More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0672 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  63.98 
 
 		 691 aa  879    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  54.93 
 
 		 712 aa  704    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  57 
 
 		 652 aa  702    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  100 
 
 		 685 aa  1364    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  68.46 
 
 		 691 aa  880    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  60.61 
 
 		 709 aa  805    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  53.8 
 
 		 685 aa  704    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  52.65 
 
 		 680 aa  612  9.999999999999999e-175  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  46.3 
 
 		 654 aa  591  1e-167  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  40.39 
 
 		 757 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  41.93 
 
 		 760 aa  393  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  41.93 
 
 		 772 aa  373  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  40.79 
 
 		 788 aa  370  1e-101  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  39.06 
 
 		 747 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  39.43 
 
 		 746 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  41 
 
 		 749 aa  368  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  40.1 
 
 		 747 aa  363  5.0000000000000005e-99  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  38.28 
 
 		 735 aa  363  8e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  41.22 
 
 		 723 aa  361  3e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  40.64 
 
 		 745 aa  354  2.9999999999999997e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  36.3 
 
 		 804 aa  350  7e-95  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  37.92 
 
 		 776 aa  349  9e-95  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  37.67 
 
 		 768 aa  347  4e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  36.94 
 
 		 774 aa  342  9e-93  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  36.94 
 
 		 774 aa  342  1e-92  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  39.21 
 
 		 747 aa  332  1e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  37.31 
 
 		 726 aa  327  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  32.69 
 
 		 686 aa  309  1.0000000000000001e-82  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  35.21 
 
 		 664 aa  278  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  35.69 
 
 		 677 aa  268  2.9999999999999995e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  36.29 
 
 		 649 aa  263  4.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  35.02 
 
 		 653 aa  260  5.0000000000000005e-68  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  35.36 
 
 		 680 aa  251  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  35.54 
 
 		 679 aa  248  2e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  33.39 
 
 		 655 aa  248  4e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  34.27 
 
 		 672 aa  233  7.000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  31.96 
 
 		 649 aa  229  2e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  32.31 
 
 		 682 aa  209  1e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  32.41 
 
 		 716 aa  197  4.0000000000000005e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  31.44 
 
 		 673 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  30.15 
 
 		 677 aa  158  3e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  33.6 
 
 		 616 aa  130  6e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  34.91 
 
 		 686 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1778  LolC/E family lipoprotein releasing system, transmembrane protein  33.02 
 
 		 669 aa  129  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000296468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  46.88 
 
 		 374 aa  117  7.999999999999999e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0111  lytic transglycosylase catalytic  34.51 
 
 		 690 aa  115  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00506838 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0720  hypothetical protein  29.05 
 
 		 593 aa  113  9e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0700  hypothetical protein  28.75 
 
 		 593 aa  112  3e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0200  lytic transglycosylase, catalytic  29.17 
 
 		 637 aa  112  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0230  soluble lytic murein transglycosylase  32.65 
 
 		 648 aa  111  4.0000000000000004e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2125  lytic transglycosylase, catalytic  45.86 
 
 		 645 aa  111  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  44.06 
 
 		 638 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1135  lytic transglycosylase, catalytic  33.66 
 
 		 677 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.643084  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  31.8 
 
 		 663 aa  107  5e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  31.15 
 
 		 716 aa  106  1e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2362  SLT domain-containing protein  28.77 
 
 		 654 aa  106  1e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.292833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004401  soluble lytic murein transglycosylase precursor  32.25 
 
 		 645 aa  106  1e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  31.45 
 
 		 650 aa  105  2e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0525  Lytic transglycosylase catalytic  32.43 
 
 		 657 aa  105  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1999  lytic transglycosylase, catalytic  33.97 
 
 		 628 aa  105  3e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  32.26 
 
 		 590 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0509  lytic transglycosylase, catalytic  32.43 
 
 		 657 aa  104  5e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1765  soluble lytic murein transglycosylase  29.19 
 
 		 739 aa  104  6e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0716  soluble lytic murein transglycosylase precursor  33.77 
 
 		 649 aa  104  7e-21  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1715  Lytic transglycosylase catalytic  33.44 
 
 		 652 aa  103  8e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.728382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  30.84 
 
 		 653 aa  103  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2621  lytic transglycosylase catalytic  30.77 
 
 		 650 aa  103  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.327163  normal  0.230885 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0633  lytic transglycosylase catalytic  33.44 
 
 		 649 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.716649  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  37.58 
 
 		 650 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0564  lytic murein transglycosylase  42.11 
 
 		 643 aa  102  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  42.25 
 
 		 643 aa  102  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  41.96 
 
 		 660 aa  101  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0525  lytic murein transglycosylase  41.18 
 
 		 643 aa  101  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  31.87 
 
 		 678 aa  100  7e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 650 aa  100  8e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  41.55 
 
 		 649 aa  99.8  1e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  31.13 
 
 		 650 aa  100  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1648  lytic transglycosylase catalytic  29.58 
 
 		 642 aa  99.8  2e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.933829  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2138  putative soluble lytic transglycosylase  40.94 
 
 		 642 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00998  soluble lytic murein transglycosylase  31.65 
 
 		 648 aa  99.4  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2046  lytic transglycosylase, catalytic  30.17 
 
 		 735 aa  99.8  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.490447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25000  putative soluble lytic transglycosylase  40.94 
 
 		 642 aa  99  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.805924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2415  lytic transglycosylase catalytic  39.86 
 
 		 643 aa  99  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.853717  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0486  lytic transglycosylase catalytic  39.04 
 
 		 748 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.608773 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2347  lytic transglycosylase, catalytic  42.75 
 
 		 640 aa  98.6  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  30.5 
 
 		 655 aa  98.6  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0011  putative soluble lytic murein transglycosylase  31.19 
 
 		 643 aa  98.2  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.868574  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2131  soluble lytic transglycosylase  29.87 
 
 		 690 aa  98.6  4e-19  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  41.61 
 
 		 645 aa  98.2  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3871  lytic murein transglycosylase  41.45 
 
 		 644 aa  98.2  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.006684  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2641  lytic transglycosylase, catalytic  41.01 
 
 		 833 aa  97.8  5e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3677  lytic murein transglycosylase  41.45 
 
 		 641 aa  97.8  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.994757  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0675  lytic murein transglycosylase  38.85 
 
 		 642 aa  97.8  5e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.520462  normal  0.586863 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3522  soluble lytic murein transglycosylase, putative  37.58 
 
 		 642 aa  97.8  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3295  SLT  36.97 
 
 		 642 aa  97.4  7e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.505379  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0702  Lytic transglycosylase catalytic  29.3 
 
 		 647 aa  97.4  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0267  lytic transglycosylase, catalytic  33.75 
 
 		 574 aa  97.4  9e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  33.33 
 
 		 663 aa  96.7  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3613  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 		 639 aa  97.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3484  lytic murein transglycosylase  40.13 
 
 		 639 aa  97.1  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>