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  31.83 
 
 		 680 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  29.66 
 
 		 776 aa  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  30.77 
 
 		 655 aa  123  9.999999999999999e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  31.98 
 
 		 804 aa  122  1.9999999999999998e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 649 aa  120  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  29.92 
 
 		 774 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  29.66 
 
 		 774 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  29.6 
 
 		 735 aa  118  3e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  30.64 
 
 		 747 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  31.92 
 
 		 680 aa  118  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  29.6 
 
 		 749 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1707  Lytic transglycosylase catalytic  32.46 
 
 		 782 aa  115  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  31.29 
 
 		 645 aa  115  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  30.18 
 
 		 672 aa  114  4.0000000000000004e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  32.96 
 
 		 677 aa  113  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  31.84 
 
 		 712 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  29.67 
 
 		 652 aa  111  4.0000000000000004e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  40.7 
 
 		 729 aa  111  4.0000000000000004e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  30.11 
 
 		 679 aa  110  6e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  29.51 
 
 		 685 aa  110  8.000000000000001e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1715  lytic transglycosylase, catalytic  33.04 
 
 		 603 aa  109  1e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  26.79 
 
 		 654 aa  108  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  30.37 
 
 		 654 aa  107  6e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  39.61 
 
 		 730 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  39.61 
 
 		 730 aa  107  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3076  lytic transglycosylase catalytic  31.18 
 
 		 777 aa  107  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.627553  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  41.96 
 
 		 669 aa  106  1e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2499  lytic transglycosylase  31.35 
 
 		 661 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  29.32 
 
 		 746 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 650 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  30.04 
 
 		 643 aa  104  4e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  38.92 
 
 		 833 aa  104  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1378  lytic transglycosylase, catalytic  31.68 
 
 		 661 aa  104  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.842597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  41.1 
 
 		 748 aa  104  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.25 
 
 		 638 aa  104  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  39.46 
 
 		 643 aa  103  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2261  lytic transglycosylase, catalytic  30.9 
 
 		 671 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0514362  hitchhiker  0.000191645 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  32.97 
 
 		 649 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  28.1 
 
 		 768 aa  102  2e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  30.18 
 
 		 747 aa  102  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.6 
 
 		 649 aa  102  2e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  29.9 
 
 		 686 aa  102  2e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  31 
 
 		 641 aa  102  3e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1484  soluble lytic murein transglycosylase, putative  29.65 
 
 		 747 aa  102  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.180895  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  37.04 
 
 		 644 aa  101  3e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2690  lytic transglycosylase catalytic  39.87 
 
 		 800 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  27.32 
 
 		 660 aa  102  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  31.03 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  40.71 
 
 		 648 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  36.94 
 
 		 643 aa  101  4e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  31.03 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  31.03 
 
 		 645 aa  101  4e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  29.18 
 
 		 745 aa  100  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  31.43 
 
 		 642 aa  100  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  31.03 
 
 		 645 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2854  Lytic transglycosylase catalytic  39.87 
 
 		 724 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  31.03 
 
 		 645 aa  100  6e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  31.03 
 
 		 645 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  31.03 
 
 		 645 aa  100  6e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  31.03 
 
 		 645 aa  100  6e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  31.03 
 
 		 645 aa  100  6e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  28.85 
 
 		 642 aa  100  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  28.85 
 
 		 642 aa  100  9e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  31.18 
 
 		 673 aa  100  1e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  35.98 
 
 		 639 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  38.37 
 
 		 731 aa  100  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  40 
 
 		 690 aa  99.8  1e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  29.06 
 
 		 747 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0817  lytic murein transglycosylase  35.98 
 
 		 639 aa  99.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  35.98 
 
 		 639 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4220  Lytic transglycosylase catalytic  40.52 
 
 		 735 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.11012 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  39.01 
 
 		 650 aa  99  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  28.76 
 
 		 649 aa  99  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  28.78 
 
 		 657 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 		 750 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  32.51 
 
 		 661 aa  98.2  3e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  38.93 
 
 		 750 aa  98.6  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  39.86 
 
 		 637 aa  98.2  4e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>