More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2642 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  83.8 
 
 		 685 aa  1187    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 712 aa  1443    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  51.85 
 
 		 654 aa  685    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  84.2 
 
 		 652 aa  1138    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  52.56 
 
 		 691 aa  707    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  55.95 
 
 		 709 aa  677    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  53.41 
 
 		 680 aa  669    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  54.93 
 
 		 685 aa  704    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  53.13 
 
 		 691 aa  697    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  39.64 
 
 		 788 aa  395  1e-108  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  40.7 
 
 		 760 aa  392  1e-107  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  37.84 
 
 		 757 aa  387  1e-106  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  40 
 
 		 772 aa  366  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  36.43 
 
 		 747 aa  361  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  37.83 
 
 		 746 aa  358  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  40.5 
 
 		 747 aa  356  1e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  37.32 
 
 		 745 aa  355  1e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  36.67 
 
 		 747 aa  351  2e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  36.45 
 
 		 735 aa  348  2e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  36.32 
 
 		 723 aa  347  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  36.34 
 
 		 749 aa  342  2e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  37.37 
 
 		 768 aa  339  8e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  37.11 
 
 		 804 aa  338  9.999999999999999e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  36.54 
 
 		 774 aa  333  5e-90  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  36.06 
 
 		 774 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  35.75 
 
 		 776 aa  333  9e-90  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  38.5 
 
 		 726 aa  315  9.999999999999999e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  33.55 
 
 		 686 aa  311  2e-83  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  35.29 
 
 		 664 aa  295  2e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  35.91 
 
 		 649 aa  272  2e-71  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  32.02 
 
 		 649 aa  250  7e-65  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  33.44 
 
 		 677 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  33.12 
 
 		 653 aa  246  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  33.28 
 
 		 655 aa  246  9.999999999999999e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  33.23 
 
 		 680 aa  241  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  30.05 
 
 		 672 aa  216  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  33.76 
 
 		 716 aa  215  2.9999999999999995e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  31.08 
 
 		 679 aa  206  1e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  29.82 
 
 		 673 aa  180  8e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  31.6 
 
 		 677 aa  175  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  36.09 
 
 		 682 aa  170  9e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  47.66 
 
 		 374 aa  125  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  31.19 
 
 		 593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  30.85 
 
 		 593 aa  120  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  33.11 
 
 		 657 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  28.4 
 
 		 808 aa  120  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  37.85 
 
 		 645 aa  118  3e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  33.11 
 
 		 657 aa  118  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  34.25 
 
 		 686 aa  117  7.999999999999999e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  34.85 
 
 		 690 aa  117  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  31.84 
 
 		 616 aa  113  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  41.67 
 
 		 659 aa  112  2.0000000000000002e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  32.58 
 
 		 706 aa  112  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  32.36 
 
 		 669 aa  112  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  42.11 
 
 		 678 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  41.18 
 
 		 660 aa  110  7.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  42.48 
 
 		 663 aa  110  8.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  32.09 
 
 		 650 aa  110  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  30.51 
 
 		 735 aa  110  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  30.56 
 
 		 655 aa  110  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  32.41 
 
 		 677 aa  110  1e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  29.69 
 
 		 653 aa  109  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  30 
 
 		 739 aa  108  4e-22  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  32.65 
 
 		 654 aa  108  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  31.42 
 
 		 650 aa  108  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  31.86 
 
 		 650 aa  107  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  42.22 
 
 		 660 aa  105  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  29.55 
 
 		 637 aa  105  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  39.46 
 
 		 650 aa  104  5e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  30.19 
 
 		 645 aa  104  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0652  lytic transglycosylase, catalytic  42.18 
 
 		 707 aa  104  5e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  28.05 
 
 		 663 aa  104  7e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  31.19 
 
 		 655 aa  104  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  39.19 
 
 		 642 aa  103  8e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  33.22 
 
 		 647 aa  103  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  42.25 
 
 		 628 aa  103  1e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  40.82 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  31.67 
 
 		 642 aa  103  1e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  29.59 
 
 		 655 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  29.59 
 
 		 657 aa  102  2e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  39.47 
 
 		 643 aa  102  2e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  44.36 
 
 		 638 aa  102  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1603  lytic transglycosylase  41.51 
 
 		 830 aa  102  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.807223  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  39.46 
 
 		 642 aa  101  4e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1377  lytic transglycosylase, catalytic  30.96 
 
 		 719 aa  101  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.010256 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  38.78 
 
 		 657 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  31 
 
 		 642 aa  101  5e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0992  Lytic transglycosylase catalytic  30.09 
 
 		 676 aa  101  5e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  41.55 
 
 		 640 aa  101  5e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  38.78 
 
 		 641 aa  101  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  39.02 
 
 		 748 aa  101  6e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  38.78 
 
 		 649 aa  101  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  31.86 
 
 		 652 aa  101  6e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 641 aa  101  6e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  30.45 
 
 		 716 aa  100  9e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0527  lytic transglycosylase, catalytic  40 
 
 		 693 aa  100  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.379018 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1059  Lytic transglycosylase catalytic  32.08 
 
 		 658 aa  100  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.210137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  30.84 
 
 		 715 aa  100  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  31.11 
 
 		 642 aa  100  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  29.69 
 
 		 648 aa  100  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>