More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1483 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  69.74 
 
 		 774 aa  924    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  71.45 
 
 		 776 aa  931    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  73.22 
 
 		 788 aa  941    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  69.45 
 
 		 774 aa  919    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 760 aa  1491    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  84.74 
 
 		 757 aa  1219    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  47.55 
 
 		 747 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  44.16 
 
 		 768 aa  531  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  44.24 
 
 		 746 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  42.84 
 
 		 735 aa  523  1e-147  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  46.97 
 
 		 745 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  45.48 
 
 		 749 aa  520  1e-146  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  45.94 
 
 		 747 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  46.4 
 
 		 723 aa  509  9.999999999999999e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  44.94 
 
 		 772 aa  489  1e-137  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  48.48 
 
 		 747 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  39.07 
 
 		 712 aa  404  1e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  37.91 
 
 		 804 aa  404  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  38.77 
 
 		 685 aa  403  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  38.96 
 
 		 652 aa  400  9.999999999999999e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  39.39 
 
 		 691 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  42.01 
 
 		 680 aa  402  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  40.57 
 
 		 685 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  39.11 
 
 		 691 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  40.29 
 
 		 709 aa  382  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  34.81 
 
 		 654 aa  372  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  35.2 
 
 		 686 aa  326  9e-88  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  38.1 
 
 		 726 aa  318  3e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  36.13 
 
 		 664 aa  317  4e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  36.97 
 
 		 677 aa  279  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  36.81 
 
 		 653 aa  277  6e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  35.86 
 
 		 680 aa  277  7e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  34.2 
 
 		 649 aa  266  1e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  34.65 
 
 		 679 aa  263  6.999999999999999e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  33.5 
 
 		 649 aa  262  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  34.55 
 
 		 655 aa  261  2e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  35.27 
 
 		 716 aa  238  4e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  31.08 
 
 		 672 aa  221  3e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  32.77 
 
 		 682 aa  219  2e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  29.95 
 
 		 673 aa  190  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  38.93 
 
 		 677 aa  187  6e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  27.58 
 
 		 808 aa  141  4.999999999999999e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  31.78 
 
 		 616 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1906  lytic transglycosylase  36.01 
 
 		 750 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  32.35 
 
 		 628 aa  120  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  33.18 
 
 		 590 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  35.39 
 
 		 748 aa  119  3e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  33.45 
 
 		 686 aa  118  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1973  Lytic transglycosylase catalytic  35.08 
 
 		 750 aa  118  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2058  Lytic transglycosylase catalytic  35.73 
 
 		 750 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.623161  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2239  Lytic transglycosylase catalytic  28.2 
 
 		 729 aa  115  3e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  31.37 
 
 		 652 aa  115  4.0000000000000004e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.47 
 
 		 638 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  33.76 
 
 		 654 aa  114  5e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2410  Lytic transglycosylase catalytic  31.1 
 
 		 730 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2602  lytic transglycosylase catalytic protein  41.51 
 
 		 709 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.178637  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2700  lytic transglycosylase, catalytic  30.72 
 
 		 715 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.232237  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1059  lytic transglycosylase, catalytic  33.79 
 
 		 608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3701  Lytic transglycosylase catalytic  30.79 
 
 		 730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.236251  normal  0.218254 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  43.85 
 
 		 374 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1624  Lytic transglycosylase catalytic  31.41 
 
 		 709 aa  112  3e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  29.63 
 
 		 663 aa  112  3e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  39.05 
 
 		 645 aa  112  3e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1953  lytic transglycosylase catalytic  31.28 
 
 		 756 aa  112  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.314899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1874  lytic transglycosylase, catalytic  32.25 
 
 		 706 aa  111  4.0000000000000004e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.331721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  31.73 
 
 		 690 aa  111  4.0000000000000004e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  31.43 
 
 		 739 aa  111  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4132  lytic transglycosylase, catalytic  30.85 
 
 		 642 aa  111  5e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  31.8 
 
 		 678 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  43.24 
 
 		 642 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  30.45 
 
 		 669 aa  110  1e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  41.67 
 
 		 643 aa  110  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  45.39 
 
 		 643 aa  110  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1311  lytic transglycosylase, catalytic  30 
 
 		 721 aa  110  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00111867  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 		 647 aa  109  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  45.38 
 
 		 650 aa  109  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1262  lytic transglycosylase catalytic  31.46 
 
 		 659 aa  108  3e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4203  lytic transglycosylase, catalytic  31.01 
 
 		 660 aa  108  4e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  41.84 
 
 		 642 aa  108  5e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3051  lytic transglycosylase, catalytic  29.94 
 
 		 731 aa  108  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  30.13 
 
 		 690 aa  108  5e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  30.74 
 
 		 655 aa  108  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  41.84 
 
 		 642 aa  108  5e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  42.57 
 
 		 642 aa  107  7e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1065  Lytic transglycosylase catalytic  30.36 
 
 		 698 aa  107  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  31.27 
 
 		 735 aa  107  8e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  36.09 
 
 		 645 aa  107  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  44.53 
 
 		 649 aa  107  1e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0293  lytic transglycosylase, catalytic  30.84 
 
 		 637 aa  107  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.598213  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  31.44 
 
 		 650 aa  107  1e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  30.17 
 
 		 574 aa  106  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  40.76 
 
 		 643 aa  107  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  31.44 
 
 		 650 aa  106  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1672  lytic transglycosylase catalytic  41.89 
 
 		 641 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.08863  normal  0.827941 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2130  soluble lytic transglycosylase, putative  41.89 
 
 		 657 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.224048 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  41.89 
 
 		 642 aa  105  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24441  soluble lytic transglycosylase  30.72 
 
 		 677 aa  105  2e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3610  lytic transglycosylase, catalytic  41.89 
 
 		 649 aa  106  2e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.184203 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3413  Lytic transglycosylase catalytic  32.7 
 
 		 661 aa  105  3e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.439727  normal  0.575026 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>