More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0881 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0881  putative soluble lytic transglycosylase  100 
 
 		 653 aa  1274    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0125  lytic transglycosylase, catalytic  87.2 
 
 		 680 aa  1017    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2541  lytic transglycosylase, catalytic  99.23 
 
 		 677 aa  1261    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00863759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0150  putative lytic transglycosylase catalytic  54.19 
 
 		 649 aa  579  1e-164  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.862262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0149  lytic transglycosylase, catalytic  47.62 
 
 		 655 aa  533  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0831767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0034  lytic transglycosylase, catalytic  47.39 
 
 		 649 aa  498  1e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0705  lytic transglycosylase, catalytic  49.21 
 
 		 716 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.451183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1866  lytic transglycosylase, catalytic  39.04 
 
 		 664 aa  379  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2861  lytic transglycosylase catalytic  39.56 
 
 		 804 aa  377  1e-103  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343372 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3087  lytic transglycosylase catalytic  37.19 
 
 		 726 aa  342  1e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.522258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1584  lytic transglycosylase, catalytic  35.02 
 
 		 686 aa  334  4e-90  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0407879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2890  lytic transglycosylase, catalytic  37.94 
 
 		 747 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00446727  normal  0.0355503 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3035  lytic transglycosylase, catalytic  37.77 
 
 		 747 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.155974  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4695  putative soluble lytic transglycosylase (SLT)  35.76 
 
 		 768 aa  320  7e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.122855 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1483  Lytic transglycosylase catalytic  36.74 
 
 		 760 aa  320  7e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2415  lytic transglycosylase, catalytic  37.31 
 
 		 746 aa  319  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  decreased coverage  0.00456435  normal  0.0304891 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2263  lytic transglycosylase, catalytic  36.81 
 
 		 749 aa  318  2e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.501845  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1889  lytic transglycosylase catalytic  38.07 
 
 		 788 aa  313  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00793651 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0698  lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 757 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.385758  normal  0.091894 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1930  lytic transglycosylase  36.99 
 
 		 735 aa  307  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.898731 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3190  lytic transglycosylase catalytic  38.05 
 
 		 774 aa  302  1e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3514  Lytic transglycosylase catalytic  38.22 
 
 		 774 aa  302  1e-80  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.293877 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3386  Lytic transglycosylase catalytic  38.38 
 
 		 776 aa  301  2e-80  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1431  soluble lytic transglycosylase  35.3 
 
 		 709 aa  300  6e-80  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0988  Lytic transglycosylase catalytic  36.67 
 
 		 691 aa  300  6e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.311649  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2697  Lytic transglycosylase catalytic  36.28 
 
 		 745 aa  298  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0570177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0672  lytic transglycosylase catalytic  37.23 
 
 		 685 aa  296  7e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.380192  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1141  Lytic transglycosylase catalytic  36.44 
 
 		 691 aa  295  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.486231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3828  lytic transglycosylase catalytic  35.91 
 
 		 772 aa  290  6e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0450856  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0643  transglycosylase SLT domain-containing protein  34.63 
 
 		 652 aa  284  3.0000000000000004e-75  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0638  soluble lytic murein transglycosylase  34.47 
 
 		 685 aa  283  8.000000000000001e-75  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.65587  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0940  lytic transglycosylase, catalytic  38.83 
 
 		 680 aa  277  4e-73  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.48603  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0462  transglycosylase  31.61 
 
 		 654 aa  273  9e-72  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.18202  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2642  lytic transglycosylase catalytic  33.28 
 
 		 712 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1732  lytic transglycosylase, catalytic  33.11 
 
 		 679 aa  265  1e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0596592 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1871  lytic transglycosylase catalytic  33.73 
 
 		 723 aa  256  1.0000000000000001e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.292946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0849  Lytic transglycosylase catalytic  35.17 
 
 		 747 aa  252  1e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.943706 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1442  lytic transglycosylase, catalytic  32.68 
 
 		 672 aa  251  2e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0518  lytic transglycosylase, catalytic  34.75 
 
 		 682 aa  250  6e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.936483 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0177  Lytic transglycosylase catalytic  34.65 
 
 		 673 aa  228  2e-58  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0429292  normal  0.082648 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1909  lytic transglycosylase, catalytic  38.34 
 
 		 677 aa  201  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.442257  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0717  lytic transglycosylase catalytic  31.42 
 
 		 616 aa  138  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4098  lytic transglycosylase, catalytic  31.52 
 
 		 590 aa  135  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1779  lytic transglycosylase, catalytic  31.91 
 
 		 592 aa  133  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.856574  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0924  lytic transglycosylase, catalytic  29.59 
 
 		 663 aa  129  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1070  Lytic transglycosylase catalytic  33.33 
 
 		 716 aa  129  3e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0624  lytic transglycosylase, catalytic  26.44 
 
 		 808 aa  125  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3662  Lytic transglycosylase catalytic  34.65 
 
 		 650 aa  122  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.874549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3295  putative transglycosylase  32.91 
 
 		 678 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.193265  normal  0.142457 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2691  lytic transglycosylase, catalytic  28.09 
 
 		 798 aa  121  4.9999999999999996e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.463338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2900  lytic transglycosylase catalytic  34.98 
 
 		 657 aa  120  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.152678 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3738  Lytic transglycosylase catalytic  34.02 
 
 		 655 aa  120  7e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0927783  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0198  transglycosylase  34.36 
 
 		 655 aa  120  7e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0176  lytic transglycosylase, catalytic  32.08 
 
 		 655 aa  120  7e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.364255 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04268  lytic murein transglycosylase, soluble  32.19 
 
 		 645 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04233  hypothetical protein  32.19 
 
 		 645 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3664  lytic murein transglycosylase  32.19 
 
 		 645 aa  120  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3339  Lytic transglycosylase catalytic  33.99 
 
 		 650 aa  119  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0088  soluble lytic murein transglycosylase precursor transmembrane protein  33.22 
 
 		 650 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14150  soluble lytic murein transglycosylase  32.35 
 
 		 643 aa  118  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1895  soluble lytic murein transglycosylase, putative  43.24 
 
 		 638 aa  117  5e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88018  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3605  Lytic transglycosylase catalytic  31.85 
 
 		 645 aa  117  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5907  lytic murein transglycosylase  31.85 
 
 		 645 aa  117  6e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4940  lytic murein transglycosylase  31.85 
 
 		 645 aa  117  6e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4991  lytic murein transglycosylase  31.85 
 
 		 645 aa  117  6e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4628  lytic murein transglycosylase  31.85 
 
 		 645 aa  117  6e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4943  lytic murein transglycosylase  31.85 
 
 		 645 aa  117  6e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.996707 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2945  lytic transglycosylase catalytic  33.89 
 
 		 650 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.78067  normal  0.502179 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0214  lytic transglycosylase, catalytic  44.44 
 
 		 374 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3079  lytic transglycosylase, catalytic  33.89 
 
 		 650 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0553  lytic murein transglycosylase  32.45 
 
 		 645 aa  115  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3029  lytic transglycosylase catalytic  33.89 
 
 		 650 aa  115  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.710191  normal  0.361985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2040  soluble lytic murein transglycosylase, putative  45.45 
 
 		 641 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1979  lytic transglycosylase, catalytic  44.7 
 
 		 649 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.99613 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1473  lytic transglycosylase, catalytic  34.3 
 
 		 663 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.985261  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2529  lytic transglycosylase, catalytic  29.57 
 
 		 642 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4906  lytic murein transglycosylase  32.08 
 
 		 645 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0376  Lytic transglycosylase catalytic  32.34 
 
 		 730 aa  112  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15183 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6381  lytic transglycosylase, catalytic  33.11 
 
 		 607 aa  111  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2373  Lytic transglycosylase catalytic  33.79 
 
 		 686 aa  112  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.399267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2420  lytic transglycosylase, catalytic  33.78 
 
 		 650 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2111  lytic transglycosylase, catalytic  44.22 
 
 		 641 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.396511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1863  lytic transglycosylase, catalytic  44.22 
 
 		 641 aa  112  3e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.646597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3034  lytic transglycosylase, catalytic  33.78 
 
 		 650 aa  112  3e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2108  putative lytic murein transglycosylase  34.34 
 
 		 651 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4994  lytic murein transglycosylase  31.74 
 
 		 645 aa  111  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2984  putative lytic murein transglycosylase  34.34 
 
 		 651 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.270933  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3314  lytic murein transglycosylase, putative  34.34 
 
 		 651 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0219  lytic transglycosylase, catalytic  31.79 
 
 		 653 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3053  lytic transglycosylase catalytic  33.78 
 
 		 650 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0364649 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0453  soluble lytic murein transglycosylase  34.34 
 
 		 651 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1575  lytic transglycosylase, catalytic  31.23 
 
 		 660 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.642421 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0269  Slt family transglycosylase  34.34 
 
 		 651 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3364  putative lytic murein transglycosylase  34.34 
 
 		 651 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0257  Slt family transglycosylase  34.34 
 
 		 651 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4940  lytic murein transglycosylase  31.74 
 
 		 645 aa  110  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.183926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4992  lytic murein transglycosylase  31.74 
 
 		 645 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.971097 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4833  lytic murein transglycosylase  31.74 
 
 		 645 aa  110  7.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2236  lytic transglycosylase, catalytic  42.86 
 
 		 641 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0654901  normal  0.264875 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3883  lytic transglycosylase, catalytic  30.59 
 
 		 650 aa  110  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.320153 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>